MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017168	TCTAC	2	10	4256750	4256759	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15502	NC_017168	ATA	2	6	4256760	4256765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_017168	AAT	2	6	4257258	4257263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_017168	GTC	2	6	4257275	4257280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_017168	TAA	2	6	4257325	4257330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_017168	TAA	2	6	4257342	4257347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_017168	A	7	7	4257380	4257386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_017168	TGC	2	6	4257441	4257446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15509	NC_017168	CT	3	6	4257478	4257483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15510	NC_017168	ATT	2	6	4257539	4257544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_017168	ATC	2	6	4257607	4257612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_017168	TGGCA	2	10	4257625	4257634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15513	NC_017168	AAC	2	6	4258973	4258978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_017168	GAT	2	6	4258987	4258992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_017168	CAC	2	6	4259056	4259061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15516	NC_017168	TG	3	6	4259065	4259070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_017168	ATG	2	6	4262608	4262613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_017168	ATTT	2	8	4262660	4262667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_017168	GCT	2	6	4263399	4263404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_017168	ACA	2	6	4263415	4263420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_017168	TCA	2	6	4263423	4263428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15522	NC_017168	TAT	2	6	4263453	4263458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_017168	TGG	2	6	4265928	4265933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_017168	AGCC	2	8	4265936	4265943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15525	NC_017168	TA	3	6	4266869	4266874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_017168	AAT	2	6	4266879	4266884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_017168	ATG	2	6	4266908	4266913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_017168	TATT	2	8	4266936	4266943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_017168	GTT	2	6	4266978	4266983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_017168	GCG	2	6	4267009	4267014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_017168	TTC	2	6	4267067	4267072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_017168	TGT	2	6	4267140	4267145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_017168	TA	3	6	4267146	4267151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_017168	TAA	2	6	4267170	4267175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_017168	CTTG	2	8	4267181	4267188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15536	NC_017168	TATC	2	8	4267209	4267216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15537	NC_017168	GAT	2	6	4267233	4267238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_017168	AAT	2	6	4267255	4267260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_017168	AT	3	6	4267259	4267264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_017168	GT	3	6	4267286	4267291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_017168	TAA	2	6	4267325	4267330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_017168	AAT	2	6	4267391	4267396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_017168	CAA	2	6	4267416	4267421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_017168	ACC	2	6	4267473	4267478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15545	NC_017168	GAA	2	6	4267495	4267500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_017168	GCT	2	6	4267580	4267585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_017168	ATT	2	6	4267679	4267684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_017168	ACC	2	6	4267715	4267720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15549	NC_017168	TCT	2	6	4267815	4267820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15550	NC_017168	TGA	2	6	4267825	4267830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_017168	CCTG	2	8	4267838	4267845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15552	NC_017168	A	7	7	4267893	4267899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_017168	CT	3	6	4267913	4267918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15554	NC_017168	AAT	2	6	4267976	4267981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_017168	GAT	2	6	4267994	4267999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_017168	GCC	2	6	4268039	4268044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15557	NC_017168	ACT	2	6	4268122	4268127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_017168	CTGG	2	8	4268132	4268139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15559	NC_017168	GCA	2	6	4268168	4268173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15560	NC_017168	GCC	2	6	4268195	4268200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_017168	ATC	2	6	4268294	4268299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_017168	AAAG	2	8	4268422	4268429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_017168	TTA	2	6	4268460	4268465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_017168	AGCC	2	8	4268488	4268495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15565	NC_017168	TAAATA	2	12	4268593	4268604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_017168	GTAATA	6	36	4271757	4271792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_017168	AAT	2	6	4271869	4271874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_017168	ATTT	2	8	4271893	4271900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_017168	TGA	2	6	4271901	4271906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_017168	TAA	2	6	4271927	4271932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_017168	TG	3	6	4271939	4271944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_017168	TTG	2	6	4271949	4271954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_017168	AATC	2	8	4271995	4272002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15574	NC_017168	TTTA	2	8	4272042	4272049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_017168	AT	3	6	4272054	4272059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15577	NC_017168	TAT	2	6	4272107	4272112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_017168	TGGG	2	8	4273489	4273496	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_017168	CAT	2	6	4273497	4273502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_017168	TGATG	2	10	4273503	4273512	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_017168	TC	3	6	4275861	4275866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15582	NC_017168	GCT	2	6	4275870	4275875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15584	NC_017168	ATT	2	6	4276170	4276175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15586	NC_017168	TA	3	6	4276235	4276240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15591	NC_017168	T	6	6	4277280	4277285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_017168	AT	3	6	4277377	4277382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15597	NC_017168	A	6	6	4278731	4278736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_017168	AAT	2	6	4278741	4278746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_017168	TCTG	2	8	4278769	4278776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15600	NC_017168	TG	3	6	4278808	4278813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_017168	AT	3	6	4278814	4278819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_017168	GGC	2	6	4278926	4278931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15607	NC_017168	T	7	7	4282942	4282948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15609	NC_017168	T	6	6	4283574	4283579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_017168	GTT	2	6	4283615	4283620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15619	NC_017168	ATT	2	6	4285219	4285224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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