MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017168	TGC	2	6	1037030	1037035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017168	GCT	2	6	1039085	1039090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017168	ATT	2	6	1039181	1039186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017168	AAAT	2	8	1039188	1039195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017168	TAA	2	6	1039333	1039338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017168	A	6	6	1039337	1039342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017168	AATA	2	8	1039345	1039352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017168	CT	3	6	1039355	1039360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_017168	ATATT	2	10	1039379	1039388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017168	CCT	2	6	1039427	1039432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_017168	T	6	6	1039447	1039452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017168	TAT	2	6	1039465	1039470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017168	TAA	2	6	1039474	1039479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017168	CCT	2	6	1042859	1042864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_017168	TA	3	6	1042887	1042892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017168	A	6	6	1042895	1042900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017168	AAATC	2	10	1043366	1043375	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3518	NC_017168	GCC	2	6	1043400	1043405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_017168	TCA	2	6	1043456	1043461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_017168	CTG	2	6	1043492	1043497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_017168	GTA	2	6	1043540	1043545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017168	AATA	2	8	1043602	1043609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017168	CAC	2	6	1044339	1044344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_017168	AG	3	6	1044401	1044406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017168	A	6	6	1046154	1046159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017168	GCC	2	6	1046172	1046177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_017168	TTA	2	6	1046217	1046222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017168	AG	3	6	1046891	1046896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017168	TTA	2	6	1046968	1046973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017168	TCTCC	2	10	1047638	1047647	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3531	NC_017168	TAA	2	6	1047667	1047672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017168	A	7	7	1047765	1047771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017168	TAA	2	6	1047789	1047794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017168	C	6	6	1048606	1048611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3535	NC_017168	TCTTT	2	10	1048613	1048622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3536	NC_017168	A	6	6	1049530	1049535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017168	ATG	2	6	1049589	1049594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017168	ATT	2	6	1049612	1049617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017168	TGA	2	6	1049712	1049717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017168	T	7	7	1049759	1049765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017168	TAAA	2	8	1049769	1049776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017168	AATG	2	8	1049780	1049787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017168	TAAC	2	8	1049807	1049814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_017168	AGG	2	6	1050534	1050539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017168	CCT	2	6	1052249	1052254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_017168	TGC	2	6	1052347	1052352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_017168	TGT	2	6	1052431	1052436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017168	TA	3	6	1052496	1052501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017168	CGAG	2	8	1052534	1052541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_017168	GCT	2	6	1052580	1052585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_017168	CTG	2	6	1052590	1052595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017168	AAG	2	6	1052608	1052613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017168	A	6	6	1058531	1058536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017168	TCA	2	6	1058574	1058579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_017168	TCAT	2	8	1058589	1058596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_017168	CTG	2	6	1058607	1058612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_017168	ACTC	2	8	1058626	1058633	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_017168	TAAC	2	8	1058835	1058842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_017168	GCA	2	6	1058856	1058861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_017168	ATA	2	6	1060240	1060245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017168	GGTC	2	8	1061737	1061744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_017168	ATG	2	6	1061749	1061754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017168	T	8	8	1061762	1061769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017168	TAA	2	6	1063627	1063632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017168	GCA	2	6	1063655	1063660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_017168	TC	3	6	1064634	1064639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_017168	TTA	2	6	1064677	1064682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017168	CGA	2	6	1064715	1064720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_017168	TCAC	2	8	1064749	1064756	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_017168	AGG	2	6	1064774	1064779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017168	C	7	7	1064783	1064789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3572	NC_017168	AACG	2	8	1064812	1064819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_017168	TGG	2	6	1066721	1066726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017168	CGT	2	6	1066752	1066757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_017168	TC	3	6	1068104	1068109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_017168	AGGGAG	2	12	1068843	1068854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017168	AGG	2	6	1068859	1068864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_017168	CAGG	2	8	1068868	1068875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_017168	ATA	2	6	1068880	1068885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_017168	T	6	6	1068886	1068891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017168	A	7	7	1068903	1068909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017168	TGCAGC	2	12	1068952	1068963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_017168	TA	3	6	1068988	1068993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017168	AGG	2	6	1069047	1069052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017168	CAA	2	6	1069089	1069094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_017168	AGA	2	6	1069100	1069105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_017168	T	6	6	1070934	1070939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017168	GC	3	6	1070960	1070965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_017168	AAC	2	6	1071019	1071024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_017168	CGG	2	6	1071029	1071034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_017168	CAG	2	6	1071163	1071168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_017168	G	6	6	1071191	1071196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017168	TCGC	2	8	1071270	1071277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_017168	TGA	2	6	1071334	1071339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017168	GGC	2	6	1071347	1071352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_017168	T	6	6	1071385	1071390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017168	AC	3	6	1071438	1071443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_017168	ACG	3	9	1071456	1071464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_017168	GCGA	2	8	1072936	1072943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3600	NC_017168	AGC	2	6	1072945	1072950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_017168	AC	3	6	1072953	1072958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_017168	GTT	2	6	1072980	1072985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017168	T	6	6	1073020	1073025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017168	TTTTCG	2	12	1073032	1073043	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3605	NC_017168	TCA	2	6	1073044	1073049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_017168	TGT	2	6	1077105	1077110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017168	GCC	2	6	1077154	1077159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_017168	TAA	2	6	1077170	1077175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017168	AGT	2	6	1077195	1077200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017168	ACC	2	6	1077216	1077221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_017168	TA	3	6	1077837	1077842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017168	GCC	2	6	1077886	1077891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_017168	AGAA	2	8	1077941	1077948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017168	GAAA	2	8	1077951	1077958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017168	A	6	6	1077956	1077961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017168	GGC	2	6	1077962	1077967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_017168	T	6	6	1077984	1077989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017168	CCT	2	6	1078056	1078061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_017168	CAA	2	6	1078302	1078307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017168	AG	3	6	1078326	1078331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017168	ATA	2	6	1078338	1078343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017168	T	6	6	1078349	1078354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017168	CGC	2	6	1078396	1078401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_017168	CGA	2	6	1078412	1078417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_017168	T	6	6	1078480	1078485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017168	TA	3	6	1078511	1078516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017168	GAC	2	6	1078533	1078538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3629	NC_017168	GAT	2	6	1079225	1079230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_017168	TGA	2	6	1079282	1079287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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