MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017160	GGT	2	6	2388727	2388732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017160	CAC	2	6	2388760	2388765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_017160	CGA	2	6	2388774	2388779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_017160	GCA	3	9	2388817	2388825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017160	GCT	2	6	2388847	2388852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_017160	GCC	2	6	2388863	2388868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_017160	TTC	2	6	2388917	2388922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_017160	ATCC	2	8	2388935	2388942	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_017160	GCC	2	6	2389107	2389112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_017160	CGC	2	6	2389245	2389250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_017160	CTGG	2	8	2389255	2389262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10012	NC_017160	ATC	2	6	2389263	2389268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_017160	CGC	2	6	2389387	2389392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_017160	CCG	2	6	2389441	2389446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_017160	CGA	2	6	2389582	2389587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_017160	GCG	2	6	2389601	2389606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_017160	TGA	2	6	2389612	2389617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_017160	TGA	2	6	2389666	2389671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_017160	GCTG	2	8	2389689	2389696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10020	NC_017160	CTG	2	6	2389823	2389828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_017160	AG	3	6	2389856	2389861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_017160	ACG	2	6	2389995	2390000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_017160	AGC	2	6	2390046	2390051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_017160	GCC	2	6	2390123	2390128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_017160	ATG	2	6	2390277	2390282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_017160	ACG	2	6	2390385	2390390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_017160	GTC	2	6	2390399	2390404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_017160	CGG	2	6	2390440	2390445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_017160	CCG	3	9	2390539	2390547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10030	NC_017160	AGG	2	6	2390583	2390588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_017160	TCG	2	6	2390639	2390644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_017160	CTG	2	6	2390660	2390665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_017160	A	6	6	2390699	2390704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_017160	CAG	2	6	2390723	2390728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_017160	CGC	2	6	2390784	2390789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10037	NC_017160	G	6	6	2390843	2390848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_017160	GCT	2	6	2390890	2390895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10040	NC_017160	GGC	2	6	2391058	2391063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_017160	CGCT	2	8	2391165	2391172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_017160	GCAA	2	8	2391202	2391209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_017160	CGC	2	6	2391213	2391218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_017160	GAT	2	6	2391241	2391246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_017160	CGT	2	6	2391269	2391274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10047	NC_017160	GCG	2	6	2391329	2391334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_017160	CTG	2	6	2391434	2391439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10050	NC_017160	CAGC	2	8	2391505	2391512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_017160	ACA	2	6	2391593	2391598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_017160	CTG	2	6	2391607	2391612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_017160	ACTG	2	8	2391618	2391625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10054	NC_017160	GCC	2	6	2391673	2391678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_017160	CG	3	6	2391687	2391692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_017160	CAG	2	6	2391701	2391706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_017160	CGA	2	6	2391738	2391743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_017160	AGCC	2	8	2391756	2391763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_017160	ATG	2	6	2391775	2391780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_017160	C	6	6	2391785	2391790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10061	NC_017160	GCCC	2	8	2392990	2392997	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10062	NC_017160	CAC	2	6	2395389	2395394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_017160	CAG	2	6	2397556	2397561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_017160	A	6	6	2397568	2397573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_017160	ATT	2	6	2397589	2397594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10069	NC_017160	TA	3	6	2397730	2397735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_017160	ACAA	2	8	2397767	2397774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10072	NC_017160	TAA	2	6	2397796	2397801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_017160	AC	3	6	2397815	2397820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_017160	CTCAA	2	10	2397822	2397831	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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10076	NC_017160	A	8	8	2398000	2398007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10083	NC_017160	CATA	2	8	2398114	2398121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10084	NC_017160	ACT	2	6	2398143	2398148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10095	NC_017160	ATGC	2	8	2398618	2398625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10096	NC_017160	TTTA	2	8	2398640	2398647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10098	NC_017160	C	7	7	2398713	2398719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10099	NC_017160	TCCCC	2	10	2398774	2398783	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10100	NC_017160	TAT	2	6	2398814	2398819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10102	NC_017160	T	7	7	2399388	2399394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10105	NC_017160	TAC	2	6	2399450	2399455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10112	NC_017160	GCA	2	6	2400477	2400482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10118	NC_017160	CAGT	2	8	2400720	2400727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_017160	TAAA	2	8	2400789	2400796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10127	NC_017160	TACC	2	8	2402987	