MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D182038 chromosome

Total Repeats: 20285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017160	GAT	2	6	1121040	1121045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017160	TAA	2	6	1121986	1121991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017160	CCG	2	6	1122014	1122019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_017160	ATT	2	6	1122023	1122028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_017160	ATT	2	6	1122047	1122052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017160	TGA	2	6	1122061	1122066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017160	G	6	6	1124455	1124460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017160	GTTT	2	8	1124520	1124527	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_017160	GA	3	6	1124686	1124691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017160	CAT	2	6	1124700	1124705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_017160	GTT	2	6	1124746	1124751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017160	GAT	2	6	1124788	1124793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017160	CGC	2	6	1124804	1124809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_017160	CCG	2	6	1124868	1124873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_017160	GCG	2	6	1124886	1124891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_017160	AGG	2	6	1124921	1124926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017160	TTG	2	6	1124930	1124935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017160	CTG	2	6	1125005	1125010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_017160	TCT	2	6	1125037	1125042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_017160	CAT	2	6	1125055	1125060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_017160	GTGGCG	2	12	1125092	1125103	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4522	NC_017160	G	6	6	1125131	1125136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017160	CGGG	2	8	1125186	1125193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_017160	GTG	2	6	1125211	1125216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017160	TGG	2	6	1125243	1125248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017160	TCC	2	6	1125274	1125279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_017160	TGA	2	6	1125366	1125371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017160	GTTGGC	2	12	1125435	1125446	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4529	NC_017160	ATG	2	6	1125473	1125478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017160	TG	3	6	1125499	1125504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017160	AGC	2	6	1125574	1125579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_017160	CAA	2	6	1125619	1125624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_017160	GTG	2	6	1125680	1125685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017160	GCCA	2	8	1125813	1125820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_017160	CCG	2	6	1125840	1125845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_017160	TGT	2	6	1125879	1125884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_017160	TACC	2	8	1125925	1125932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_017160	CAT	3	9	1125974	1125982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_017160	CAG	2	6	1125983	1125988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_017160	GGTT	2	8	1125996	1126003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017160	TGG	2	6	1126046	1126051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017160	ATC	2	6	1126123	1126128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_017160	CAC	2	6	1126167	1126172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_017160	GC	3	6	1126181	1126186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_017160	TGA	2	6	1126255	1126260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017160	GTG	2	6	1126293	1126298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017160	ATG	2	6	1126314	1126319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017160	CAA	2	6	1126349	1126354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_017160	CTCC	2	8	1126374	1126381	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4550	NC_017160	ATT	2	6	1126459	1126464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017160	A	6	6	1126470	1126475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017160	GCTG	2	8	1126549	1126556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4553	NC_017160	GGT	2	6	1126786	1126791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017160	GCA	2	6	1126837	1126842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_017160	GCC	2	6	1126972	1126977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_017160	ATT	2	6	1126992	1126997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017160	TGG	2	6	1127040	1127045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017160	GCTG	2	8	1127167	1127174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_017160	AGT	2	6	1127196	1127201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017160	AAT	2	6	1127225	1127230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017160	T	6	6	1127257	1127262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017160	T	9	9	1127292	1127300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017160	AC	3	6	1127342	1127347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_017160	ATT	2	6	1127353	1127358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017160	TGTC	2	8	1130787	1130794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_017160	CTG	2	6	1130826	1130831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_017160	TTG	2	6	1130922	1130927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017160	ATA	2	6	1131006	1131011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017160	TAA	2	6	1131369	1131374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017160	TA	3	6	1131375	1131380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017160	CAA	2	6	1131436	1131441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_017160	CGT	2	6	1131445	1131450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_017160	TTC	2	6	1131469	1131474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_017160	TC	3	6	1131473	1131478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_017160	AGGG	2	8	1131598	1131605	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017160	TC	3	6	1131658	1131663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_017160	CGT	2	6	1131664	1131669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_017160	GAT	2	6	1131725	1131730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017160	CCTT	2	8	1132795	1132802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_017160	GTT	2	6	1132863	1132868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017160	A	6	6	1132975	1132980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017160	TAAT	2	8	1133094	1133101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017160	TCA	2	6	1133119	1133124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_017160	TAATG	2	10	1133138	1133147	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017160	TGA	2	6	1133151	1133156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4587	NC_017160	AAT	2	6	1133949	1133954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017160	AAT	2	6	1134035	1134040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017160	T	6	6	1134133	1134138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017160	T	6	6	1134152	1134157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017160	ACA	2	6	1134211	1134216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_017160	AT	3	6	1134254	1134259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017160	TTG	2	6	1134281	1134286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017160	T	8	8	1134297	1134304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017160	T	6	6	1134306	1134311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017160	T	6	6	1134313	1134318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017160	TGAA	2	8	1137396	1137403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017160	AAG	2	6	1137473	1137478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017160	TTG	2	6	1137483	1137488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017160	TGGCCT	2	12	1137523	1137534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_017160	TAT	2	6	1137539	1137544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017160	T	6	6	1139342	1139347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017160	T	6	6	1139364	1139369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017160	AATAA	2	10	1142839	1142848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017160	TCC	2	6	1142852	1142857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_017160	AG	3	6	1143598	1143603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017160	CCT	2	6	1143648	1143653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_017160	TGG	2	6	1143801	1143806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017160	A	6	6	1143858	1143863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017160	GAT	2	6	1143996	1144001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017160	ATC	2	6	1147621	1147626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_017160	TTG	2	6	1151737	1151742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017160	CAG	2	6	1151760	1151765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_017160	AC	3	6	1152937	1152942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_017160	CAT	2	6	1153515	1153520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_017160	CAG	2	6	1153661	1153666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_017160	ATAA	2	8	1153676	1153683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017160	AGCA	2	8	1154727	1154734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_017160	TGT	2	6	1154775	1154780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017160	CAT	2	6	1154823	1154828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_017160	TGC	2	6	1154870	1154875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_017160	TTA	2	6	1154989	1154994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017160	TAA	2	6	1155020	1155025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017160	CAGG	2	8	1155026	1155033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_017160	A	6	6	1155035	1155040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017160	CCA	2	6	1155248	1155253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_017160	CAA	2	6	1155280	1155285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_017160	GA	3	6	1155289	1155294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017160	TCA	2	6	1157980	1157985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_017160	GCT	2	6	1158034	1158039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_017160	CCCAGA	2	12	1158054	1158065	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_017160	A	8	8	1158091	1158098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_017160	GTC	2	6	1158156	1158161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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