MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017168	TTA	2	6	2018555	2018560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_017168	AGC	2	6	2018570	2018575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_017168	GTTG	2	8	2018594	2018601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017168	CTGA	2	8	2018610	2018617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_017168	CG	3	6	2018634	2018639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_017168	GCA	2	6	2018642	2018647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_017168	TCG	2	6	2018667	2018672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_017168	CAGG	2	8	2018711	2018718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_017168	TG	3	6	2018726	2018731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017168	CTC	2	6	2018736	2018741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_017168	ATC	2	6	2019277	2019282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_017168	TCT	2	6	2019293	2019298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_017168	TA	4	8	2019379	2019386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017168	TA	3	6	2019398	2019403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_017168	T	6	6	2019445	2019450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017168	TGT	2	6	2019461	2019466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017168	T	6	6	2019466	2019471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017168	GTT	2	6	2019477	2019482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017168	TGA	2	6	2019493	2019498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017168	AAG	2	6	2019505	2019510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017168	TTTA	2	8	2019518	2019525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017168	T	6	6	2019549	2019554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017168	A	6	6	2019679	2019684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017168	GAA	2	6	2020852	2020857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_017168	GC	4	8	2021663	2021670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_017168	TATT	2	8	2021710	2021717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017168	CAG	3	9	2023430	2023438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_017168	GAA	2	6	2023460	2023465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017168	TC	3	6	2023518	2023523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_017168	TCTG	2	8	2023529	2023536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_017168	AG	3	6	2024514	2024519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017168	GAAT	2	8	2024586	2024593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017168	TAG	2	6	2024609	2024614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017168	T	7	7	2024658	2024664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017168	GTA	2	6	2024669	2024674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_017168	T	6	6	2024724	2024729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017168	ATT	2	6	2024730	2024735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017168	A	6	6	2024762	2024767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_017168	TAA	2	6	2024809	2024814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_017168	TTC	2	6	2024815	2024820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_017168	TCT	2	6	2024894	2024899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7043	NC_017168	GGC	2	6	2024950	2024955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_017168	TGA	2	6	2025032	2025037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_017168	GAT	2	6	2025046	2025051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7047	NC_017168	AT	3	6	2026399	2026404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_017168	TGAA	2	8	2026792	2026799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_017168	GA	3	6	2026827	2026832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_017168	T	6	6	2026851	2026856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_017168	GGGGA	2	10	2026875	2026884	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017168	GCT	2	6	2026899	2026904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_017168	GAA	2	6	2026981	2026986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_017168	T	9	9	2027005	2027013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_017168	TTA	2	6	2027333	2027338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_017168	TA	3	6	2027361	2027366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_017168	T	6	6	2027421	2027426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017168	GTG	2	6	2027439	2027444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_017168	GGT	2	6	2027452	2027457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_017168	ATT	2	6	2027469	2027474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_017168	T	6	6	2027758	2027763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017168	GT	3	6	2027768	2027773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017168	TAC	2	6	2027790	2027795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_017168	AT	4	8	2027806	2027813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_017168	TCC	2	6	2027827	2027832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_017168	TTATAA	2	12	2027853	2027864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_017168	A	6	6	2027876	2027881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_017168	TCA	2	6	2027898	2027903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_017168	ATTTT	2	10	2027937	2027946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_017168	TTAA	2	8	2027977	2027984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_017168	TAT	2	6	2028001	2028006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017168	T	7	7	2028041	2028047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7076	NC_017168	T	6	6	2028909	2028914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_017168	TA	3	6	2030942	2030947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_017168	A	7	7	2030969	2030975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7088	NC_017168	AG	3	6	2031119	2031124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_017168	CGT	2	6	2031677	2031682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7100	NC_017168	CTTAT	2	10	2031922	2031931	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7101	NC_017168	ATC	2	6	2032028	2032033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_017168	CAT	2	6	2032105	2032110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_017168	AAT	2	6	2032133	2032138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_017168	ATT	2	6	2032168	2032173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_017168	CTG	2	6	2032193	2032198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_017168	GGC	2	6	2032250	2032255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7109	NC_017168	TAT	2	6	2032457	2032462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_017168	AAACG	2	10	2032465	2032474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7111	NC_017168	ATA	2	6	2032542	2032547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_017168	CCA	2	6	2032548	2032553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_017168	CCA	2	6	2032605	2032610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_017168	CAA	2	6	2032681	2032686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7118	NC_017168	TGT	2	6	2033053	2033058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_017168	GAA	2	6	2033144	2033149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_017168	TAG	2	6	2033234	2033239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7122	NC_017168	ATG	2	6	2033349	2033354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_017168	GAC	2	6	2033388	2033393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_017168	TAT	2	6	2033426	2033431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_017168	ATT	2	6	2033449	2033454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_017168	AACA	2	8	2033504	2033511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7127	NC_017168	AT	3	6	2034773	2034778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017168	CAA	2	6	2034782	2034787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_017168	CAG	2	6	2034789	2034794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_017168	AGC	2	6	2034861	2034866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7132	NC_017168	AT	3	6	2036131	2036136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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