MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017160	GAT	2	6	2553575	2553580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_017160	TGA	2	6	2553604	2553609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_017160	A	6	6	2553673	2553678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_017160	TAA	2	6	2553691	2553696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_017160	AAT	2	6	2553702	2553707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_017160	A	7	7	2553800	2553806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_017160	TCA	2	6	2553889	2553894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_017160	CCT	2	6	2553895	2553900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_017160	A	7	7	2553940	2553946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_017160	CAA	2	6	2553956	2553961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_017160	TCA	2	6	2554005	2554010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_017160	ATG	2	6	2554057	2554062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_017160	TGT	2	6	2554165	2554170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_017160	A	6	6	2554209	2554214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_017160	CTT	2	6	2554616	2554621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_017160	CAT	2	6	2554735	2554740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_017160	TGA	2	6	2554746	2554751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_017160	AT	3	6	2554758	2554763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_017160	AACA	2	8	2554769	2554776	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_017160	TAT	2	6	2554831	2554836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_017160	CAAA	2	8	2554840	2554847	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11022	NC_017160	TCC	2	6	2554862	2554867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_017160	CAT	2	6	2554883	2554888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_017160	ATG	2	6	2554932	2554937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_017160	TAAA	2	8	2554941	2554948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_017160	CAT	2	6	2554968	2554973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_017160	GTT	2	6	2555013	2555018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_017160	T	6	6	2555017	2555022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_017160	AAAT	2	8	2555024	2555031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_017160	ATC	2	6	2555045	2555050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_017160	TGA	2	6	2555052	2555057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_017160	TAG	2	6	2555089	2555094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_017160	TAT	2	6	2555117	2555122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_017160	TCTA	2	8	2555184	2555191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11035	NC_017160	T	7	7	2555299	2555305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_017160	AAT	2	6	2555336	2555341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_017160	TTC	2	6	2555395	2555400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_017160	TTA	2	6	2555403	2555408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_017160	AAAT	2	8	2555418	2555425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_017160	TG	3	6	2555477	2555482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_017160	T	6	6	2555487	2555492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_017160	TAA	2	6	2555499	2555504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_017160	ACCC	2	8	2557245	2557252	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11044	NC_017160	GGT	2	6	2557266	2557271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_017160	GAA	2	6	2557277	2557282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_017160	AAG	2	6	2558221	2558226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017160	A	6	6	2558230	2558235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_017160	AGC	2	6	2558246	2558251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11050	NC_017160	ATA	2	6	2558282	2558287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017160	AGAC	2	8	2558311	2558318	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11052	NC_017160	TAT	2	6	2558352	2558357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_017160	CGT	2	6	2558461	2558466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_017160	A	6	6	2558501	2558506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_017160	TAT	2	6	2558507	2558512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_017160	CCGG	2	8	2558535	2558542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11057	NC_017160	CGG	2	6	2558557	2558562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_017160	ATT	2	6	2558564	2558569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_017160	AGA	2	6	2558614	2558619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_017160	GTCG	2	8	2558680	2558687	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11061	NC_017160	GCT	2	6	2558752	2558757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_017160	TC	3	6	2558788	2558793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_017160	TCA	2	6	2558809	2558814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_017160	AAT	2	6	2558911	2558916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_017160	AG	3	6	2558922	2558927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_017160	GGA	2	6	2558942	2558947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11069	NC_017160	ATA	2	6	2559002	2559007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11074	NC_017160	TAT	2	6	2559738	2559743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11077	NC_017160	GTT	2	6	2559972	2559977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11082	NC_017160	C	7	7	2560384	2560390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11091	NC_017160	GCG	2	6	2563523	2563528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_017160	A	7	7	2563570	2563576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11097	NC_017160	T	6	6	2563711	2563716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_017160	GTT	2	6	2564977	2564982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_017160	ATC	2	6	2565036	2565041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_017160	ATCA	2	8	2565060	2565067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11101	NC_017160	TGT	2	6	2565074	2565079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_017160	CATTT	2	10	2565102	2565111	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11103	NC_017160	CG	3	6	2565117	2565122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11104	NC_017160	CTG	2	6	2565182	2565187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_017160	CAT	2	6	2565264	2565269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_017160	TCA	2	6	2565287	2565292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_017160	ATGCC	2	10	2565304	2565313	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11108	NC_017160	TCA	2	6	2565333	2565338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_017160	TAAT	2	8	2565458	2565465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017160	A	6	6	2565487	2565492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017160	TAA	2	6	2565493	2565498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_017160	CAT	2	6	2565501	2565506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_017160	ATC	2	6	2565541	2565546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_017160	CCA	2	6	2565659	2565664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_017160	AG	3	6	2565680	2565685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_017160	CGG	2	6	2566556	2566561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11118	NC_017160	GA	4	8	2566606	2566613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11122	NC_017160	ATT	2	6	2567497	2567502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_017160	T	7	7	2567537	2567543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_017160	ACC	2	6	2567552	2567557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11125	NC_017160	A	6	6	2567563	2567568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_017160	AAC	2	6	2567573	2567578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_017160	TCAT	2	8	2567603	2567610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11392	NC_017160	CAC	2	6	2619081	2619086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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