MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r) chromosome

Total Repeats: 17321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015224	TTAA	2	8	4463396	4463403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_015224	T	7	7	4463437	4463443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_015224	GCC	2	6	4463446	4463451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17004	NC_015224	GAT	2	6	4463468	4463473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_015224	CAAT	2	8	4464146	4464153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17006	NC_015224	GCG	2	6	4464231	4464236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17007	NC_015224	GCC	2	6	4464240	4464245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17008	NC_015224	TAA	2	6	4464510	4464515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_015224	TGAT	2	8	4464542	4464549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_015224	CAGG	2	8	4466562	4466569	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17011	NC_015224	AATT	2	8	4467357	4467364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_015224	AT	3	6	4467393	4467398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_015224	AAC	2	6	4467736	4467741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_015224	TGT	2	6	4467767	4467772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_015224	TAAT	2	8	4467780	4467787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_015224	CTG	2	6	4467789	4467794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_015224	ATA	2	6	4467806	4467811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_015224	AT	3	6	4467836	4467841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_015224	T	6	6	4467844	4467849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_015224	A	6	6	4468155	4468160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_015224	GGC	2	6	4468171	4468176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_015224	CA	3	6	4468182	4468187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17023	NC_015224	GATAG	2	10	4468620	4468629	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_015224	TG	3	6	4470271	4470276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_015224	TCA	2	6	4470287	4470292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_015224	ACTC	2	8	4470325	4470332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17027	NC_015224	GCC	2	6	4470337	4470342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17028	NC_015224	ATT	2	6	4470357	4470362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_015224	ATC	2	6	4471567	4471572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17030	NC_015224	GGT	2	6	4471584	4471589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_015224	CAT	2	6	4471649	4471654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17032	NC_015224	TAC	2	6	4471702	4471707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_015224	ATT	2	6	4471753	4471758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_015224	CTGG	2	8	4471781	4471788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17035	NC_015224	ATT	2	6	4472966	4472971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_015224	GCT	2	6	4473046	4473051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_015224	CCGA	2	8	4473157	4473164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17038	NC_015224	ATT	2	6	4473199	4473204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_015224	GTT	2	6	4473218	4473223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_015224	TTGTT	2	10	4475198	4475207	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17041	NC_015224	CCG	2	6	4475226	4475231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17042	NC_015224	AAAC	2	8	4475262	4475269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17043	NC_015224	CA	3	6	4475323	4475328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17044	NC_015224	ATT	2	6	4475370	4475375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_015224	TGG	2	6	4475450	4475455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_015224	ATT	2	6	4475489	4475494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_015224	CA	3	6	4475523	4475528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17048	NC_015224	GGT	2	6	4475555	4475560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_015224	TAA	2	6	4475568	4475573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_015224	AAC	2	6	4475574	4475579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17051	NC_015224	AGG	2	6	4475580	4475585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_015224	AAG	2	6	4475586	4475591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_015224	TGGT	2	8	4475614	4475621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_015224	TCA	2	6	4475628	4475633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17055	NC_015224	GCC	2	6	4475692	4475697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17056	NC_015224	AGG	2	6	4475708	4475713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_015224	CCT	2	6	4475724	4475729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17058	NC_015224	GC	3	6	4475824	4475829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17059	NC_015224	CGC	2	6	4475834	4475839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17060	NC_015224	GGC	2	6	4475847	4475852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17061	NC_015224	GCC	2	6	4475957	4475962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17062	NC_015224	GAA	2	6	4475967	4475972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_015224	CGG	2	6	4475998	4476003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_015224	ACA	2	6	4476030	4476035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17065	NC_015224	AAC	2	6	4476052	4476057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17066	NC_015224	ATG	2	6	4476117	4476122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_015224	AGC	2	6	4476210	4476215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_015224	AAC	2	6	4476242	4476247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17069	NC_015224	ATA	2	6	4476252	4476257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_015224	ACT	2	6	4477021	4477026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_015224	CAAG	2	8	4477123	4477130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17072	NC_015224	AATGG	2	10	4480163	4480172	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_015224	AAT	2	6	4480276	4480281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_015224	ATC	2	6	4480345	4480350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17075	NC_015224	GACA	2	8	4480360	4480367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17076	NC_015224	TGC	2	6	4481437	4481442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17077	NC_015224	ATT	2	6	4481461	4481466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_015224	TAATA	2	10	4481485	4481494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_015224	AT	4	8	4481506	4481513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17080	NC_015224	A	6	6	4481529	4481534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_015224	GA	3	6	4481541	4481546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_015224	ACTC	2	8	4481557	4481564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17083	NC_015224	AATT	2	8	4485935	4485942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_015224	AT	4	8	4485990	4485997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_015224	TTAT	2	8	4488229	4488236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_015224	ACTCA	2	10	4489024	4489033	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17087	NC_015224	GGC	2	6	4490664	4490669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17088	NC_015224	GCT	2	6	4490706	4490711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17089	NC_015224	CTC	2	6	4491844	4491849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17090	NC_015224	TTC	2	6	4491880	4491885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17091	NC_015224	TAT	2	6	4494023	4494028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_015224	GCA	2	6	4494061	4494066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_015224	GAA	2	6	4494068	4494073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_015224	TTTAT	2	10	4495451	4495460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_015224	AGA	2	6	4497245	4497250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_015224	CAC	2	6	4497273	4497278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17097	NC_015224	A	6	6	4497312	4497317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_015224	AG	4	8	4497323	4497330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17099	NC_015224	CTG	2	6	4497339	4497344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_015224	CGA	2	6	4497353	4497358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17101	NC_015224	AGA	2	6	4497385	4497390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_015224	AGA	2	6	4497474	4497479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17103	NC_015224	A	6	6	4497524	4497529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_015224	TCC	2	6	4497600	4497605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17105	NC_015224	TCA	2	6	4497661	4497666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17106	NC_015224	CAA	2	6	4497833	4497838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17107	NC_015224	TGC	2	6	4497849	4497854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17108	NC_015224	CAT	3	9	4497931	4497939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17109	NC_015224	GAA	2	6	4497986	4497991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_015224	CG	3	6	4498030	4498035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17111	NC_015224	TGA	2	6	4498155	4498160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_015224	ACCT	2	8	4498166	4498173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17113	NC_015224	CAA	2	6	4498196	4498201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17114	NC_015224	TTCA	2	8	4498203	4498210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17115	NC_015224	GCC	2	6	4498223	4498228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17116	NC_015224	GA	3	6	4498246	4498251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17117	NC_015224	TCT	2	6	4498318	4498323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17118	NC_015224	GA	3	6	4498358	4498363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_015224	TCA	2	6	4498475	4498480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17120	NC_015224	ATT	2	6	4498578	4498583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17121	NC_015224	GA	3	6	4498613	4498618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17122	NC_015224	GCC	2	6	4498627	4498632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17123	NC_015224	GAT	2	6	4498652	4498657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_015224	TCA	2	6	4498678	4498683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17125	NC_015224	AT	3	6	4498719	4498724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17126	NC_015224	A	6	6	4498754	4498759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17127	NC_015224	AT	3	6	4498783	4498788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17128	NC_015224	AAG	2	6	4498827	4498832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17130	NC_015224	AG	3	6	4498891	4498896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17257	NC_015224	T	7	7	4537174	4537180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17258	NC_015224	A	6	6	4537195	4537200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.