MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 16541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017168	TTG	2	6	1399762	1399767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017168	TAA	2	6	1399786	1399791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017168	AT	3	6	1399805	1399810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017168	A	7	7	1399855	1399861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017168	T	6	6	1399866	1399871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017168	TAA	2	6	1399889	1399894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017168	TAT	2	6	1399916	1399921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017168	TGG	2	6	1399931	1399936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017168	TTA	2	6	1399938	1399943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017168	A	6	6	1399954	1399959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017168	GTTG	2	8	1400009	1400016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017168	TGA	2	6	1400044	1400049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017168	TGG	2	6	1400090	1400095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017168	GA	3	6	1400096	1400101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017168	CAT	2	6	1400115	1400120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_017168	GTG	2	6	1400137	1400142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017168	ATG	2	6	1400152	1400157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017168	ATTC	2	8	1400199	1400206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_017168	GGA	2	6	1400214	1400219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017168	AT	3	6	1400490	1400495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017168	TGG	2	6	1400512	1400517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017168	TTAA	2	8	1400600	1400607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017168	ATT	2	6	1400696	1400701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017168	A	6	6	1400715	1400720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017168	ATA	2	6	1400722	1400727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017168	TG	3	6	1400741	1400746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017168	TAA	2	6	1400783	1400788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017168	GTAG	2	8	1400830	1400837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017168	GCA	2	6	1400838	1400843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_017168	TGC	2	6	1400886	1400891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017168	TTAT	2	8	1400937	1400944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017168	CAA	2	6	1400954	1400959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017168	GGC	2	6	1400982	1400987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017168	TA	3	6	1401018	1401023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017168	GA	3	6	1401029	1401034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017168	TAA	2	6	1401058	1401063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017168	ACT	2	6	1401081	1401086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017168	CAG	2	6	1401107	1401112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017168	ACC	2	6	1406713	1406718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_017168	TAA	2	6	1406722	1406727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017168	TAA	2	6	1407319	1407324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017168	TTGA	2	8	1407341	1407348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017168	AT	4	8	1407353	1407360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017168	TAT	2	6	1407379	1407384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017168	T	8	8	1407425	1407432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017168	ATT	3	9	1407440	1407448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017168	TTA	2	6	1407533	1407538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017168	AAT	2	6	1407539	1407544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017168	T	6	6	1407556	1407561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017168	TTA	2	6	1407567	1407572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017168	AG	3	6	1407573	1407578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017168	TAT	2	6	1407629	1407634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017168	AT	3	6	1407641	1407646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017168	T	6	6	1407658	1407663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017168	TAAA	2	8	1407687	1407694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017168	CTAAA	2	10	1407788	1407797	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5057	NC_017168	ATG	2	6	1407801	1407806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017168	TTA	2	6	1407837	1407842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017168	T	6	6	1407851	1407856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017168	GCGT	2	8	1407861	1407868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_017168	A	6	6	1407924	1407929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017168	GATG	2	8	1407972	1407979	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017168	GAC	2	6	1408025	1408030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017168	GTT	2	6	1409301	1409306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017168	ATAA	2	8	1410186	1410193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017168	ATTTT	2	10	1410198	1410207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017168	TAAC	2	8	1410278	1410285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_017168	TAA	2	6	1410301	1410306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017168	AGC	2	6	1410329	1410334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017168	AGC	2	6	1412949	1412954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017168	AGT	2	6	1412961	1412966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017168	ATA	2	6	1412971	1412976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017168	AC	3	6	1413080	1413085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_017168	CT	3	6	1413138	1413143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_017168	CCAA	2	8	1413178	1413185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_017168	ATT	2	6	1413212	1413217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017168	CTG	2	6	1413235	1413240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017168	ATC	2	6	1413248	1413253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017168	A	6	6	1413268	1413273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017168	GAC	2	6	1413292	1413297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017168	CTG	2	6	1413332	1413337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017168	AGC	3	9	1413390	1413398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_017168	AAC	2	6	1413583	1413588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017168	GCG	2	6	1413623	1413628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017168	CGG	2	6	1413648	1413653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017168	TTTG	2	8	1413856	1413863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017168	GCCA	2	8	1413964	1413971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_017168	ATC	2	6	1414002	1414007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017168	TGC	2	6	1414150	1414155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_017168	C	7	7	1414155	1414161	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5091	NC_017168	CGA	2	6	1414167	1414172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_017168	CTT	3	9	1414230	1414238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017168	TGA	2	6	1414245	1414250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017168	TCG	2	6	1414295	1414300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017168	GAT	2	6	1414424	1414429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017168	GCC	2	6	1414447	1414452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_017168	GCCA	2	8	1414494	1414501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_017168	TAC	2	6	1414509	1414514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017168	GCA	2	6	1414549	1414554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017168	CAT	2	6	1414575	1414580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017168	AAG	2	6	1416444	1416449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017168	T	7	7	1416586	1416592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017168	GGT	2	6	1416700	1416705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017168	CCA	2	6	1416787	1416792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_017168	TG	3	6	1418091	1418096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017168	TAGC	2	8	1418097	1418104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_017168	TA	3	6	1418145	1418150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017168	TA	3	6	1418161	1418166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017168	ACGCC	2	10	1418205	1418214	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5110	NC_017168	T	6	6	1418225	1418230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017168	AAT	2	6	1418318	1418323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017168	GGC	2	6	1418338	1418343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017168	TGAA	2	8	1418388	1418395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017168	TACA	2	8	1418407	1418414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_017168	ATC	2	6	1418491	1418496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017168	TGT	2	6	1418558	1418563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017168	AG	3	6	1418574	1418579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017168	TGA	2	6	1419705	1419710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017168	AGT	2	6	1420861	1420866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017168	TGTA	2	8	1420867	1420874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017168	TA	3	6	1420903	1420908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017168	TCA	2	6	1420945	1420950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017168	CTTG	2	8	1424601	1424608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_017168	GA	3	6	1424659	1424664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017168	ATC	2	6	1424680	1424685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017168	ATG	2	6	1424711	1424716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017168	GTAT	2	8	1424759	1424766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017168	TGTA	2	8	1424775	1424782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017168	CTT	2	6	1432039	1432044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017168	CGC	2	6	1432052	1432057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_017168	GCG	2	6	1432066	1432071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_017168	CTAA	2	8	1432112	1432119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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