MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017160	CAA	2	6	2649945	2649950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_017160	GGA	2	6	2649998	2650003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_017160	ATA	2	6	2650028	2650033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_017160	TGC	2	6	2650118	2650123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_017160	GCAA	2	8	2650136	2650143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11506	NC_017160	AG	3	6	2650153	2650158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_017160	CTTGC	2	10	2650168	2650177	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11508	NC_017160	GAT	2	6	2650297	2650302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_017160	ATA	2	6	2650306	2650311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_017160	ATT	2	6	2650337	2650342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_017160	ATT	2	6	2650352	2650357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_017160	TC	3	6	2650358	2650363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_017160	GCA	2	6	2650448	2650453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_017160	TGA	2	6	2650501	2650506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_017160	CTG	2	6	2650529	2650534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_017160	CTA	2	6	2650579	2650584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_017160	TTA	2	6	2650636	2650641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_017160	ATT	2	6	2650700	2650705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_017160	AAT	2	6	2650767	2650772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_017160	CCCT	2	8	2650799	2650806	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11521	NC_017160	TTG	2	6	2652580	2652585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_017160	GGA	2	6	2652673	2652678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_017160	TCC	2	6	2652693	2652698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_017160	T	6	6	2652701	2652706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_017160	CCGG	2	8	2652815	2652822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_017160	AAC	2	6	2652880	2652885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_017160	CCA	2	6	2652902	2652907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11528	NC_017160	GTA	2	6	2652976	2652981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_017160	TTA	2	6	2653062	2653067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_017160	TTA	2	6	2653080	2653085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_017160	ACAG	2	8	2653102	2653109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11532	NC_017160	A	6	6	2653111	2653116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_017160	T	7	7	2653131	2653137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_017160	TGC	2	6	2653175	2653180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_017160	GAAC	2	8	2653273	2653280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11536	NC_017160	TGC	2	6	2653288	2653293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_017160	TGA	2	6	2653306	2653311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_017160	TCA	2	6	2653354	2653359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_017160	A	6	6	2653386	2653391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_017160	GCC	2	6	2653396	2653401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11541	NC_017160	TAAAA	2	10	2653625	2653634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_017160	T	6	6	2653721	2653726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_017160	AG	3	6	2653780	2653785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_017160	ATG	2	6	2653815	2653820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_017160	G	7	7	2657102	2657108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_017160	C	7	7	2657140	2657146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11547	NC_017160	TGT	2	6	2657225	2657230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_017160	T	7	7	2657297	2657303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_017160	CT	3	6	2657336	2657341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_017160	T	6	6	2657375	2657380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_017160	ATC	2	6	2657414	2657419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_017160	ATC	2	6	2657440	2657445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_017160	CAT	2	6	2657458	2657463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_017160	CGCCA	2	10	2657475	2657484	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11555	NC_017160	TAT	2	6	2658522	2658527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_017160	CAG	2	6	2658528	2658533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_017160	GATAC	2	10	2658534	2658543	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11558	NC_017160	AAT	2	6	2658548	2658553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_017160	TA	3	6	2658669	2658674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_017160	AT	3	6	2658733	2658738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_017160	ATT	2	6	2659331	2659336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_017160	CTT	2	6	2659592	2659597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_017160	TTG	2	6	2659676	2659681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017160	A	6	6	2659749	2659754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_017160	TAA	2	6	2659772	2659777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_017160	ACCT	2	8	2659784	2659791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_017160	TAA	2	6	2660318	2660323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_017160	TTA	2	6	2660328	2660333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_017160	GCCT	2	8	2661337	2661344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11570	NC_017160	A	7	7	2661368	2661374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_017160	A	7	7	2661400	2661406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_017160	TAT	2	6	2661439	2661444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_017160	TCA	2	6	2661469	2661474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_017160	TTA	2	6	2661540	2661545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_017160	ATAGAA	2	12	2661590	2661601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_017160	TGA	2	6	2661626	2661631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_017160	TGAT	2	8	2661647	2661654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_017160	TCA	2	6	2661794	2661799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_017160	ATT	2	6	2661804	2661809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_017160	TCA	2	6	2661816	2661821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_017160	TATT	2	8	2661893	2661900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_017160	T	7	7	2661938	2661944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_017160	T	6	6	2661953	2661958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_017160	AAT	3	9	2661976	2661984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_017160	TAA	3	9	2662017	2662025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_017160	CAT	2	6	2662031	2662036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11590	NC_017160	TA	3	6	2663580	2663585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_017160	AAAT	2	8	2663594	2663601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_017160	TG	3	6	2663658	2663663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_017160	GC	3	6	2663668	2663673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_017160	A	8	8	2663691	2663698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_017160	ATAA	2	8	2663722	2663729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_017160	GC	3	6	2663798	2663803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_017160	TCT	2	6	2663878	2663883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_017160	ACG	2	6	2663929	2663934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_017160	ATG	2	6	2664388	2664393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11602	NC_017160	TCT	2	6	2664432	2664437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_017160	CTT	2	6	2664454	2664459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11606	NC_017160	AT	4	8	2665579	2665586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_017160	AAT	2	6	2665604	2665609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_017160	TAA	2	6	2665628	2665633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_017160	CATGT	2	10	2665664	2665673	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11610	NC_017160	CAG	2	6	2665700	2665705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_017160	CCT	3	9	2665720	2665728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11612	NC_017160	A	7	7	2665733	2665739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_017160	ATTA	2	8	2665741	2665748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11618	NC_017160	A	6	6	2665884	2665889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_017160	ATAA	2	8	2665943	2665950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_017160	TAA	2	6	2665953	2665958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_017160	ATT	3	9	2666004	2666012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11623	NC_017160	AAT	2	6	2666024	2666029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_017160	GGC	2	6	2666044	2666049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_017160	GA	3	6	2666054	2666059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_017160	CTTA	2	8	2666131	2666138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11627	NC_017160	AGTA	2	8	2666155	2666162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_017160	ATT	2	6	2666169	2666174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11630	NC_017160	AAT	2	6	2667895	2667900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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