MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017160	GCT	2	6	376906	376911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017160	CCA	2	6	376912	376917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_017160	TA	3	6	376929	376934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017160	T	7	7	376999	377005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017160	GAA	2	6	377063	377068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017160	TCAG	2	8	377216	377223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_017160	ATAA	2	8	377253	377260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017160	T	6	6	377363	377368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017160	ATT	2	6	377382	377387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017160	ATTT	2	8	377530	377537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017160	AT	3	6	377540	377545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017160	TA	3	6	377549	377554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017160	T	8	8	377580	377587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017160	ATTTTT	2	12	377606	377617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017160	CTTAT	2	10	377633	377642	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_017160	TCA	2	6	377643	377648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017160	A	7	7	377648	377654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017160	CTC	2	6	380022	380027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_017160	GCT	2	6	380039	380044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017160	CGT	2	6	380062	380067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017160	TGG	2	6	380119	380124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017160	TGG	2	6	380127	380132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017160	CGG	2	6	380215	380220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017160	TTCT	2	8	380232	380239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_017160	TAT	2	6	380242	380247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017160	ATG	2	6	380280	380285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017160	GT	3	6	380299	380304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017160	TGC	2	6	380317	380322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017160	GCTG	2	8	380329	380336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_017160	ACT	2	6	380989	380994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_017160	TCG	2	6	381015	381020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017160	GCG	2	6	383939	383944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017160	GCG	2	6	383954	383959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017160	ACCTT	2	10	385312	385321	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1535	NC_017160	TCA	2	6	385392	385397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017160	TGCC	2	8	385466	385473	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_017160	TG	3	6	385480	385485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017160	TCTG	2	8	385509	385516	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_017160	GATT	2	8	385521	385528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017160	AGTTC	2	10	385606	385615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1541	NC_017160	GTT	2	6	385666	385671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017160	T	7	7	385723	385729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017160	ACA	2	6	385769	385774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017160	ATG	2	6	386121	386126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017160	AAT	2	6	387519	387524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017160	GGC	2	6	387539	387544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017160	TCTT	2	8	387642	387649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_017160	CTT	2	6	387667	387672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017160	GAA	2	6	387692	387697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017160	AGA	2	6	387708	387713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017160	AG	3	6	390005	390010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017160	T	6	6	390150	390155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017160	TTTGGT	2	12	390195	390206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017160	GCTG	2	8	390319	390326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_017160	TG	3	6	390325	390330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017160	CTA	2	6	390333	390338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017160	GCC	2	6	390413	390418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017160	T	6	6	390438	390443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017160	ATC	2	6	391787	391792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017160	GGTAT	2	10	391929	391938	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017160	A	7	7	391968	391974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017160	T	6	6	392560	392565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017160	TAA	2	6	392569	392574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017160	GCA	2	6	392612	392617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_017160	AGC	2	6	392728	392733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017160	AC	3	6	392736	392741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_017160	CTG	3	9	392773	392781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_017160	GGA	2	6	392787	392792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017160	AGTA	2	8	395343	395350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017160	TGG	2	6	395352	395357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017160	GGC	2	6	395372	395377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017160	TAATT	2	10	395394	395403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017160	TGG	2	6	395406	395411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017160	CTG	2	6	396276	396281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017160	TC	3	6	396404	396409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_017160	TTG	2	6	396464	396469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017160	T	6	6	396504	396509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017160	CAG	2	6	398324	398329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_017160	GGT	2	6	398535	398540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017160	AGC	2	6	398589	398594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_017160	TCAT	2	8	398623	398630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_017160	TA	3	6	398674	398679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017160	GAA	2	6	398685	398690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_017160	T	8	8	404506	404513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017160	CT	3	6	404544	404549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1600	NC_017160	ACG	2	6	404835	404840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017160	CA	3	6	404861	404866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_017160	GTC	2	6	404895	404900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017160	CCT	2	6	404931	404936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_017160	CAG	2	6	404956	404961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_017160	CTT	2	6	404962	404967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_017160	TGA	2	6	405129	405134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017160	CTT	2	6	405154	405159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1609	NC_017160	ATTT	3	12	408744	408755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017160	A	6	6	408774	408779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017160	T	6	6	408806	408811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017160	GTT	2	6	408851	408856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017160	AT	3	6	408893	408898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017160	T	6	6	408925	408930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017160	T	6	6	408988	408993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017160	ACTT	2	8	409003	409010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_017160	TAAA	2	8	409062	409069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017160	T	7	7	409082	409088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017160	TGTCAG	2	12	409252	409263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1621	NC_017160	TCC	2	6	409313	409318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_017160	CAGC	2	8	409336	409343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_017160	AGT	2	6	409389	409394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017160	GAT	2	6	409425	409430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017160	TAC	2	6	409442	409447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_017160	CGG	2	6	409476	409481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017160	TTCC	2	8	409543	409550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_017160	GGT	2	6	409559	409564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017160	TGT	2	6	409773	409778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017160	AG	3	6	409823	409828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017160	CAG	2	6	409856	409861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_017160	TGT	2	6	409950	409955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017160	AG	3	6	410000	410005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017160	T	6	6	412572	412577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_017160	ATC	2	6	412578	412583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_017160	TTC	2	6	412660	412665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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