MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_017168	TTA	2	6	4540043	4540048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_017168	T	6	6	4540752	4540757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16503	NC_017168	AGA	2	6	4540767	4540772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16504	NC_017168	GA	4	8	4540809	4540816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_017168	TGA	2	6	4540902	4540907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_017168	A	6	6	4540915	4540920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16507	NC_017168	CGG	2	6	4542474	4542479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_017168	CTT	2	6	4542553	4542558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16509	NC_017168	CGG	2	6	4546989	4546994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_017168	TTA	2	6	4547024	4547029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16511	NC_017168	GTCA	2	8	4547094	4547101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16512	NC_017168	TAC	2	6	4547126	4547131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16513	NC_017168	AAT	2	6	4547150	4547155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16514	NC_017168	AGA	2	6	4547255	4547260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_017168	GA	3	6	4547259	4547264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_017168	CTG	2	6	4547335	4547340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_017168	TGG	2	6	4549975	4549980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_017168	G	6	6	4549987	4549992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16519	NC_017168	GTG	2	6	4550037	4550042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_017168	TCGGT	2	10	4550044	4550053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16521	NC_017168	TCGGT	2	10	4550056	4550065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16522	NC_017168	TCGGT	2	10	4550068	4550077	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16523	NC_017168	CA	3	6	4550964	4550969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16524	NC_017168	CTG	2	6	4550991	4550996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16525	NC_017168	GAACC	2	10	4551526	4551535	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16526	NC_017168	ATA	2	6	4551712	4551717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_017168	TA	3	6	4551716	4551721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_017168	GGC	2	6	4551747	4551752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16529	NC_017168	GCC	2	6	4553253	4553258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16530	NC_017168	TTAA	2	8	4553288	4553295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_017168	GTA	2	6	4553303	4553308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_017168	ATT	2	6	4553411	4553416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_017168	TGA	2	6	4553423	4553428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16534	NC_017168	AAC	2	6	4553465	4553470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16535	NC_017168	CTAT	2	8	4553472	4553479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16536	NC_017168	AAC	2	6	4553483	4553488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16537	NC_017168	AGT	2	6	4553493	4553498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16538	NC_017168	GC	3	6	4553576	4553581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16539	NC_017168	GGT	2	6	4553593	4553598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_017168	ACT	2	6	4553659	4553664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16541	NC_017168	TTG	2	6	4553728	4553733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.