MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017168	ATTG	2	8	2523566	2523573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_017168	ACT	2	6	2523719	2523724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_017168	TCC	2	6	2523733	2523738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9004	NC_017168	TAG	2	6	2523767	2523772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_017168	A	6	6	2523823	2523828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_017168	TAA	2	6	2533078	2533083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_017168	CAAAAC	2	12	2533121	2533132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_017168	GCC	2	6	2533153	2533158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9009	NC_017168	TGGC	2	8	2533162	2533169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9010	NC_017168	GC	3	6	2533168	2533173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9011	NC_017168	GGT	2	6	2533183	2533188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_017168	AAT	2	6	2533199	2533204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_017168	CTG	2	6	2533205	2533210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_017168	CAA	2	6	2533340	2533345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_017168	TTG	2	6	2533368	2533373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_017168	GCT	2	6	2533384	2533389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_017168	GGC	3	9	2533390	2533398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_017168	A	7	7	2533563	2533569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_017168	ACCC	2	8	2533675	2533682	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9020	NC_017168	CCTG	2	8	2533879	2533886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_017168	G	7	7	2533972	2533978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_017168	AAG	2	6	2534003	2534008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_017168	GGC	2	6	2534119	2534124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_017168	GGGTTG	2	12	2534128	2534139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_017168	ATA	2	6	2534150	2534155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_017168	GTA	2	6	2534221	2534226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_017168	TAGA	2	8	2535491	2535498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_017168	CATTT	2	10	2535538	2535547	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9029	NC_017168	AAT	2	6	2535584	2535589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_017168	AATG	2	8	2537140	2537147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_017168	T	6	6	2537165	2537170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_017168	ATAGT	2	10	2537215	2537224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_017168	CAAT	2	8	2537232	2537239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9034	NC_017168	A	6	6	2537244	2537249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_017168	ATA	2	6	2537391	2537396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_017168	AAT	2	6	2537419	2537424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_017168	ATA	2	6	2537436	2537441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_017168	ATAC	2	8	2537474	2537481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9039	NC_017168	CAA	2	6	2537506	2537511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_017168	AAT	2	6	2537529	2537534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_017168	AGA	2	6	2537540	2537545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_017168	ATGA	2	8	2537645	2537652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_017168	CTG	3	9	2537709	2537717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_017168	AC	3	6	2538668	2538673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9045	NC_017168	GGA	2	6	2538686	2538691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_017168	CGG	2	6	2538692	2538697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_017168	CGA	2	6	2538699	2538704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_017168	ATGA	2	8	2538721	2538728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_017168	AGA	2	6	2538749	2538754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_017168	CAG	2	6	2538785	2538790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_017168	TAAA	2	8	2538808	2538815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_017168	TTG	2	6	2538873	2538878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_017168	TCA	2	6	2538887	2538892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_017168	T	6	6	2539440	2539445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_017168	GTCGC	2	10	2539518	2539527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9056	NC_017168	GCCAT	2	10	2539651	2539660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9057	NC_017168	CCCA	2	8	2539717	2539724	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9058	NC_017168	TGAT	2	8	2539762	2539769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_017168	TCG	2	6	2539832	2539837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_017168	AAAC	2	8	2539854	2539861	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9061	NC_017168	TAA	2	6	2539887	2539892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_017168	CGC	2	6	2539966	2539971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_017168	GAA	2	6	2540002	2540007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_017168	GCA	2	6	2540031	2540036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_017168	TGA	2	6	2540052	2540057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_017168	CTG	2	6	2540118	2540123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_017168	CAA	2	6	2540152	2540157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_017168	GCAG	2	8	2540229	2540236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9069	NC_017168	CTT	2	6	2540271	2540276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_017168	CAAG	2	8	2540298	2540305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9071	NC_017168	CCG	2	6	2540306	2540311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9072	NC_017168	CCA	2	6	2540475	2540480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9073	NC_017168	CAG	2	6	2540515	2540520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_017168	GCTG	2	8	2540539	2540546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9075	NC_017168	CAAT	2	8	2540572	2540579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9076	NC_017168	TCA	2	6	2540597	2540602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_017168	TCA	2	6	2541426	2541431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9078	NC_017168	CCT	2	6	2541503	2541508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9079	NC_017168	CGG	2	6	2541512	2541517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_017168	AAG	2	6	2541520	2541525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_017168	TC	3	6	2541590	2541595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9082	NC_017168	ACC	2	6	2541602	2541607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_017168	GGCA	2	8	2541615	2541622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9084	NC_017168	CGGG	2	8	2541648	2541655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9085	NC_017168	AGA	2	6	2541660	2541665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_017168	ATG	2	6	2541669	2541674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_017168	ACG	2	6	2541696	2541701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_017168	AG	4	8	2541708	2541715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_017168	AG	3	6	2541728	2541733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_017168	AGA	2	6	2541883	2541888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_017168	GTT	2	6	2543971	2543976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9093	NC_017168	AAT	2	6	2545554	2545559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_017168	TCC	2	6	2547014	2547019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9095	NC_017168	A	6	6	2547719	2547724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_017168	CTG	2	6	2547752	2547757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_017168	TTCA	2	8	2547839	2547846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9098	NC_017168	TAAAA	2	10	2549649	2549658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_017168	A	6	6	2549655	2549660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_017168	GAT	2	6	2549684	2549689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_017168	ATA	2	6	2551258	2551263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_017168	TTAA	2	8	2551299	2551306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_017168	ATC	2	6	2552772	2552777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9104	NC_017168	TC	3	6	2553054	2553059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9105	NC_017168	CT	3	6	2554068	2554073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9106	NC_017168	TA	3	6	2554126	2554131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_017168	TA	3	6	2554148	2554153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_017168	TA	4	8	2554160	2554167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_017168	TA	3	6	2554178	2554183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_017168	A	7	7	2554187	2554193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_017168	AGA	2	6	2554245	2554250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_017168	TGC	2	6	2554331	2554336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_017168	TC	3	6	2554341	2554346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_017168	AATA	2	8	2555961	2555968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_017168	TCC	2	6	2555969	2555974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9116	NC_017168	ACA	2	6	2556725	2556730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_017168	TC	4	8	2558579	2558586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9118	NC_017168	GCC	2	6	2559914	2559919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9119	NC_017168	CTGT	2	8	2560027	2560034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9120	NC_017168	ACA	2	6	2560048	2560053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_017168	ACA	2	6	2561231	2561236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_017168	CAT	2	6	2561253	2561258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_017168	TA	3	6	2563054	2563059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_017168	TCA	2	6	2563097	2563102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_017168	CAA	2	6	2563136	2563141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_017168	AATC	2	8	2563175	2563182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9127	NC_017168	GTT	2	6	2564403	2564408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_017168	GCGCT	2	10	2564419	2564428	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9129	NC_017168	ATAA	2	8	2564458	2564465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_017168	ATA	2	6	2564478	2564483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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