MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017160	AATG	2	8	244192	244199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017160	CTC	2	6	245619	245624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_017160	GAT	2	6	245652	245657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017160	AGA	2	6	247690	247695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017160	TC	3	6	249720	249725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_017160	GCC	2	6	249748	249753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_017160	TA	3	6	249754	249759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017160	GGC	2	6	249760	249765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017160	GTT	2	6	251746	251751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017160	AAT	2	6	251752	251757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017160	GA	3	6	251785	251790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017160	T	6	6	251803	251808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017160	GGC	2	6	251810	251815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017160	GTG	2	6	251865	251870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017160	GGA	2	6	251893	251898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017160	TAAA	2	8	252000	252007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017160	TGT	2	6	252008	252013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017160	TTA	2	6	252015	252020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017160	TTA	2	6	252046	252051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017160	AATTAA	2	12	252068	252079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017160	A	7	7	252078	252084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017160	TATT	2	8	252109	252116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017160	T	6	6	252128	252133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017160	T	7	7	252142	252148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017160	TGTT	2	8	252156	252163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017160	GCG	2	6	252188	252193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017160	A	6	6	252233	252238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017160	T	6	6	252281	252286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017160	CCT	2	6	252290	252295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_017160	TATC	2	8	252381	252388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_017160	CAG	3	9	253968	253976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017160	TGA	2	6	253991	253996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017160	CAT	2	6	254038	254043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017160	ATTT	2	8	254074	254081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017160	TAA	2	6	254096	254101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017160	T	7	7	257601	257607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017160	ATT	2	6	257747	257752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017160	GCA	2	6	260568	260573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017160	GGA	3	9	260586	260594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017160	CAAA	2	8	260619	260626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_017160	TGC	2	6	260678	260683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017160	TAA	2	6	260709	260714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017160	ATG	2	6	260716	260721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017160	AGA	2	6	260739	260744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017160	AAT	2	6	260745	260750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017160	ATT	2	6	260806	260811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017160	TAT	2	6	260847	260852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017160	TAT	2	6	260911	260916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017160	CAG	2	6	261633	261638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017160	GGC	2	6	261665	261670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017160	TGG	2	6	261834	261839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017160	TTA	2	6	261911	261916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017160	GTTTG	2	10	261936	261945	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017160	GAA	2	6	262013	262018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017160	CTG	2	6	262031	262036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017160	AATT	2	8	262118	262125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017160	T	6	6	262124	262129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017160	GAT	2	6	262140	262145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017160	AGT	2	6	262158	262163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017160	GCC	2	6	262199	262204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_017160	AC	3	6	262213	262218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_017160	CAGC	2	8	262251	262258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_017160	ATG	2	6	262272	262277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017160	GCA	2	6	262298	262303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017160	GGGC	2	8	263130	263137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_017160	TAAA	2	8	263162	263169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017160	ATC	2	6	263257	263262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017160	A	6	6	263266	263271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017160	AGGG	2	8	263291	263298	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017160	TATCT	2	10	269709	269718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_017160	CAT	2	6	270431	270436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017160	GTT	2	6	270455	270460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017160	CTC	2	6	270474	270479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_017160	TC	3	6	270478	270483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017160	GTG	2	6	270495	270500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017160	GTT	2	6	270581	270586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017160	TGA	2	6	270607	270612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017160	CAG	2	6	270651	270656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017160	T	6	6	270659	270664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017160	AAT	2	6	272600	272605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017160	TAT	2	6	272631	272636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017160	AAT	2	6	272640	272645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017160	TTA	2	6	272650	272655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017160	TA	3	6	272654	272659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017160	CTG	2	6	272669	272674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017160	TC	3	6	272797	272802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_017160	TTA	2	6	272837	272842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017160	TA	3	6	272841	272846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017160	ATT	2	6	272881	272886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017160	GCTT	2	8	272903	272910	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_017160	TGG	2	6	274206	274211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017160	AAT	2	6	274313	274318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017160	CAG	2	6	274364	274369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017160	TAT	2	6	275477	275482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017160	TTTA	2	8	275489	275496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017160	TAC	2	6	275502	275507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017160	T	6	6	275537	275542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017160	AAAAT	2	10	275613	275622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017160	GAAT	2	8	276938	276945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017160	TAA	2	6	276952	276957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017160	AGGT	2	8	276959	276966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017160	T	6	6	278263	278268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017160	TAAT	2	8	281968	281975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017160	T	7	7	281979	281985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017160	ATGA	2	8	282043	282050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017160	T	7	7	282063	282069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017160	T	8	8	284124	284131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017160	GCTG	2	8	284152	284159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_017160	TCAT	2	8	284196	284203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_017160	TA	3	6	284223	284228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017160	GCA	2	6	284386	284391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017160	CAA	2	6	284441	284446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017160	TTG	2	6	285183	285188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017160	CCCA	2	8	287286	287293	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1115	NC_017160	TCT	2	6	288209	288214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017160	TG	3	6	288216	288221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017160	TTAA	2	8	288234	288241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017160	AAT	2	6	288252	288257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017160	ATTT	2	8	288267	288274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017160	TTG	2	6	288276	288281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017160	TCG	2	6	288297	288302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017160	GTT	2	6	288400	288405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017160	AGG	2	6	288486	288491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017160	TAGT	2	8	289008	289015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017160	GCC	2	6	289016	289021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_017160	ATT	2	6	289174	289179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017160	TA	3	6	289332	289337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017160	ATGA	2	8	294496	294503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017160	ATTT	2	8	294552	294559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017160	ATAA	2	8	294563	294570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017160	ATA	2	6	294621	294626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017160	ATG	3	9	294642	294650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017160	ATGAT	2	10	294656	294665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017160	AAT	2	6	294695	294700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017160	GGT	2	6	295302	295307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_017160	TGA	2	6	298065	298070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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