MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017168	ATT	2	6	3552750	3552755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_017168	A	6	6	3552777	3552782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_017168	CAGA	2	8	3552783	3552790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13004	NC_017168	TCAT	2	8	3554389	3554396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_017168	GTG	2	6	3555613	3555618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_017168	AAC	2	6	3555740	3555745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_017168	ATC	2	6	3555787	3555792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_017168	ATCA	2	8	3555820	3555827	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13009	NC_017168	CGA	2	6	3555925	3555930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_017168	CAT	2	6	3555938	3555943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_017168	ACG	2	6	3556603	3556608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_017168	CG	3	6	3556641	3556646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_017168	ATG	2	6	3556647	3556652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017168	AAC	2	6	3557974	3557979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_017168	TAA	2	6	3559113	3559118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_017168	ATT	2	6	3560112	3560117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_017168	GTT	2	6	3560137	3560142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_017168	GCC	2	6	3560192	3560197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_017168	TACA	2	8	3560226	3560233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13020	NC_017168	GAT	2	6	3560236	3560241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017168	TACA	2	8	3560244	3560251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13022	NC_017168	AGG	2	6	3560272	3560277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_017168	AT	3	6	3561839	3561844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_017168	GCTT	2	8	3561888	3561895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13025	NC_017168	ACC	2	6	3561993	3561998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13026	NC_017168	ACC	2	6	3562002	3562007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_017168	TCTTT	2	10	3562053	3562062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13029	NC_017168	CAA	2	6	3562077	3562082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_017168	A	6	6	3562081	3562086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_017168	A	6	6	3562092	3562097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_017168	CACAT	2	10	3562105	3562114	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13033	NC_017168	CAT	2	6	3562215	3562220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_017168	A	6	6	3562254	3562259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_017168	ATTT	2	8	3566350	3566357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_017168	ACTGA	2	10	3566382	3566391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13037	NC_017168	CCAA	2	8	3566441	3566448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13038	NC_017168	CACT	2	8	3566482	3566489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_017168	ATT	2	6	3566757	3566762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_017168	AAAT	2	8	3566773	3566780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_017168	T	6	6	3566799	3566804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_017168	AGTT	2	8	3567155	3567162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_017168	AT	3	6	3567598	3567603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_017168	CTC	2	6	3567766	3567771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13047	NC_017168	C	6	6	3571158	3571163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13048	NC_017168	TGA	2	6	3571171	3571176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_017168	TA	3	6	3571188	3571193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_017168	TAA	2	6	3571213	3571218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_017168	TGG	2	6	3571334	3571339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13053	NC_017168	GAA	2	6	3571360	3571365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_017168	CT	3	6	3571400	3571405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_017168	TAA	2	6	3571967	3571972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_017168	AT	3	6	3571987	3571992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017168	GTAG	2	8	3572012	3572019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_017168	CAA	2	6	3572021	3572026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13060	NC_017168	GTCA	2	8	3572127	3572134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13061	NC_017168	AG	3	6	3572917	3572922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_017168	GGC	2	6	3572979	3572984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_017168	AT	3	6	3573129	3573134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_017168	CAAA	2	8	3573179	3573186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13065	NC_017168	CGC	2	6	3573202	3573207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13070	NC_017168	TCTCT	2	10	3574497	3574506	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13071	NC_017168	TAT	2	6	3574543	3574548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_017168	CAT	2	6	3574565	3574570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13074	NC_017168	TA	3	6	3576919	3576924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_017168	TAT	2	6	3576984	3576989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13079	NC_017168	AAAT	2	8	3577120	3577127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13083	NC_017168	ATTC	2	8	3578094	3578101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13084	NC_017168	AAT	2	6	3578134	3578139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13089	NC_017168	TAT	2	6	3578317	3578322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13096	NC_017168	AAT	2	6	3581446	3581451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_017168	AGGA	2	8	3581461	3581468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017168	GAAT	2	8	3582134	3582141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_017168	T	6	6	3582151	3582156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_017168	TATCCC	2	12	3582171	3582182	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13101	NC_017168	CAT	2	6	3582202	3582207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13109	NC_017168	TG	3	6	3583275	3583280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_017168	TG	3	6	3583307	3583312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_017168	TAA	2	6	3583344	3583349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_017168	CTGA	2	8	3583351	3583358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13113	NC_017168	GCAC	2	8	3583766	3583773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_017168	CAT	2	6	3583805	3583810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13116	NC_017168	ATA	2	6	3583898	3583903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_017168	TGTTT	2	10	3583952	3583961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017168	GAA	2	6	3583979	3583984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_017168	GTT	2	6	3583998	3584003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13123	NC_017168	GTTT	2	8	3590792	3590799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_017168	T	6	6	3590833	3590838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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