MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017160	ATAAA	2	10	1008583	1008592	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017160	CAT	2	6	1008613	1008618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017160	ATTA	2	8	1008629	1008636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017160	T	6	6	1008637	1008642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017160	GTTT	3	12	1008646	1008657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017160	TGA	2	6	1008711	1008716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017160	TTTA	2	8	1008717	1008724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017160	AAT	2	6	1008757	1008762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017160	TGA	2	6	1008765	1008770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017160	ATGG	2	8	1008790	1008797	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017160	ATT	2	6	1008850	1008855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017160	TGG	2	6	1008882	1008887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017160	T	6	6	1012012	1012017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017160	ATA	2	6	1012110	1012115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017160	CTG	2	6	1013004	1013009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017160	TGTTT	2	10	1013030	1013039	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017160	ACTC	2	8	1013044	1013051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_017160	GC	3	6	1013052	1013057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_017160	GTAGA	2	10	1013650	1013659	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017160	GCC	2	6	1014778	1014783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_017160	A	7	7	1014813	1014819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017160	GTTA	2	8	1014877	1014884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017160	CTG	2	6	1014931	1014936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017160	GAG	2	6	1014960	1014965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017160	ATA	2	6	1014987	1014992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017160	GCC	2	6	1015014	1015019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_017160	CAT	2	6	1015045	1015050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017160	T	6	6	1015055	1015060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017160	GAATAT	2	12	1015061	1015072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017160	GCTT	2	8	1015110	1015117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_017160	TGA	2	6	1015123	1015128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017160	TGA	2	6	1015149	1015154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017160	TTCAC	2	10	1017813	1017822	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4034	NC_017160	CTAGA	2	10	1019379	1019388	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4035	NC_017160	GGA	2	6	1019452	1019457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017160	TAA	2	6	1019998	1020003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017160	TCA	2	6	1020036	1020041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017160	TCAA	2	8	1020061	1020068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_017160	AG	4	8	1020069	1020076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017160	CTT	2	6	1023491	1023496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017160	GAA	2	6	1023529	1023534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017160	A	6	6	1023668	1023673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017160	ATG	2	6	1023728	1023733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017160	AAGA	2	8	1023736	1023743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017160	GAA	2	6	1023751	1023756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017160	TAATC	2	10	1026378	1026387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4047	NC_017160	TC	3	6	1026549	1026554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_017160	TA	3	6	1026618	1026623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017160	G	6	6	1026654	1026659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017160	TA	3	6	1026660	1026665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017160	GGGA	2	8	1027921	1027928	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017160	ATT	2	6	1028001	1028006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017160	TGG	2	6	1028025	1028030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017160	TGA	2	6	1028033	1028038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017160	TGT	2	6	1028066	1028071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017160	TTTC	2	8	1028088	1028095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_017160	TGA	2	6	1028115	1028120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017160	CTT	2	6	1028154	1028159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017160	TAT	2	6	1028175	1028180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017160	CGG	2	6	1028198	1028203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017160	GGC	2	6	1028210	1028215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017160	GAA	2	6	1028233	1028238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017160	GTC	2	6	1028262	1028267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_017160	ATG	2	6	1028274	1028279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017160	CAC	2	6	1028307	1028312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_017160	GCT	2	6	1028318	1028323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017160	GTG	2	6	1028335	1028340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017160	CCA	2	6	1028407	1028412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_017160	GCT	2	6	1028486	1028491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017160	ATT	2	6	1028644	1028649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017160	TAA	2	6	1028659	1028664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017160	TAA	3	9	1028692	1028700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017160	ACTCT	2	10	1028730	1028739	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4074	NC_017160	CTG	2	6	1028891	1028896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017160	TAAT	2	8	1029519	1029526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017160	CAAA	2	8	1029546	1029553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_017160	CTA	2	6	1029585	1029590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017160	TATT	2	8	1029596	1029603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017160	TAAAAG	2	12	1029665	1029676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017160	TG	3	6	1029758	1029763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017160	