MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 chromosome

Total Repeats: 6892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017262	GCAAA	2	10	213	222	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017262	GTA	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017262	AAG	2	6	260	265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017262	T	7	7	1733	1739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017262	CTTT	2	8	1782	1789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017262	ACCA	2	8	1800	1807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017262	CT	3	6	3782	3787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017262	TATTT	2	10	3860	3869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017262	T	7	7	3867	3873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017262	CTAA	2	8	3880	3887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017262	ACT	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017262	ACAAA	2	10	3898	3907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017262	GAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017262	TG	3	6	4028	4033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017262	CGCT	2	8	4041	4048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017262	TTGA	2	8	4084	4091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017262	CAA	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017262	A	7	7	5222	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017262	T	7	7	5250	5256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017262	ATG	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017262	CAA	2	6	5970	5975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017262	TCA	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017262	A	6	6	6083	6088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017262	CCT	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017262	CAA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017262	ATTG	2	8	6906	6913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017262	A	6	6	6916	6921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017262	T	6	6	6948	6953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017262	A	6	6	7993	7998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017262	GTCC	2	8	8772	8779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017262	TCCGAA	2	12	8810	8821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017262	CATA	2	8	9747	9754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017262	AAG	2	6	10790	10795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017262	TCAA	2	8	11827	11834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017262	AATA	2	8	14472	14479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017262	CAA	2	6	14486	14491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017262	A	6	6	14490	14495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017262	T	6	6	14516	14521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017262	AAT	2	6	14569	14574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017262	GAT	2	6	15443	15448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017262	A	6	6	15548	15553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017262	ATCT	2	8	15567	15574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017262	A	6	6	15617	15622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017262	A	6	6	15624	15629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017262	GAA	2	6	15639	15644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017262	CTT	2	6	15656	15661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017262	TGG	2	6	15835	15840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017262	A	6	6	15848	15853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017262	A	7	7	15942	15948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017262	AT	3	6	16027	16032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017262	T	7	7	16241	16247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017262	A	8	8	16249	16256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017262	A	7	7	16260	16266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017262	CCG	2	6	16286	16291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017262	TGT	2	6	17273	17278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017262	GCGAAA	2	12	17289	17300	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017262	A	6	6	17319	17324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017262	TAA	2	6	17325	17330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017262	GAC	2	6	17513	17518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017262	T	6	6	17537	17542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017262	TCC	2	6	17567	17572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017262	TGT	2	6	20306	20311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017262	AGA	2	6	20328	20333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017262	ATA	2	6	20344	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017262	TA	3	6	20348	20353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017262	ATA	2	6	20357	20362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017262	AT	3	6	20366	20371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017262	CAA	2	6	22079	22084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017262	CTT	2	6	22086	22091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017262	TCT	2	6	22179	22184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017262	AAGG	2	8	22310	22317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017262	ACA	2	6	22990	22995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017262	ATC	2	6	23174	23179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017262	AAT	2	6	23201	23206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017262	AT	3	6	23285	23290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017262	A	8	8	23292	23299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017262	A	6	6	23349	23354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017262	CAGC	2	8	23355	23362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017262	ATA	2	6	23407	23412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017262	TTTC	2	8	23455	23462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017262	TCT	3	9	23499	23507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017262	A	6	6	23540	23545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017262	TGCC	2	8	23566	23573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017262	TCT	2	6	23584	23589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017262	ATAG	2	8	23615	23622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017262	A	7	7	23628	23634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017262	TGACG	2	10	26585	26594	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017262	GTC	2	6	26597	26602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017262	TTTC	2	8	26663	26670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017262	A	6	6	26704	26709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017262	AT	3	6	26715	26720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017262	T	6	6	26786	26791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017262	TCT	2	6	26815	26820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017262	A	6	6	28471	28476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017262	T	7	7	33165	33171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017262	ATTT	2	8	33202	33209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017262	AAC	2	6	33218	33223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017262	A	6	6	33234	33239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017262	ATAA	2	8	33246	33253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017262	AAAGC	2	10	33278	33287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017262	TA	3	6	33296	33301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017262	TGT	2	6	34850	34855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017262	TCA	2	6	36155	36160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017262	CAT	2	6	36203	36208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017262	TAATTT	2	12	36918	36929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017262	T	6	6	36927	36932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017262	T	7	7	37009	37015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017262	TGT	2	6	37085	37090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017262	GAG	2	6	37129	37134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017262	TGA	2	6	37180	37185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017262	TCA	3	9	37222	37230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017262	GCAA	2	8	37244	37251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017262	GAA	2	6	37286	37291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017262	CTTTG	2	10	37299	37308	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017262	ATT	2	6	37315	37320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017262	GCA	2	6	37329	37334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017262	AG	3	6	40326	40331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017262	TGAAAA	2	12	44571	44582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017262	T	6	6	44587	44592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017262	TCT	2	6	44632	44637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017262	A	6	6	47011	47016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017262	GGC	2	6	47041	47046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017262	CT	3	6	47049	47054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017262	A	6	6	47208	47213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017262	TTA	2	6	47233	47238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017262	ATCA	2	8	47256	47263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017262	ATT	2	6	47273	47278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017262	TGA	2	6	47296	47301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017262	TCG	2	6	49322	49327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017262	A	6	6	49369	49374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017262	GGC	2	6	49375	49380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017262	A	6	6	50924	50929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017262	CCT	2	6	50932	50937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017262	A	6	6	50969	50974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017262	CGG	2	6	50990	50995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017262	CAG	2	6	51122	51127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017262	TGAA	2	8	52032	52039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017262	CAA	3	9	52090	52098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017262	TTA	2	6	52406	52411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017262	AT	4	8	52456	52463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017262	CTGA	2	8	53040	53047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017262	CT	3	6	53938	53943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017262	T	6	6	54000	54005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017262	ATC	2	6	54030	54035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017262	TC	4	8	54034	54041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017262	ATT	2	6	54727	54732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017262	T	6	6	54731	54736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017262	TCA	2	6	54741	54746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017262	ATA	2	6	54903	54908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017262	CCG	2	6	54913	54918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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152	NC_017262	CGA	2	6	55100	55105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017262	ATA	2	6	55118	55123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017262	CCA	2	6	55141	55146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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436	NC_017262	A	6	6	102107	102112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017262	T	6	6	102124	102129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_017262	ACC	2	6	102169	102174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_017262	CTT	2	6	104316	104321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_017262	TTG	2	6	104322	104327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017262	AAC	2	6	104354	104359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_017262	CTT	2	6	105440	105445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_017262	A	6	6	105526	105531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017262	CAT	2	6	106663	106668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_017262	A	6	6	106691	106696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017262	T	6	6	107880	107885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017262	AAT	2	6	107912	107917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017262	TAT	2	6	107926	107931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017262	ATGT	2	8	108028	108035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_017262	AT	3	6	108074	108079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_017262	CAA	2	6	108080	108085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_017262	TA	4	8	109310	109317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017262	TA	4	8	109332	109339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017262	CTG	2	6	109947	109952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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485	NC_017262	AT	3	6	112015	112020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_017262	AAG	2	6	113461	113466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017262	ATA	2	6	114826	114831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_017262	A	7	7	114904	114910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017262	T	8	8	118809	118816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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