MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017160	CAG	2	6	4115468	4115473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_017160	GCT	2	6	4115489	4115494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_017160	CGC	2	6	4115590	4115595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18005	NC_017160	AT	3	6	4115601	4115606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_017160	AAT	2	6	4115618	4115623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_017160	CGC	2	6	4115674	4115679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18008	NC_017160	AT	3	6	4115685	4115690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_017160	T	6	6	4115693	4115698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_017160	AAT	2	6	4115716	4115721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_017160	AT	3	6	4115720	4115725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_017160	CAT	2	6	4115737	4115742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_017160	ATTT	2	8	4115776	4115783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_017160	TTAA	2	8	4115835	4115842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_017160	ACA	2	6	4115857	4115862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18016	NC_017160	T	7	7	4115913	4115919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_017160	ACA	2	6	4115922	4115927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_017160	A	7	7	4115965	4115971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_017160	TAA	2	6	4116025	4116030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_017160	TAAA	2	8	4116102	4116109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_017160	A	6	6	4116107	4116112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_017160	GC	3	6	4116183	4116188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18023	NC_017160	AG	3	6	4116218	4116223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_017160	AG	3	6	4116235	4116240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_017160	GAC	2	6	4116264	4116269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_017160	A	6	6	4116299	4116304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_017160	ACCA	2	8	4116320	4116327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18028	NC_017160	GCC	2	6	4117369	4117374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18029	NC_017160	ATT	2	6	4117389	4117394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_017160	GCC	2	6	4117478	4117483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18031	NC_017160	GAA	2	6	4117495	4117500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_017160	TTGC	2	8	4119970	4119977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18034	NC_017160	TGAA	2	8	4120001	4120008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_017160	TGA	2	6	4120062	4120067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_017160	CT	3	6	4120068	4120073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18037	NC_017160	GC	3	6	4120078	4120083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18038	NC_017160	GCC	2	6	4120087	4120092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18039	NC_017160	AAC	2	6	4120152	4120157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_017160	TAA	2	6	4120183	4120188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_017160	ACA	2	6	4120302	4120307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18043	NC_017160	GGGGA	2	10	4120404	4120413	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_017160	GA	3	6	4120423	4120428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_017160	GACAAA	2	12	4120455	4120466	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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18047	NC_017160	G	7	7	4120557	4120563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_017160	G	7	7	4120570	4120576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_017160	TAA	2	6	4120617	4120622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18051	NC_017160	GGATT	2	10	4120750	4120759	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_017160	TTA	2	6	4122102	4122107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_017160	AACTT	2	10	4122119	4122128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18054	NC_017160	TCA	2	6	4124652	4124657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_017160	GGC	2	6	4124718	4124723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_017160	GCC	2	6	4124731	4124736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18057	NC_017160	AAG	2	6	4124773	4124778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_017160	A	8	8	4125254	4125261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_017160	TAA	2	6	4125285	4125290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_017160	CTT	2	6	4125383	4125388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_017160	GTT	2	6	4125425	4125430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_017160	GCA	2	6	4125548	4125553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18063	NC_017160	AGTT	2	8	4125560	4125567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_017160	CGC	3	9	4125630	4125638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18065	NC_017160	TCTG	2	8	4125686	4125693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18072	NC_017160	ACAGG	2	10	4126023	4126032	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18073	NC_017160	TTC	2	6	4126037	4126042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18097	NC_017160	TAT	2	6	4127217	4127222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_017160	AG	3	6	4128802	4128807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_017160	GAT	2	6	4128864	4128869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18101	NC_017160	A	6	6	4128930	4128935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_017160	ATC	2	6	4128963	4128968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18107	NC_017160	CGT	2	6	4129176	4129181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18108	NC_017160	ATTA	2	8	4135968	4135975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_017160	TGCC	2	8	4139771	4139778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18110	NC_017160	GAC	2	6	4139786	4139791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18111	NC_017160	CGC	2	6	4139793	4139798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18112	NC_017160	GC	3	6	4140916	4140921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18113	NC_017160	CTC	2	6	4142808	4142813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18114	NC_017160	CAG	2	6	4142855	4142860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18115	NC_017160	CACT	2	8	4142896	4142903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18119	NC_017160	AAT	2	6	4146003	4146008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18120	NC_017160	AATT	2	8	4146010	4146017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_017160	T	7	7	4146056	4146062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18122	NC_017160	TTTA	2	8	4146067	4146074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18125	NC_017160	AGGG	2	8	4146182	4146189	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_017160	GGAAG	2	10	4146202	4146211	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_017160	ATA	2	6	4146215	4146220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_017160	GGC	2	6	4146221	4146226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18130	NC_017160	CGA	2	6	4146258	4146263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18131	NC_017160	AT	3	6	4147229	4147234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18132	NC_017160	AAC	2	6	4147304	4147309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18133	NC_017160	TA	3	6	4147353	4147358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18134	NC_017160	TA	3	6	4147404	4147409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18135	NC_017160	AT	3	6	4147424	4147429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18136	NC_017160	TCA	2	6	4147515	4147520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18138	NC_017160	CAA	2	6	4147570	4147575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18140	NC_017160	TA	3	6	4147802	4147807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18165	NC_017160	ACC	2	6	4149708	4149713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18255	NC_017160	TTTC	2	8	4161679	4161686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18431	NC_017160	CA	3	6	4196380	4196385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18432	NC_017160	CGTT	2	8	4196411	4196418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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