MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017160	CCT	2	6	2459447	2459452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_017160	AAT	2	6	2459504	2459509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_017160	AGGA	2	8	2459519	2459526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_017160	ATT	2	6	2460330	2460335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_017160	ACT	2	6	2460359	2460364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_017160	AGA	2	6	2460367	2460372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_017160	TCG	2	6	2460491	2460496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_017160	CAA	2	6	2460526	2460531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_017160	AT	3	6	2460536	2460541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_017160	CAT	2	6	2460547	2460552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_017160	AGC	2	6	2460610	2460615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_017160	GTCT	2	8	2460634	2460641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10513	NC_017160	TAC	2	6	2460655	2460660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_017160	CTTG	2	8	2460668	2460675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10515	NC_017160	TTG	2	6	2460689	2460694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_017160	CAA	2	6	2460792	2460797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_017160	TTC	2	6	2460833	2460838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_017160	TAGA	2	8	2461017	2461024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_017160	CAG	2	6	2461048	2461053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_017160	TTG	2	6	2461077	2461082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_017160	TGT	2	6	2461123	2461128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_017160	CAA	2	6	2461221	2461226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_017160	GGC	2	6	2461249	2461254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_017160	CCAG	2	8	2461303	2461310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10525	NC_017160	TG	3	6	2461332	2461337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_017160	TG	3	6	2461364	2461369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_017160	TAA	2	6	2461401	2461406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_017160	CTGA	2	8	2461408	2461415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10529	NC_017160	GCAC	2	8	2461823	2461830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10530	NC_017160	CAT	2	6	2461862	2461867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_017160	AAT	2	6	2461940	2461945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_017160	ATA	2	6	2461955	2461960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_017160	TGTTT	2	10	2462009	2462018	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_017160	GAA	2	6	2462036	2462041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_017160	GTT	2	6	2462055	2462060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_017160	CG	3	6	2462147	2462152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10537	NC_017160	CTG	2	6	2462168	2462173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_017160	TGC	2	6	2462176	2462181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_017160	GCT	3	9	2462183	2462191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_017160	CGG	2	6	2462272	2462277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_017160	TGG	2	6	2462332	2462337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_017160	GAT	2	6	2462645	2462650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_017160	GCC	2	6	2462701	2462706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10544	NC_017160	GCC	2	6	2462945	2462950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10545	NC_017160	AAC	2	6	2462991	2462996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_017160	AACC	2	8	2463038	2463045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10547	NC_017160	GCC	3	9	2463093	2463101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10548	NC_017160	AAT	2	6	2463102	2463107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_017160	CGG	2	6	2463124	2463129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_017160	CCG	2	6	2463157	2463162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_017160	CAG	2	6	2463237	2463242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_017160	GGT	3	9	2463275	2463283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_017160	CCGT	2	8	2463382	2463389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10554	NC_017160	AC	3	6	2463394	2463399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_017160	GCA	2	6	2463445	2463450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_017160	CTT	2	6	2463476	2463481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_017160	GCCG	2	8	2463498	2463505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10558	NC_017160	CTG	2	6	2463510	2463515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_017160	ACT	2	6	2463548	2463553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_017160	A	6	6	2463570	2463575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_017160	GCC	2	6	2463594	2463599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10562	NC_017160	AGA	2	6	2463656	2463661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_017160	AAG	2	6	2463675	2463680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_017160	CAG	2	6	2463684	2463689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_017160	TTA	2	6	2466938	2466943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10567	NC_017160	CCG	2	6	2466974	2466979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10568	NC_017160	CGCTG	2	10	2468280	2468289	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10569	NC_017160	CCGC	2	8	2468306	2468313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10570	NC_017160	GCA	2	6	2468395	2468400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_017160	GTTT	2	8	2468852	2468859	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_017160	T	6	6	2468893	2468898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_017160	AAT	2	6	2468949	2468954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_017160	GGT	2	6	2468968	2468973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_017160	TGG	2	6	2472356	2472361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_017160	TCA	2	6	2472511	2472516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10577	NC_017160	GCA	2	6	2472543	2472548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10578	NC_017160	TCAT	2	8	2472573	2472580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10579	NC_017160	CAC	2	6	2472602	2472607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10580	NC_017160	T	6	6	2473551	2473556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_017160	ATT	2	6	2473576	2473581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_017160	CA	3	6	2473598	2473603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10583	NC_017160	CA	4	8	2473605	2473612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10584	NC_017160	TG	3	6	2473636	2473641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_017160	TG	3	6	2473645	2473650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_017160	TGA	2	6	2473736	2473741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10591	NC_017160	TA	3	6	2474404	2474409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_017160	AT	3	6	2474453	2474458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_017160	TCA	2	6	2474462	2474467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_017160	AGA	2	6	2474495	2474500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_017160	CAT	2	6	2474572	2474577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_017160	TCA	3	9	2475561	2475569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_017160	TCC	2	6	2478208	2478213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10598	NC_017160	CCA	2	6	2480539	2480544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_017160	TGA	2	6	2480552	2480557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_017160	GAC	2	6	2480589	2480594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_017160	CG	3	6	2480672	2480677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10602	NC_017160	TCA	3	9	2480701	2480709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_017160	AGT	2	6	2482592	2482597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10605	NC_017160	A	7	7	2482742	2482748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_017160	TG	4	8	2483801	2483808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_017160	GAAT	2	8	2484860	2484867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10610	NC_017160	AAT	3	9	2484916	2484924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_017160	CAG	2	6	2486626	2486631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_017160	CGA	2	6	2486633	2486638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_017160	TGC	2	6	2488187	2488192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10615	NC_017160	GCA	2	6	2488266	2488271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_017160	CAT	2	6	2488286	2488291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10618	NC_017160	TGC	2	6	2488352	2488357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_017160	CGC	2	6	2488394	2488399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10620	NC_017160	GC	3	6	2490269	2490274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10621	NC_017160	TAT	2	6	2490336	2490341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_017160	GCG	2	6	2490345	2490350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_017160	ATG	2	6	2490361	2490366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_017160	C	6	6	2490367	2490372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10625	NC_017160	TCT	2	6	2493002	2493007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_017160	TGA	2	6	2493044	2493049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10628	NC_017160	CTG	2	6	2493114	2493119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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