MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017160	A	6	6	2823172	2823177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_017160	ATG	2	6	2823188	2823193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017160	TGA	2	6	2823225	2823230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_017160	AGG	2	6	2823246	2823251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_017160	ATT	2	6	2823293	2823298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_017160	A	6	6	2823307	2823312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_017160	TGA	2	6	2823369	2823374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017160	GCTT	2	8	2823400	2823407	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12509	NC_017160	TCT	2	6	2823425	2823430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_017160	TTA	2	6	2823441	2823446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017160	T	6	6	2823507	2823512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017160	T	6	6	2823517	2823522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_017160	AT	3	6	2823538	2823543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017160	AGA	2	6	2823548	2823553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_017160	CTG	2	6	2823580	2823585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_017160	TTTTG	2	10	2823601	2823610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_017160	ATA	2	6	2823651	2823656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_017160	GAT	2	6	2823689	2823694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_017160	AAT	2	6	2823707	2823712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_017160	A	6	6	2823734	2823739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_017160	TAA	2	6	2823853	2823858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_017160	ACA	2	6	2823881	2823886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_017160	ACT	2	6	2823938	2823943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_017160	TAC	2	6	2823945	2823950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_017160	TCA	2	6	2823984	2823989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_017160	AGAA	2	8	2824041	2824048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_017160	ATG	2	6	2824056	2824061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_017160	TTG	2	6	2824082	2824087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017160	GGA	2	6	2824117	2824122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_017160	T	6	6	2824152	2824157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_017160	ATCT	2	8	2824192	2824199	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12532	NC_017160	CAG	2	6	2824206	2824211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_017160	T	6	6	2824222	2824227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_017160	GTA	2	6	2824230	2824235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_017160	TA	3	6	2824260	2824265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_017160	AAT	2	6	2824291	2824296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_017160	GT	3	6	2824331	2824336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017160	GCC	2	6	2824378	2824383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_017160	GAG	2	6	2824387	2824392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017160	ATG	2	6	2824998	2825003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_017160	CAT	2	6	2825053	2825058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_017160	A	6	6	2825104	2825109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_017160	GTCTT	2	10	2825141	2825150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12544	NC_017160	CCAAGC	2	12	2825157	2825168	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12545	NC_017160	TGA	2	6	2825666	2825671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_017160	ATG	2	6	2825826	2825831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_017160	AC	3	6	2825879	2825884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_017160	CAA	2	6	2826985	2826990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_017160	TGC	2	6	2826993	2826998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_017160	AAT	2	6	2827016	2827021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_017160	TTA	2	6	2827038	2827043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_017160	GAA	3	9	2829535	2829543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_017160	AAAC	2	8	2829546	2829553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12554	NC_017160	TAT	2	6	2829560	2829565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_017160	C	6	6	2829567	2829572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12556	NC_017160	GAAC	2	8	2829644	2829651	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12557	NC_017160	ATG	2	6	2829678	2829683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_017160	CAT	2	6	2829701	2829706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_017160	GCT	2	6	2829719	2829724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_017160	ATTTT	2	10	2829725	2829734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_017160	CAA	2	6	2829767	2829772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_017160	GAATA	2	10	2829782	2829791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_017160	ATT	2	6	2832949	2832954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_017160	CAC	2	6	2833000	2833005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_017160	TA	3	6	2833018	2833023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_017160	A	7	7	2834099	2834105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_017160	A	6	6	2835096	2835101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_017160	ATT	2	6	2835133	2835138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_017160	ACC	2	6	2835153	2835158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12570	NC_017160	TAAC	2	8	2836304	2836311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12571	NC_017160	CAT	2	6	2837612	2837617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_017160	TAG	2	6	2837626	2837631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_017160	ATT	2	6	2837646	2837651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_017160	TATTTA	2	12	2837691	2837702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_017160	TC	3	6	2837724	2837729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12576	NC_017160	T	8	8	2837781	2837788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_017160	ATTG	2	8	2837815	2837822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_017160	TGG	2	6	2837823	2837828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_017160	AG	4	8	2837869	2837876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_017160	TAA	2	6	2837945	2837950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_017160	CAAT	2	8	2837986	2837993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12582	NC_017160	ATC	2	6	2838052	2838057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_017160	CTCATC	6	36	2838058	2838093	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12584	NC_017160	ATTA	2	8	2838106	2838113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_017160	TTG	2	6	2838114	2838119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_017160	AG	3	6	2838126	2838131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12591	NC_017160	TAT	2	6	2839628	2839633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_017160	T	7	7	2839653	2839659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_017160	GGT	2	6	2839698	2839703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_017160	A	7	7	2839706	2839712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_017160	T	6	6	2839716	2839721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017160	TAT	2	6	2839764	2839769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_017160	TCG	2	6	2839931	2839936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_017160	TTTG	2	8	2839943	2839950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_017160	CTG	2	6	2840081	2840086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12602	NC_017160	ACA	2	6	2840289	2840294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_017160	TTA	2	6	2840311	2840316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_017160	AT	3	6	2840364	2840369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_017160	ATGT	2	8	2840391	2840398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12607	NC_017160	AG	4	8	2840493	2840500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_017160	AAT	2	6	2840512	2840517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_017160	TAA	2	6	2840524	2840529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017160	T	6	6	2840573	2840578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_017160	T	6	6	2844880	2844885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_017160	ATT	2	6	2844900	2844905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_017160	CTGT	2	8	2844912	2844919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12614	NC_017160	GTT	2	6	2844928	2844933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_017160	T	7	7	2844973	2844979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_017160	GGCTA	2	10	2845009	2845018	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12617	NC_017160	ATG	2	6	2845046	2845051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12619	NC_017160	T	6	6	2845182	2845187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_017160	GTT	2	6	2845207	2845212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12623	NC_017160	ACTG	2	8	2852177	2852184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12624	NC_017160	GTAG	2	8	2852244	2852251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_017160	CCT	2	6	2852288	2852293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12626	NC_017160	GAT	2	6	2852337	2852342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12628	NC_017160	TTTG	2	8	2852375	2852382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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