GAC	2	6	1029807	1029812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017160	GAT	2	6	1029895	1029900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017160	CAA	2	6	1030340	1030345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_017160	T	6	6	1030363	1030368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017160	GGGATA	2	12	1030378	1030389	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017160	T	6	6	1030400	1030405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017160	CG	3	6	1030409	1030414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_017160	C	7	7	1030494	1030500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4089	NC_017160	CCAT	2	8	1030591	1030598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_017160	ACTG	2	8	1030621	1030628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_017160	TTA	2	6	1030634	1030639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017160	TCAG	2	8	1030649	1030656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_017160	AATT	2	8	1030675	1030682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017160	CGG	2	6	1033046	1033051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017160	AGT	2	6	1033157	1033162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017160	GTG	2	6	1033219	1033224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017160	GGA	2	6	1033285	1033290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017160	T	6	6	1033308	1033313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017160	ACC	2	6	1033655	1033660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_017160	CAT	2	6	1033751	1033756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017160	TGA	2	6	1033757	1033762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017160	AAT	2	6	1033786	1033791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017160	CAA	2	6	1033866	1033871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017160	GCCC	2	8	1033880	1033887	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4105	NC_017160	C	6	6	1033885	1033890	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4106	NC_017160	TAA	2	6	1033924	1033929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017160	ATG	2	6	1033989	1033994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017160	TC	3	6	1034021	1034026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_017160	AATT	2	8	1034038	1034045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017160	AAAT	2	8	1034080	1034087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017160	GCG	2	6	1034156	1034161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017160	TAAT	2	8	1034525	1034532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017160	ATC	2	6	1034548	1034553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017160	GAATA	2	10	1034559	1034568	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017160	CAA	2	6	1034580	1034585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017160	TTC	2	6	1034677	1034682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017160	AGT	2	6	1035207	1035212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017160	T	6	6	1035351	1035356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017160	GAT	2	6	1036579	1036584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017160	TAA	2	6	1036688	1036693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017160	CT	3	6	1036808	1036813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_017160	CAA	2	6	1036947	1036952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017160	TCA	2	6	1036985	1036990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017160	ATAA	2	8	1037040	1037047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017160	GAT	2	6	1037050	1037055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017160	TGA	2	6	1038596	1038601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017160	TGC	2	6	1038615	1038620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017160	GGA	2	6	1038677	1038682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017160	AAG	2	6	1038751	1038756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017160	CAAG	2	8	1038761	1038768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4131	NC_017160	TA	3	6	1038779	1038784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017160	ATC	2	6	1038911	1038916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017160	T	6	6	1038928	1038933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017160	TGG	2	6	1038963	1038968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_017160	AAT	2	6	1039205	1039210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_017160	TTG	2	6	1043252	1043257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4167	NC_017160	AATA	2	8	1043559	1043566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4174	NC_017160	TGA	2	6	1044902	1044907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4243	NC_017160	T	6	6	1054668	1054673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4247	NC_017160	ATG	2	6	1054802	1054807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_017160	AGCGT	2	10	1054836	1054845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4249	NC_017160	TGTATT	2	12	1054910	1054921	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_017160	AAT	2	6	1054942	1054947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_017160	GGT	2	6	1056239	1056244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_017160	CAC	2	6	1056288	1056293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4253	NC_017160	ACTG	2	8	1056305	1056312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4254	NC_017160	TGA	2	6	1056346	1056351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_017160	AAG	2	6	1056352	1056357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_017160	TATT	2	8	1059772	1059779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_017160	T	7	7	1061899	1061905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_017160	CCA	2	6	1061944	1061949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4260	NC_017160	A	6	6	1062326	1062331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_017160	ATA	2	6	1062344	1062349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_017160	ATA	2	6	1062360	1062365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_017160	GTT	2	6	1062389	1062394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_017160	AGA	2	6	1062474	1062479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4267	NC_017160	TAAA	2	8	1062527	1062534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4392	NC_017160	ATAA	2	8	1100480	1100487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_017160	TAC	2	6	1100492	1100497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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