MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017168	CATT	2	8	3790147	3790154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14002	NC_017168	CATT	2	8	3790163	3790170	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14003	NC_017168	CTG	2	6	3790209	3790214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_017168	GTT	2	6	3790234	3790239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_017168	ACACA	2	10	3790243	3790252	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14006	NC_017168	GATA	2	8	3790308	3790315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_017168	AGG	2	6	3790394	3790399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_017168	ATGC	2	8	3791463	3791470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14009	NC_017168	TAC	2	6	3792900	3792905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_017168	AAT	2	6	3792972	3792977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_017168	CAGA	2	8	3794192	3794199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14012	NC_017168	GTGA	2	8	3794216	3794223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_017168	AAT	2	6	3795347	3795352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_017168	CCA	2	6	3796085	3796090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_017168	TAT	2	6	3797514	3797519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_017168	C	7	7	3797525	3797531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14017	NC_017168	ACA	2	6	3798314	3798319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_017168	TTG	2	6	3798326	3798331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_017168	GC	3	6	3798368	3798373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14020	NC_017168	ATA	2	6	3798439	3798444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_017168	TATT	2	8	3801873	3801880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_017168	GCT	2	6	3801881	3801886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_017168	AGA	2	6	3801928	3801933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_017168	TGC	2	6	3801970	3801975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_017168	TC	3	6	3802035	3802040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14026	NC_017168	ATA	2	6	3803301	3803306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_017168	TGATCA	2	12	3803328	3803339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14028	NC_017168	GTCAG	2	10	3803348	3803357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14029	NC_017168	AAT	2	6	3803379	3803384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_017168	TCA	2	6	3803419	3803424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_017168	TTAT	2	8	3803444	3803451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_017168	TTGA	2	8	3803533	3803540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_017168	GAC	2	6	3803543	3803548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_017168	TTA	2	6	3804486	3804491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_017168	GCCT	2	8	3805420	3805427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14036	NC_017168	TTC	2	6	3805428	3805433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_017168	ATA	2	6	3808625	3808630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_017168	A	6	6	3808687	3808692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_017168	GCC	2	6	3808734	3808739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14040	NC_017168	GTC	2	6	3808750	3808755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_017168	TGT	2	6	3808758	3808763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_017168	GCT	2	6	3808764	3808769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_017168	ATC	2	6	3808810	3808815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_017168	ATT	2	6	3812314	3812319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_017168	TAATGC	2	12	3812408	3812419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14046	NC_017168	GCTG	2	8	3812447	3812454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14047	NC_017168	TCC	2	6	3813083	3813088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_017168	AACG	2	8	3813098	3813105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14049	NC_017168	TGG	2	6	3815007	3815012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_017168	CGT	2	6	3815038	3815043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_017168	AG	3	6	3815136	3815141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_017168	GCGT	2	8	3815167	3815174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14053	NC_017168	G	6	6	3815196	3815201	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_017168	AGTG	2	8	3815268	3815275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_017168	AGG	2	6	3815281	3815286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14057	NC_017168	CAT	2	6	3817606	3817611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_017168	AAT	2	6	3817612	3817617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_017168	TA	3	6	3817729	3817734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_017168	AAT	2	6	3817772	3817777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_017168	CACT	2	8	3817789	3817796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14062	NC_017168	T	6	6	3817807	3817812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_017168	A	6	6	3817813	3817818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_017168	ATC	2	6	3817857	3817862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_017168	ATT	2	6	3817875	3817880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_017168	AAG	2	6	3817881	3817886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_017168	AAC	2	6	3817891	3817896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_017168	GAATT	2	10	3817900	3817909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_017168	TTC	2	6	3817920	3817925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14071	NC_017168	C	7	7	3817991	3817997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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14074	NC_017168	CGC	2	6	3818167	3818172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14075	NC_017168	C	6	6	3819507	3819512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14076	NC_017168	A	6	6	3819542	3819547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_017168	CATG	2	8	3819609	3819616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14078	NC_017168	AT	4	8	3819640	3819647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_017168	T	7	7	3819652	3819658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14083	NC_017168	T	6	6	3819841	3819846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_017168	TAA	2	6	3820516	3820521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_017168	GCG	2	6	3821625	3821630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_017168	A	7	7	3823097	3823103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14093	NC_017168	AGTT	2	8	3825201	3825208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14098	NC_017168	AAAT	2	8	3827532	3827539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_017168	TTTC	2	8	3827569	3827576	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14100	NC_017168	AAT	2	6	3827628	3827633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_017168	CTT	2	6	3827670	3827675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_017168	ATTA	2	8	3827682	3827689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_017168	A	9	9	3827696	3827704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_017168	GGC	2	6	3831258	3831263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_017168	TA	3	6	3831284	3831289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14109	NC_017168	TGCA	2	8	3832496	3832503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14110	NC_017168	AT	3	6	3832552	3832557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_017168	TGA	2	6	3832573	3832578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_017168	TAAA	2	8	3832611	3832618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_017168	TCC	2	6	3832621	3832626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14114	NC_017168	TTG	2	6	3833200	3833205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14116	NC_017168	AGGG	2	8	3834632	3834639	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_017168	A	8	8	3834657	3834664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_017168	A	6	6	3836802	3836807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14123	NC_017168	AATA	2	8	3840334	3840341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14131	NC_017168	AAT	2	6	3842333	3842338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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