MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017160	CAC	2	6	2168694	2168699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9002	NC_017160	TGC	2	6	2169820	2169825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_017160	CGA	3	9	2169934	2169942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_017160	C	6	6	2169988	2169993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9005	NC_017160	AAG	2	6	2170000	2170005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_017160	TGGG	2	8	2170050	2170057	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_017160	CGTT	2	8	2170058	2170065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9008	NC_017160	CCA	2	6	2170079	2170084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9009	NC_017160	GT	4	8	2170106	2170113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_017160	TGA	2	6	2170131	2170136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_017160	TGA	2	6	2170323	2170328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_017160	A	6	6	2170346	2170351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_017160	AAGA	2	8	2170369	2170376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_017160	CTG	2	6	2170412	2170417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_017160	GTA	2	6	2170427	2170432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_017160	TGA	2	6	2170458	2170463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_017160	TAA	2	6	2170552	2170557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_017160	TCA	3	9	2170591	2170599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_017160	TGC	2	6	2170716	2170721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_017160	TACC	2	8	2170760	2170767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9021	NC_017160	AATG	2	8	2170834	2170841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_017160	ATT	2	6	2170899	2170904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_017160	GGA	2	6	2171016	2171021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_017160	T	6	6	2171092	2171097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_017160	T	6	6	2171147	2171152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_017160	GAT	2	6	2171771	2171776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_017160	CAC	2	6	2171777	2171782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_017160	GTG	2	6	2171803	2171808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_017160	CAA	2	6	2171837	2171842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_017160	CCA	2	6	2171876	2171881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9031	NC_017160	A	7	7	2171911	2171917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_017160	GTT	2	6	2171936	2171941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_017160	GCT	2	6	2172022	2172027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_017160	TAA	2	6	2172184	2172189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_017160	ACA	2	6	2172194	2172199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_017160	AAT	2	6	2172249	2172254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_017160	TCT	2	6	2172346	2172351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_017160	TAT	2	6	2172353	2172358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_017160	T	6	6	2172426	2172431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_017160	TCA	2	6	2172478	2172483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_017160	GGT	2	6	2172587	2172592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_017160	CTGTT	2	10	2172855	2172864	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9043	NC_017160	TCA	2	6	2172928	2172933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_017160	CAC	3	9	2172934	2172942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9045	NC_017160	T	6	6	2172994	2172999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_017160	ATT	2	6	2173065	2173070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_017160	CGGCG	2	10	2173544	2173553	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9048	NC_017160	ATC	2	6	2174264	2174269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_017160	CGG	2	6	2174299	2174304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_017160	GCG	2	6	2174309	2174314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_017160	TGG	2	6	2174318	2174323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_017160	TG	3	6	2174346	2174351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_017160	CAA	2	6	2174363	2174368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_017160	TAA	2	6	2174387	2174392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_017160	ACT	2	6	2174393	2174398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9056	NC_017160	ACA	2	6	2174419	2174424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_017160	AGA	2	6	2174599	2174604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_017160	CGCC	2	8	2174650	2174657	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9059	NC_017160	ATGG	2	8	2174665	2174672	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_017160	ATAC	2	8	2174683	2174690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9061	NC_017160	AAT	2	6	2174728	2174733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_017160	ACA	2	6	2174736	2174741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_017160	AGG	2	6	2174789	2174794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_017160	CAA	2	6	2174833	2174838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_017160	ACG	2	6	2174925	2174930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_017160	CCA	2	6	2174956	2174961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_017160	TTA	2	6	2178105	2178110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_017160	TAAA	2	8	2178583	2178590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_017160	GCC	2	6	2178635	2178640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9071	NC_017160	AC	3	6	2179358	2179363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_017160	AT	3	6	2180486	2180491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_017160	CGG	2	6	2180666	2180671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9079	NC_017160	AGGT	2	8	2180850	2180857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_017160	CTC	2	6	2181010	2181015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9081	NC_017160	TGA	2	6	2181136	2181141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_017160	CCA	2	6	2181145	2181150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9083	NC_017160	ATGA	3	12	2181188	2181199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_017160	TC	3	6	2181204	2181209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9085	NC_017160	AAAT	2	8	2181210	2181217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_017160	ATC	2	6	2181298	2181303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9089	NC_017160	GTAAA	2	10	2181353	2181362	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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9092	NC_017160	AT	3	6	2181498	2181503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_017160	CTT	2	6	2183158	2183163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9094	NC_017160	A	6	6	2183174	2183179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_017160	TCG	2	6	2183217	2183222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9096	NC_017160	ACCTG	2	10	2183260	2183269	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9097	NC_017160	AT	3	6	2183299	2183304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_017160	GATC	2	8	2183308	2183315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9099	NC_017160	TGC	2	6	2183322	2183327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_017160	GAT	2	6	2183351	2183356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_017160	GAA	2	6	2183396	2183401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_017160	TCT	2	6	2183416	2183421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_017160	TATT	2	8	2183436	2183443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_017160	TA	4	8	2183471	2183478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_017160	CAT	2	6	2183484	2183489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9108	NC_017160	CAA	2	6	2184879	2184884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9109	NC_017160	GTT	2	6	2184902	2184907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_017160	GAT	2	6	2184908	2184913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_017160	GTTT	2	8	2186707	2186714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_017160	T	6	6	2186749	2186754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_017160	A	9	9	2186775	2186783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_017160	AATAAA	2	12	2186798	2186809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9116	NC_017160	ATA	2	6	2186846	2186851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_017160	GATT	2	8	2186857	2186864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_017160	CT	3	6	2186868	2186873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9119	NC_017160	GCG	2	6	2186923	2186928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_017160	AAT	2	6	2186967	2186972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_017160	GCA	2	6	2186993	2186998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9123	NC_017160	ACTC	2	8	2187093	2187100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9124	NC_017160	TC	3	6	2187190	2187195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_017160	TAA	2	6	2187898	2187903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_017160	TAATA	2	10	2187936	2187945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_017160	ATA	2	6	2187961	2187966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_017160	AAAT	2	8	2188718	2188725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_017160	GC	3	6	2188739	2188744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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