MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017168	AAC	2	6	3948363	3948368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_017168	GC	3	6	3948401	3948406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14503	NC_017168	TC	3	6	3948412	3948417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14504	NC_017168	TACA	2	8	3948466	3948473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14505	NC_017168	CAT	2	6	3948490	3948495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_017168	CCCT	2	8	3949712	3949719	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14507	NC_017168	ATG	2	6	3950438	3950443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_017168	TTC	2	6	3950505	3950510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_017168	CT	4	8	3950566	3950573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14510	NC_017168	CTGC	2	8	3951733	3951740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14511	NC_017168	AAAG	2	8	3951781	3951788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_017168	CAT	2	6	3951796	3951801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_017168	A	6	6	3951821	3951826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_017168	AAT	2	6	3951829	3951834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_017168	TCA	2	6	3951846	3951851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_017168	TGG	2	6	3952749	3952754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_017168	AT	3	6	3952783	3952788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_017168	AAC	2	6	3952805	3952810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_017168	CAA	2	6	3952817	3952822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_017168	ATG	2	6	3952859	3952864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_017168	GCA	2	6	3952872	3952877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_017168	C	7	7	3952937	3952943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14523	NC_017168	TA	3	6	3952971	3952976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_017168	AGG	2	6	3954155	3954160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_017168	ATT	2	6	3955031	3955036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_017168	GATA	2	8	3955076	3955083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_017168	ATA	2	6	3955121	3955126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_017168	AATAA	2	10	3955130	3955139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_017168	TAAT	2	8	3955149	3955156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_017168	ATA	2	6	3955162	3955167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_017168	A	6	6	3955167	3955172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_017168	A	7	7	3955191	3955197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_017168	GAA	2	6	3955211	3955216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_017168	AAAT	2	8	3955226	3955233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_017168	TAAA	2	8	3955507	3955514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_017168	ATA	3	9	3955521	3955529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_017168	ATA	2	6	3955539	3955544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_017168	CAT	2	6	3961186	3961191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_017168	TTG	2	6	3961330	3961335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_017168	GA	3	6	3961388	3961393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_017168	AT	3	6	3961430	3961435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_017168	ACC	2	6	3961462	3961467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14543	NC_017168	AAT	2	6	3961468	3961473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_017168	GTGGC	2	10	3961475	3961484	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14545	NC_017168	AT	5	10	3961516	3961525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_017168	CTT	2	6	3961641	3961646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_017168	A	7	7	3963803	3963809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_017168	CAA	2	6	3963875	3963880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14549	NC_017168	AAT	2	6	3965819	3965824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_017168	ATTAA	2	10	3965862	3965871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_017168	TAT	2	6	3965929	3965934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_017168	TAT	2	6	3965948	3965953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_017168	TTA	3	9	3965954	3965962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_017168	A	7	7	3965979	3965985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_017168	T	7	7	3966005	3966011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_017168	TCAA	2	8	3966018	3966025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14557	NC_017168	GCTC	2	8	3967629	3967636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14558	NC_017168	TGA	2	6	3967643	3967648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_017168	AAG	2	6	3967665	3967670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_017168	A	6	6	3967674	3967679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_017168	GC	3	6	3967689	3967694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14562	NC_017168	CAG	2	6	3967745	3967750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_017168	ACG	2	6	3967827	3967832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_017168	TA	3	6	3967840	3967845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_017168	AAT	2	6	3967859	3967864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_017168	TTAT	2	8	3967907	3967914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_017168	CAA	2	6	3967926	3967931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_017168	GCA	2	6	3967996	3968001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_017168	AGC	2	6	3968043	3968048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_017168	AC	3	6	3968051	3968056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14571	NC_017168	ATA	2	6	3968108	3968113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_017168	TAAA	2	8	3968164	3968171	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_017168	AAT	2	6	3968202	3968207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_017168	ATTT	2	8	3968220	3968227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_017168	AAT	2	6	3968253	3968258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14578	NC_017168	TAT	2	6	3968965	3968970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_017168	CAG	2	6	3969005	3969010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_017168	ATTA	2	8	3969035	3969042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_017168	ATA	2	6	3969043	3969048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_017168	GCC	2	6	3969065	3969070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14583	NC_017168	TCC	2	6	3969122	3969127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14584	NC_017168	TAA	2	6	3974432	3974437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14586	NC_017168	AT	3	6	3974506	3974511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_017168	TTA	2	6	3974512	3974517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_017168	TGCG	2	8	3974519	3974526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14589	NC_017168	ATT	2	6	3974547	3974552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14591	NC_017168	AGA	2	6	3977759	3977764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_017168	GGA	2	6	3982421	3982426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_017168	TAA	2	6	3982537	3982542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_017168	T	6	6	3982547	3982552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14596	NC_017168	TAA	2	6	3982595	3982600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_017168	TTAA	2	8	3982601	3982608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_017168	AAACC	2	10	3982644	3982653	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14599	NC_017168	TAA	2	6	3982668	3982673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_017168	ATA	2	6	3982695	3982700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_017168	AAT	2	6	3982704	3982709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_017168	ATT	3	9	3982714	3982722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_017168	AAT	2	6	3982724	3982729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_017168	ATT	2	6	3982798	3982803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_017168	AT	3	6	3982806	3982811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_017168	ATC	2	6	3982813	3982818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14608	NC_017168	CAT	2	6	3982854	3982859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14609	NC_017168	TTTAA	2	10	3982864	3982873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_017168	AAAT	2	8	3982884	3982891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_017168	A	6	6	3982904	3982909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_017168	TTC	2	6	3982981	3982986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14614	NC_017168	AAT	2	6	3983060	3983065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_017168	TAT	2	6	3983125	3983130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_017168	TAA	2	6	3983133	3983138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14619	NC_017168	AAG	2	6	3983331	3983336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_017168	TC	3	6	3983375	3983380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14621	NC_017168	TGC	2	6	3983400	3983405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14624	NC_017168	TAT	2	6	3984111	3984116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_017168	GTAA	2	8	3984162	3984169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14629	NC_017168	TTATT	2	10	3984329	3984338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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