MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) plasmid 105.5R(r)p

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015475	ACT	2	6	705	710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015475	TAA	2	6	740	745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015475	ACTC	2	8	770	777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015475	ATT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015475	GTA	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015475	AT	3	6	910	915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015475	ATT	2	6	917	922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015475	TAT	2	6	950	955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015475	AACAT	2	10	986	995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015475	TAA	2	6	1022	1027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015475	A	6	6	1048	1053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015475	ACA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015475	AAT	2	6	1191	1196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015475	AAT	2	6	2637	2642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015475	TA	3	6	2669	2674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015475	TAT	2	6	2717	2722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015475	AAT	2	6	2766	2771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015475	T	6	6	2774	2779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015475	TAA	2	6	2835	2840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015475	CCA	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015475	TTGG	2	8	2873	2880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015475	TA	4	8	2885	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015475	TTG	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015475	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015475	AAG	2	6	2987	2992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015475	TGC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015475	AGC	2	6	3015	3020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015475	AAT	2	6	3038	3043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015475	A	6	6	3070	3075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015475	A	6	6	3219	3224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015475	GAA	2	6	3288	3293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015475	GTC	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015475	TAT	2	6	3327	3332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015475	TGA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015475	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015475	AGTC	2	8	3423	3430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015475	A	6	6	3462	3467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015475	GTA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015475	A	6	6	3486	3491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015475	TTA	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015475	GTC	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015475	GGCT	2	8	3653	3660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015475	TA	3	6	3696	3701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015475	GT	3	6	3724	3729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015475	A	7	7	3765	3771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015475	TGT	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015475	ATG	2	6	3847	3852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015475	ATT	2	6	3888	3893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015475	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015475	AGA	2	6	3980	3985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015475	GCA	2	6	4104	4109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015475	TTAT	2	8	4164	4171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015475	GTCAG	2	10	4172	4181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015475	GGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015475	TGG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015475	TTTA	2	8	4336	4343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015475	A	6	6	4366	4371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015475	AGC	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015475	T	6	6	4610	4615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015475	GAG	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015475	GGT	2	6	4695	4700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015475	TTTA	2	8	4716	4723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015475	ATA	2	6	4808	4813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015475	TAA	2	6	4835	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015475	CGG	2	6	4859	4864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015475	TGC	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015475	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015475	AAT	2	6	4913	4918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015475	AAC	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015475	GTC	2	6	5031	5036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015475	T	6	6	5110	5115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015475	ATT	2	6	5145	5150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015475	GCT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015475	GCA	2	6	5176	5181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015475	CTT	2	6	5195	5200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015475	T	6	6	5222	5227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015475	CAA	2	6	5229	5234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015475	CAG	2	6	5332	5337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015475	A	6	6	5486	5491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015475	TCT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015475	AGA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015475	CGA	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015475	TA	8	16	5894	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015475	AAAT	2	8	7159	7166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015475	CTA	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015475	TTTTA	2	10	7673	7682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015475	TTA	2	6	7702	7707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015475	TAA	2	6	7717	7722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015475	TA	3	6	7776	7781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015475	TAAAA	2	10	7811	7820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015475	TTAA	2	8	7828	7835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015475	TCC	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015475	CCT	2	6	11757	11762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015475	TTATTT	2	12	11774	11785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015475	ATG	2	6	15385	15390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015475	ACT	2	6	16536	16541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015475	TGC	2	6	16631	16636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015475	T	6	6	16675	16680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015475	TCA	2	6	16755	16760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015475	GTAG	2	8	16777	16784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015475	TTG	2	6	23789	23794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015475	T	6	6	23828	23833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015475	CAA	2	6	23898	23903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015475	AT	3	6	23924	23929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015475	AT	3	6	23946	23951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015475	T	7	7	24029	24035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015475	ATA	2	6	24047	24052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015475	TGTT	2	8	24077	24084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015475	CTTT	2	8	24112	24119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015475	GAAA	2	8	24123	24130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015475	TAAAT	2	10	24174	24183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015475	GTT	2	6	24221	24226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015475	AAT	2	6	24234	24239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015475	CAC	2	6	24246	24251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015475	ATC	2	6	24275	24280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015475	TCT	2	6	24287	24292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015475	TAT	2	6	24327	24332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015475	TCA	2	6	24338	24343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015475	TTTCT	2	10	24344	24353	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015475	C	7	7	24371	24377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_015475	TAT	2	6	24721	24726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015475	TTGGTT	2	12	24728	24739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015475	CGCA	2	8	24762	24769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015475	TAA	2	6	24770	24775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015475	AT	3	6	24798	24803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015475	T	11	11	25663	25673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015475	ATC	2	6	25896	25901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015475	TA	3	6	25908	25913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015475	GGT	2	6	25914	25919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015475	T	7	7	25938	25944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015475	TTAT	2	8	26004	26011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015475	AT	3	6	33197	33202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015475	TAT	2	6	33216	33221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015475	AAT	2	6	33284	33289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015475	T	6	6	33289	33294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015475	A	7	7	33323	33329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015475	ATAA	2	8	33360	33367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015475	ATA	2	6	33759	33764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015475	TA	3	6	33763	33768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015475	ATA	2	6	33788	33793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015475	AAG	2	6	33824	33829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015475	AAT	3	9	33864	33872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015475	CCT	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015475	CTC	2	6	33924	33929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_015475	AT	3	6	34135	34140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015475	ATG	3	9	34149	34157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015475	ATT	2	6	34195	34200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015475	T	6	6	34228	34233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015475	A	6	6	34234	34239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015475	TA	3	6	34257	34262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015475	A	6	6	34279	34284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015475	TAA	2	6	34298	34303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015475	ATA	2	6	34348	34353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015475	A	6	6	34370	34375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015475	T	6	6	34378	34383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015475	TTAAT	2	10	34418	34427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_015475	CGA	2	6	48332	48337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_015475	TAAT	2	8	48474	48481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015475	AT	3	6	48480	48485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015475	CGATTA	2	12	49954	49965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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292	NC_015475	TAT	2	6	50885	50890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015475	TTA	2	6	50943	50948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_015475	AAAAC	2	10	51102	51111	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_015475	TCAT	2	8	51145	51152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
297	NC_015475	TGC	2	6	51612	51617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_015475	TG	3	6	51718	51723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_015475	GCAGC	2	10	54887	54896	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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322	NC_015475	CTG	2	6	57012	57017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_015475	CTGAC	2	10	57037	57046	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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325	NC_015475	CTG	2	6	57108	57113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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333	NC_015475	AT	3	6	57516	57521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_015475	GCG	2	6	69650	69655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.