MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 19516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017154	TTC	2	6	1032702	1032707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017154	AGT	2	6	1033232	1033237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017154	T	6	6	1033376	1033381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017154	GAT	2	6	1034604	1034609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017154	TAA	2	6	1034713	1034718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017154	CT	3	6	1034833	1034838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_017154	CAA	2	6	1034972	1034977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017154	TCA	2	6	1035010	1035015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017154	ATAA	2	8	1035065	1035072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017154	GAT	2	6	1035075	1035080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017154	TTA	2	6	1035092	1035097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017154	AAC	2	6	1035116	1035121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017154	CA	3	6	1035156	1035161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_017154	CAT	2	6	1035227	1035232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017154	GCAAG	2	10	1035310	1035319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4016	NC_017154	TGA	2	6	1036621	1036626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017154	TGC	2	6	1036640	1036645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017154	GGA	2	6	1036702	1036707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017154	AAG	2	6	1036776	1036781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017154	CAAG	2	8	1036786	1036793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_017154	TA	3	6	1036804	1036809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017154	ATC	2	6	1036936	1036941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017154	T	6	6	1036953	1036958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017154	TGG	2	6	1036988	1036993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017154	ATA	2	6	1037057	1037062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017154	GGC	2	6	1037068	1037073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017154	TA	3	6	1037112	1037117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017154	AAT	2	6	1037230	1037235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017154	TGA	3	9	1037236	1037244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017154	GTT	2	6	1037267	1037272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017154	G	6	6	1037293	1037298	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017154	AGA	2	6	1037341	1037346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017154	AGC	2	6	1037401	1037406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017154	TTA	2	6	1037467	1037472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017154	GGA	2	6	1037521	1037526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017154	TTTG	2	8	1037593	1037600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017154	CAGA	2	8	1037623	1037630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_017154	TCA	2	6	1037680	1037685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017154	TAAA	2	8	1037707	1037714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017154	ATT	2	6	1037755	1037760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017154	GAA	2	6	1037813	1037818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017154	GCT	2	6	1037870	1037875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017154	CAT	2	6	1037944	1037949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_017154	GCA	2	6	1037989	1037994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017154	ATGG	2	8	1038111	1038118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017154	CCT	2	6	1038120	1038125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_017154	CGT	2	6	1041037	1041042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017154	TTG	2	6	1041088	1041093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017154	GA	3	6	1041111	1041116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017154	ACTC	2	8	1041165	1041172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_017154	TATTT	2	10	1041173	1041182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017154	T	7	7	1041180	1041186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017154	AATAAA	2	12	1041206	1041217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017154	T	6	6	1041222	1041227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017154	TTG	2	6	1041277	1041282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017154	TG	3	6	1041281	1041286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017154	AATA	2	8	1041584	1041591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017154	ATA	2	6	1041594	1041599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017154	TTA	2	6	1042420	1042425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017154	TGA	2	6	1042522	1042527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017154	AATA	2	8	1042531	1042538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017154	GCA	2	6	1042550	1042555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_017154	GGC	2	6	1042934	1042939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_017154	CGA	2	6	1042967	1042972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017154	AT	3	6	1044029	1044034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017154	AT	3	6	1044048	1044053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017154	AAGA	2	8	1044064	1044071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017154	A	8	8	1044075	1044082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017154	AT	3	6	1044084	1044089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017154	A	6	6	1044220	1044225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017154	G	6	6	1044274	1044279	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017154	TCAG	2	8	1044293	1044300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_017154	CTA	2	6	1044335	1044340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017154	AT	3	6	1044381	1044386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017154	AGC	2	6	1044421	1044426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017154	ATA	2	6	1045348	1045353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017154	GCTT	2	8	1045417	1045424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_017154	TGT	3	9	1045476	1045484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017154	GGT	2	6	1045518	1045523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017154	TA	4	8	1045534	1045541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017154	TC	3	6	1045595	