MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017168	CAT	2	6	2265344	2265349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_017168	AAT	2	6	2265376	2265381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017168	TTAAT	2	10	2265413	2265422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017168	CTA	2	6	2265428	2265433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_017168	TTGGT	2	10	2265452	2265461	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017168	TTC	2	6	2265527	2265532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_017168	TGG	2	6	2265555	2265560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017168	CAA	2	6	2265566	2265571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_017168	TATAA	2	10	2265593	2265602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017168	AAT	2	6	2265649	2265654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017168	G	7	7	2265657	2265663	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017168	AC	3	6	2265665	2265670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_017168	TTATT	2	10	2265695	2265704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017168	TAG	2	6	2265775	2265780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017168	GTAA	2	8	2265821	2265828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017168	CAT	2	6	2265847	2265852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_017168	TGA	2	6	2265971	2265976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017168	TTA	2	6	2266015	2266020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017168	CAT	2	6	2266503	2266508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_017168	T	6	6	2266560	2266565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017168	GAGGG	2	10	2266573	2266582	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017168	GTT	2	6	2266644	2266649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017168	TAATT	2	10	2271040	2271049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017168	TGC	2	6	2271077	2271082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_017168	GTGC	2	8	2271094	2271101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_017168	TACA	2	8	2271107	2271114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8027	NC_017168	ATGT	2	8	2271122	2271129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017168	C	7	7	2271138	2271144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8029	NC_017168	A	6	6	2271146	2271151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017168	ATA	2	6	2272183	2272188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017168	T	6	6	2272198	2272203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017168	TTA	2	6	2272230	2272235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017168	GCT	2	6	2272261	2272266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_017168	ATT	2	6	2272270	2272275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017168	T	6	6	2272299	2272304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017168	AC	3	6	2272386	2272391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_017168	TTC	2	6	2272396	2272401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_017168	TCA	2	6	2272424	2272429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_017168	CAA	2	6	2275871	2275876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_017168	TGT	2	6	2275908	2275913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017168	TGT	2	6	2275925	2275930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017168	TGT	2	6	2275976	2275981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017168	TTA	2	6	2275995	2276000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017168	AAC	2	6	2276021	2276026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_017168	GTT	2	6	2276028	2276033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017168	TGC	2	6	2276044	2276049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_017168	CAG	2	6	2276106	2276111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_017168	AGT	2	6	2276170	2276175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017168	GAGCA	2	10	2276378	2276387	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8050	NC_017168	TCAC	2	8	2276389	2276396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8051	NC_017168	ATA	2	6	2276456	2276461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017168	A	6	6	2276488	2276493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017168	GTG	2	6	2277085	2277090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017168	ACA	2	6	2277150	2277155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_017168	ACA	2	6	2277163	2277168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_017168	TTG	2	6	2277173	2277178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017168	TGG	2	6	2279429	2279434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017168	CAA	2	6	2279565	2279570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_017168	CAG	2	6	2279797	2279802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_017168	ACA	2	6	2280396	2280401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_017168	CTAT	2	8	2280408	2280415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_017168	TCT	2	6	2280473	2280478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_017168	CCAG	2	8	2280530	2280537	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8064	NC_017168	T	6	6	2280581	2280586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017168	T	6	6	2280610	2280615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017168	T	7	7	2280692	2280698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_017168	TGA	2	6	2280711	2280716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017168	TTC	2	6	2280756	2280761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_017168	TATT	2	8	2280766	2280773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017168	AAACC	2	10	2280800	2280809	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8071	NC_017168	ACG	2	6	2280884	2280889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_017168	GGGT	2	8	2280910	2280917	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017168	GCG	2	6	2280937	2280942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_017168	T	6	6	2280989	2280994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017168	CAT	2	6	2281014	2281019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_017168	GA	3	6	2283061	2283066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017168	TTA	2	6	2284037	2284042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017168	AAT	2	6	2284072	2284077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017168	AATC	2	8	2284079	2284086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8080	NC_017168	T	6	6	2284102	2284107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017168	TAAT	2	8	2284195	2284202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017168	A	7	7	2286081	2286087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017168	T	6	6	2286117	2286122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_017168	CT	3	6	2286130	2286135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8085	NC_017168	TAT	2	6	2286153	2286158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017168	C	6	6	2286208	2286213	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8087	NC_017168	ATGGT	2	10	2286219	2286228	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017168	TATT	2	8	2286249	2286256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017168	CAAG	2	8	2286282	2286289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8090	NC_017168	GCC	2	6	2286980	2286985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_017168	AAG	2	6	2287001	2287006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017168	GTA	2	6	2287010	2287015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017168	GCT	2	6	2288001	2288006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_017168	A	6	6	2288076	2288081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_017168	TGT	2	6	2288100	2288105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017168	TGATC	2	10	2288128	2288137	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8097	NC_017168	ATG	2	6	2288155	2288160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017168	ACATC	2	10	2288162	2288171	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8099	NC_017168	TC	3	6	2288170	2288175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_017168	ATT	2	6	2288200	2288205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017168	CTTAA	2	10	2288240	2288249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8102	NC_017168	G	7	7	2288386	2288392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017168	GAA	2	6	2288433	2288438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017168	T	6	6	2288451	2288456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017168	CTT	2	6	2288479	2288484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_017168	ATT	2	6	2288493	2288498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017168	T	6	6	2288502	2288507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017168	T	7	7	2288529	2288535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017168	TAA	2	6	2288561	2288566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017168	ATA	2	6	2288574	2288579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017168	GA	3	6	2289590	2289595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017168	AGG	2	6	2292815	2292820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017168	T	7	7	2292833	2292839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017168	CTTT	2	8	2295020	2295027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_017168	ATAA	2	8	2295038	2295045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017168	TTA	2	6	2295088	2295093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017168	AT	3	6	2295107	2295112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017168	TAA	2	6	2295125	2295130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017168	GAT	2	6	2295192	2295197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017168	TTTG	2	8	2295210	2295217	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017168	GAT	2	6	2295298	2295303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017168	ATT	2	6	2295304	2295309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017168	ATTT	2	8	2295367	2295374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017168	TGG	2	6	2295411	2295416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017168	TAT	2	6	2295430	2295435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017168	AT	3	6	2295434	2295439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017168	T	8	8	2295598	2295605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017168	T	6	6	2295623	2295628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017168	ATT	3	9	2295639	2295647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017168	T	6	6	2295662	2295667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017168	T	8	8	2295696	2295703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8133	NC_017168	GGT	2	6	2295798	2295803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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