MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pPCP1

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014027	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014027	TGG	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014027	CGT	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014027	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014027	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014027	CAG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014027	ACA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014027	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014027	AC	3	6	2211	2216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014027	GAT	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014027	T	6	6	2373	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014027	GTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014027	T	6	6	2385	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014027	GTC	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014027	GACGG	2	10	2503	2512	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014027	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014027	TGT	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014027	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014027	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014027	T	7	7	2652	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014027	T	6	6	2705	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014027	TAC	2	6	2721	2726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014027	A	7	7	2746	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014027	AAT	2	6	2799	2804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014027	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014027	ACA	3	9	2933	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014027	CGA	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014027	GGC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014027	TG	3	6	3034	3039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014027	GAA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014027	GCG	2	6	3408	3413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014027	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014027	CA	3	6	3453	3458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014027	GCA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014027	TTGAAG	2	12	3925	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014027	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014027	GCA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014027	A	7	7	4094	4100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014027	AAG	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014027	CAG	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014027	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014027	TGC	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014027	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014027	T	8	8	4264	4271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014027	ATT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014027	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014027	ATC	2	6	4393	4398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014027	A	7	7	4413	4419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014027	ATT	2	6	4794	4799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014027	A	7	7	5910	5916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014027	A	8	8	5926	5933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014027	TAA	2	6	5967	5972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014027	CGC	2	6	5978	5983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014027	AAT	2	6	5999	6004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014027	GAC	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014027	ATT	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014027	ATT	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014027	ATA	2	6	6623	6628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014027	AG	3	6	6644	6649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014027	TC	3	6	7618	7623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014027	TCC	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014027	GGA	2	6	7644	7649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014027	AGG	2	6	7661	7666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014027	TG	3	6	7690	7695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014027	TGT	2	6	7736	7741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014027	TCCT	2	8	7809	7816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014027	GCT	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014027	CTG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014027	TTC	2	6	7975	7980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014027	CAT	2	6	7984	7989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014027	ATC	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014027	CAC	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014027	ACAG	2	8	8568	8575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014027	CAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014027	CCG	2	6	8605	8610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014027	ACGA	2	8	8665	8672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014027	TGCC	2	8	8675	8682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014027	T	6	6	8703	8708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014027	TGG	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014027	CAA	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014027	TCAGAC	2	12	8848	8859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014027	CAG	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014027	CTGT	2	8	8948	8955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014027	CAA	2	6	9020	9025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014027	TGC	2	6	9071	9076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014027	A	8	8	9077	9084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014027	AAT	2	6	9188	9193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014027	ACAA	2	8	9205	9212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014027	T	6	6	9219	9224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014027	T	7	7	9232	9238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014027	TAAT	2	8	9262	9269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014027	T	7	7	9354	9360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014027	CCT	2	6	9375	9380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014027	CCA	2	6	9405	9410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014027	A	6	6	9414	9419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014027	AGG	2	6	9429	9434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014027	A	6	6	9539	9544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014027	ATA	2	6	9570	9575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.