MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 plasmid unnamed

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017170	CAG	2	6	23	28	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017170	ATG	2	6	35	40	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017170	TGC	2	6	56	61	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017170	TGTA	2	8	86	93	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017170	T	8	8	132	139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017170	ATT	2	6	177	182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017170	ATTT	2	8	190	197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017170	ATT	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017170	A	8	8	1778	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017170	A	8	8	1795	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017170	TAA	2	6	1836	1841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017170	CGC	2	6	1847	1852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017170	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017170	GAC	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017170	ATT	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017170	ATT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017170	ATA	2	6	2492	2497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017170	AG	3	6	2513	2518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017170	TC	3	6	3487	3492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017170	TCC	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017170	GGA	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017170	AGG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017170	TG	3	6	3559	3564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017170	TGT	2	6	3605	3610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017170	CAC	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017170	ACAG	2	8	4439	4446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017170	CAA	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017170	CCG	2	6	4476	4481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017170	ACGA	2	8	4536	4543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017170	TGCC	2	8	4546	4553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017170	T	6	6	4574	4579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017170	TGG	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017170	TCAGAC	2	12	4719	4730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017170	CAG	2	6	4736	4741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017170	CTGT	2	8	4819	4826	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017170	CAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017170	TGC	2	6	4942	4947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017170	A	8	8	4948	4955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017170	AAT	2	6	5059	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017170	ACAA	2	8	5076	5083	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017170	T	6	6	5090	5095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017170	T	7	7	5103	5109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017170	TGG	2	6	7393	7398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017170	CGT	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017170	TGA	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017170	T	6	6	7495	7500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017170	CAG	2	6	7576	7581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017170	ACA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017170	A	6	6	7612	7617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017170	AC	3	6	7691	7696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017170	GAT	2	6	7721	7726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017170	T	6	6	7853	7858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017170	GTT	2	6	7861	7866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017170	T	6	6	7865	7870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017170	GTC	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017170	GACGG	2	10	7983	7992	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017170	A	6	6	8006	8011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017170	TGT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017170	TCAG	2	8	8024	8031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017170	ACAG	2	8	8039	8046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017170	T	7	7	8132	8138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017170	T	6	6	8185	8190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017170	TAC	2	6	8201	8206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017170	A	7	7	8226	8232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017170	AAT	2	6	8279	8284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017170	AACA	2	8	8408	8415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017170	ACA	3	9	8413	8421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.