1045600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_017154	TGC	2	6	1045604	1045609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017154	ACGA	2	8	1046282	1046289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_017154	ATA	2	6	1046317	1046322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017154	ATTAA	2	10	1046367	1046376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017154	CAT	2	6	1046406	1046411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017154	CT	3	6	1046474	1046479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_017154	T	6	6	1046495	1046500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017154	ATAA	2	8	1046529	1046536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017154	TCT	2	6	1046549	1046554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017154	CTA	2	6	1046559	1046564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017154	GAT	2	6	1046566	1046571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017154	GAATG	2	10	1046650	1046659	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017154	AAT	2	6	1046710	1046715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017154	ATT	2	6	1046742	1046747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017154	TGA	2	6	1046792	1046797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017154	CAG	2	6	1046922	1046927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017154	ATC	2	6	1046955	1046960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017154	TC	3	6	1046959	1046964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_017154	ACTT	2	8	1047987	1047994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_017154	TA	3	6	1048014	1048019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017154	TG	3	6	1048041	1048046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017154	A	6	6	1048091	1048096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017154	GTAA	2	8	1048097	1048104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017154	GCA	2	6	1048150	1048155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_017154	TC	3	6	1048192	1048197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_017154	GCC	2	6	1048200	1048205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_017154	AATT	2	8	1048219	1048226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017154	TAA	2	6	1048238	1048243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017154	TTG	2	6	1048246	1048251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017154	TTG	2	6	1048262	1048267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017154	T	7	7	1048293	1048299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017154	T	7	7	1048339	1048345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017154	TTG	2	6	1048353	1048358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017154	ATT	2	6	1048384	1048389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017154	G	9	9	1049412	1049420	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017154	TAA	2	6	1049453	1049458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017154	GAAC	2	8	1050999	1051006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_017154	ACT	2	6	1051022	1051027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017154	A	6	6	1051037	1051042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017154	CAA	2	6	1051057	1051062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017154	CAAA	2	8	1051078	1051085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_017154	T	6	6	1051124	1051129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017154	ATCTG	2	10	1051144	1051153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4125	NC_017154	ATG	2	6	1051154	1051159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017154	CAT	2	6	1051316	1051321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017154	AGA	2	6	1051326	1051331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017154	AT	3	6	1051505	1051510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017154	TCAG	2	8	1052655	1052662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_017154	CA	3	6	1052671	1052676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_017154	T	6	6	1052692	1052697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017154	TGA	2	6	1052739	1052744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_017154	CA	3	6	1052819	1052824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_017154	ATG	2	6	1052825	1052830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_017154	TGA	2	6	1054370	1054375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_017154	AAG	2	6	1054376	1054381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4145	NC_017154	TTA	2	6	1055771	1055776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4147	NC_017154	GGTG	2	8	1055817	1055824	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_017154	GTAC	2	8	1055855	1055862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4150	NC_017154	T	7	7	1059924	1059930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_017154	CCA	2	6	1059969	1059974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4153	NC_017154	A	6	6	1060351	1060356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_017154	ATT	2	6	1062011	1062016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4167	NC_017154	T	6	6	1062089	1062094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_017154	CTTCCT	2	12	1087098	1087109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4247	NC_017154	AATG	2	8	1095567	1095574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_017154	ATT	2	6	1095592	1095597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_017154	T	6	6	1096692	1096697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_017154	T	6	6	1096720	1096725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_017154	TAA	2	6	1096731	1096736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_017154	TTA	2	6	1096833	1096838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_017154	A	8	8	1096868	1096875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_017154	A	8	8	1096879	1096886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_017154	GTGG	2	8	1096900	1096907	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_017154	CA	3	6	1096915	1096920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_017154	AAG	2	6	1096954	1096959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_017154	TCA	2	6	1096985	1096990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_017154	GTCA	2	8	1096998	1097005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4261	NC_017154	ATCA	2	8	1097012	1097019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4262	NC_017154	GCA	2	6	1097090	1097095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4263	NC_017154	TCC	2	6	1097127	1097132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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