2402994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_017160	CAATG	2	10	2403007	2403016	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10129	NC_017160	TCC	2	6	2403129	2403134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10130	NC_017160	CAC	2	6	2403167	2403172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10131	NC_017160	CGT	2	6	2403215	2403220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_017160	CCA	2	6	2403259	2403264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10133	NC_017160	TGG	2	6	2403312	2403317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_017160	TGG	2	6	2403324	2403329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_017160	ATT	2	6	2403362	2403367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10137	NC_017160	A	6	6	2403683	2403688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_017160	GCG	2	6	2403740	2403745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_017160	TGT	2	6	2403760	2403765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10141	NC_017160	TCT	2	6	2403831	2403836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10143	NC_017160	CTC	2	6	2404825	2404830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10144	NC_017160	CTTC	2	8	2404831	2404838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10145	NC_017160	ATTTC	2	10	2406548	2406557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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10147	NC_017160	CATT	2	8	2409035	2409042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10148	NC_017160	ATT	2	6	2409048	2409053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10151	NC_017160	AGG	2	6	2409221	2409226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10154	NC_017160	ATGG	2	8	2409306	2409313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_017160	CGATGG	2	12	2409314	2409325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10156	NC_017160	AGCC	2	8	2409338	2409345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10159	NC_017160	TACA	2	8	2409516	2409523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10160	NC_017160	TATC	2	8	2410388	2410395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10162	NC_017160	TAT	2	6	2410433	2410438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_017160	T	6	6	2410494	2410499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_017160	CA	3	6	2410576	2410581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10165	NC_017160	CCT	2	6	2410664	2410669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10169	NC_017160	TAT	2	6	2410924	2410929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10172	NC_017160	ATT	2	6	2411121	2411126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10190	NC_017160	CCAT	2	8	2415214	2415221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10197	NC_017160	AATA	2	8	2415718	2415725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10200	NC_017160	CG	4	8	2415805	2415812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10203	NC_017160	CGGG	2	8	2415985	2415992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10204	NC_017160	CGG	2	6	2416045	2416050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10229	NC_017160	ATT	2	6	2417815	2417820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10234	NC_017160	CAG	2	6	2418049	2418054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10242	NC_017160	GTA	2	6	2419815	2419820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_017160	CAAG	2	8	2419832	2419839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10244	NC_017160	GTT	2	6	2419865	2419870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_017160	A	7	7	2419877	2419883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_017160	A	6	6	2419927	2419932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_017160	AAC	2	6	2419961	2419966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10249	NC_017160	AG	3	6	2420134	2420139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_017160	CAT	2	6	2420152	2420157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_017160	CAC	2	6	2420192	2420197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10252	NC_017160	AAT	2	6	2420218	2420223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_017160	CAT	2	6	2420237	2420242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_017160	ATA	2	6	2420314	2420319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_017160	TAA	2	6	2420345	2420350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_017160	A	6	6	2420375	2420380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_017160	TA	3	6	2420388	2420393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_017160	CAG	2	6	2420420	2420425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10259	NC_017160	TTA	2	6	2420505	2420510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_017160	CAAT	2	8	2420514	2420521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10261	NC_017160	ACAA	2	8	2420619	2420626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10262	NC_017160	ACC	2	6	2420629	2420634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10263	NC_017160	CAT	2	6	2420647	2420652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10264	NC_017160	AT	4	8	2420678	2420685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_017160	CAA	2	6	2420715	2420720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10266	NC_017160	ATA	2	6	2420721	2420726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10267	NC_017160	A	7	7	2420758	2420764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10268	NC_017160	ATAAA	2	10	2420773	2420782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10269	NC_017160	ATT	2	6	2420796	2420801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10271	NC_017160	ATTTT	2	10	2420812	2420821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10272	NC_017160	T	7	7	2420846	2420852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10273	NC_017160	T	6	6	2420890	2420895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10274	NC_017160	T	6	6	2420928	2420933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10278	NC_017160	CAG	2	6	2421098	2421103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10280	NC_017160	TAT	2	6	2421157	2421162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10285	NC_017160	AATA	2	8	2421253	2421260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10287	NC_017160	TATT	2	8	2421368	2421375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10288	NC_017160	TGAT	2	8	2421394	2421401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10289	NC_017160	GAATA	2	10	2421447	2421456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10290	NC_017160	TAT	2	6	2421492	2421497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10293	NC_017160	TC	3	6	2421564	2421569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10385	NC_017160	ATTA	2	8	2430653	2430660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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