MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 plasmid pCD

Total Repeats: 891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017263	CT	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_017263	CGC	2	6	31973	31978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_017263	GCT	2	6	31986	31991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017263	TCA	2	6	32035	32040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017263	CTT	2	6	32053	32058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017263	TGT	2	6	32107	32112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017263	ATG	2	6	32133	32138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017263	ACCC	2	8	32233	32240	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
509	NC_017263	GAA	2	6	32242	32247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017263	GC	3	6	32258	32263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_017263	TCG	2	6	32313	32318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017263	ACT	2	6	32349	32354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017263	GCAGA	2	10	32390	32399	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
514	NC_017263	T	7	7	32456	32462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017263	GGC	2	6	32488	32493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017263	TGT	2	6	32515	32520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017263	GTG	2	6	32541	32546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017263	A	7	7	32567	32573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017263	GTT	2	6	32648	32653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017263	AT	3	6	32836	32841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017263	CGT	2	6	32921	32926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017263	TCA	2	6	32932	32937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017263	TCA	2	6	32978	32983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017263	GTG	2	6	32984	32989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017263	AGA	3	9	33106	33114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017263	TCG	2	6	33171	33176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017263	ACA	2	6	33253	33258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017263	TTG	2	6	33320	33325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017263	CAA	2	6	33428	33433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017263	AT	3	6	33454	33459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017263	AT	3	6	33476	33481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017263	T	8	8	33559	33566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017263	ATA	2	6	33578	33583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017263	TGTT	2	8	33608	33615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017263	T	7	7	33644	33650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017263	GAAA	2	8	33653	33660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017263	TAAAT	2	10	33704	33713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017263	GTG	2	6	33720	33725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017263	GTT	2	6	33751	33756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017263	AAT	2	6	33764	33769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017263	CAC	2	6	33776	33781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_017263	ATC	2	6	33805	33810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017263	TCT	2	6	33817	33822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017263	TG	3	6	33824	33829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017263	AG	3	6	33836	33841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017263	TAT	2	6	34252	34257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017263	TTGGTT	2	12	34259	34270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017263	CGCA	2	8	34293	34300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017263	TAA	2	6	34301	34306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017263	AT	3	6	34329	34334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017263	T	8	8	35196	35203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017263	ATC	2	6	35427	35432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017263	GGT	2	6	35445	35450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017263	T	7	7	35469	35475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017263	TTAT	2	8	35535	35542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017263	TA	4	8	35564	35571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017263	T	6	6	36026	36031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017263	GTTACT	2	12	36053	36064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
559	NC_017263	TTATGT	2	12	36110	36121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017263	TTA	2	6	36147	36152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017263	ATG	2	6	36172	36177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017263	GTA	2	6	36186	36191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017263	TTTGG	2	10	36278	36287	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017263	ATG	2	6	36292	36297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017263	CGTCT	2	10	36334	36343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
566	NC_017263	TGGC	2	8	36419	36426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017263	TCC	2	6	36464	36469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_017263	AAC	2	6	36511	36516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017263	A	6	6	36535	36540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017263	AGCG	2	8	36584	36591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017263	TGA	2	6	36611	36616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017263	GCT	2	6	36624	36629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017263	CAA	2	6	36677	36682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017263	ATA	2	6	36770	36775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017263	CAA	2	6	36934	36939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017263	TCA	2	6	36940	36945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017263	GGT	2	6	36946	36951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017263	AAC	2	6	36958	36963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017263	TGAT	2	8	37008	37015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017263	GTT	2	6	37079	37084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017263	TGAT	2	8	37125	37132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017263	AAG	2	6	37167	37172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017263	CTGAA	2	10	37176	37185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
584	NC_017263	TGC	2	6	37206	37211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017263	TCGC	2	8	37350	37357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
586	NC_017263	ATT	2	6	37379	37384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017263	GGT	2	6	37385	37390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017263	CCG	2	6	37468	37473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017263	GTACG	2	10	37494	37503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
590	NC_017263	ATC	2	6	37511	37516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017263	ATT	2	6	37526	37531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017263	CAT	2	6	37547	37552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017263	TGA	2	6	37600	37605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017263	TTA	2	6	37637	37642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017263	AAG	2	6	37677	37682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017263	ATC	2	6	37711	37716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017263	GT	3	6	37795	37800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017263	GTG	2	6	37862	37867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017263	TTCT	2	8	37931	37938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_017263	GAA	2	6	37981	37986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017263	CTA	2	6	38017	38022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017263	AAG	2	6	38024	38029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017263	CTT	2	6	38053	38058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017263	CG	3	6	38059	38064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_017263	T	6	6	38085	38090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017263	TTCT	2	8	38207	38214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_017263	TTG	2	6	38218	38223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017263	T	6	6	38232	38237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017263	GCT	2	6	38241	38246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017263	TTG	2	6	38288	38293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017263	AAG	2	6	38297	38302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017263	CTG	2	6	38321	38326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017263	A	6	6	38356	38361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017263	TTA	2	6	38377	38382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017263	CATTC	2	10	38445	38454	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
616	NC_017263	GCA	2	6	38468	38473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017263	GAA	2	6	38476	38481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017263	A	6	6	38603	38608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017263	CTG	2	6	38617	38622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017263	GCT	2	6	38640	38645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017263	AAAGT	2	10	38654	38663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017263	ATG	2	6	38780	38785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017263	ACA	2	6	38811	38816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017263	G	6	6	38869	38874	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017263	ATG	2	6	38885	38890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017263	ATC	2	6	38951	38956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017263	ACTA	2	8	39152	39159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_017263	A	6	6	39165	39170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017263	ATG	2	6	39174	39179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017263	GGT	2	6	39183	39188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017263	AG	3	6	39214	39219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017263	ATT	2	6	39249	39254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017263	GAA	2	6	39613	39618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017263	ATTGC	2	10	39623	39632	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
635	NC_017263	GAA	2	6	39655	39660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017263	TGA	2	6	39692	39697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017263	CAA	2	6	39724	39729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017263	AAAT	2	8	39732	39739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017263	GAATG	2	10	39864	39873	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017263	GCA	2	6	40043	40048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_017263	CCT	2	6	40065	40070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_017263	TGT	2	6	40148	40153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_017263	GCA	2	6	40190	40195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_017263	TTAT	2	8	40283	40290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_017263	ATT	2	6	41819	41824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_017263	TA	3	6	43295	43300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_017263	TAA	2	6	43601	43606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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735	NC_017263	T	6	6	49625	49630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_017263	TAC	2	6	51126	51131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
763	NC_017263	GT	3	6	51251	51256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
764	NC_017263	AAC	2	6	51260	51265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
765	NC_017263	CATC	2	8	51281	51288	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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772	NC_017263	GT	3	6	51674	51679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
773	NC_017263	AG	3	6	51749	51754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
774	NC_017263	TCC	2	6	51813	51818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
775	NC_017263	AT	3	6	52443	52448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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777	NC_017263	TTG	2	6	53010	53015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
778	NC_017263	GGC	2	6	53027	53032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_017263	TGT	2	6	53119	53124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
780	NC_017263	TGC	2	6	53397	53402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_017263	GTC	2	6	53424	53429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
782	NC_017263	CGC	2	6	53503	53508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
783	NC_017263	CCGGTT	2	12	53725	53736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
784	NC_017263	CCAATC	2	12	53749	53760	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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786	NC_017263	ACA	2	6	53946	53951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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806	NC_017263	CACT	2	8	55674	55681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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