MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome

Total Repeats: 16841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_010465	GAC	2	6	4199122	4199127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_010465	GTAA	2	8	4202555	4202562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_010465	CGC	2	6	4202577	4202582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15004	NC_010465	GCG	2	6	4202593	4202598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_010465	GCA	2	6	4202636	4202641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_010465	GCA	2	6	4202644	4202649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_010465	CGC	2	6	4202701	4202706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_010465	GCG	2	6	4202717	4202722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_010465	CCG	2	6	4203792	4203797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_010465	A	7	7	4203831	4203837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_010465	AAAAC	2	10	4203905	4203914	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15012	NC_010465	ATT	2	6	4203956	4203961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_010465	ATC	2	6	4203995	4204000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_010465	AAT	3	9	4204030	4204038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_010465	AAT	2	6	4204056	4204061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_010465	TA	3	6	4204071	4204076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_010465	GGA	2	6	4207138	4207143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_010465	CAC	2	6	4207515	4207520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15019	NC_010465	CTG	2	6	4207537	4207542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_010465	GATT	2	8	4208162	4208169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_010465	ACG	2	6	4208170	4208175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_010465	GTA	2	6	4208819	4208824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_010465	A	6	6	4208830	4208835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_010465	CAAG	2	8	4209872	4209879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15025	NC_010465	CT	3	6	4209904	4209909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15026	NC_010465	TGAA	2	8	4209959	4209966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_010465	GCT	2	6	4209996	4210001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_010465	CAG	2	6	4210050	4210055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_010465	ACT	2	6	4210085	4210090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_010465	GCA	2	6	4210863	4210868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_010465	CAAA	2	8	4210875	4210882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15032	NC_010465	C	7	7	4210885	4210891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15033	NC_010465	A	6	6	4210902	4210907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_010465	ATGG	2	8	4210983	4210990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_010465	CTG	2	6	4211015	4211020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_010465	GATA	2	8	4211068	4211075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_010465	A	7	7	4211075	4211081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_010465	ATC	2	6	4211090	4211095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_010465	AGAAT	2	10	4211100	4211109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_010465	AGAA	2	8	4211148	4211155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_010465	ACT	2	6	4211310	4211315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_010465	GTTCA	2	10	4213023	4213032	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15043	NC_010465	AG	3	6	4213040	4213045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_010465	AGATTA	2	12	4213375	4213386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_010465	CTT	2	6	4213437	4213442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_010465	A	7	7	4213464	4213470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_010465	T	7	7	4213476	4213482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_010465	AAAG	2	8	4213528	4213535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_010465	TAA	2	6	4213565	4213570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_010465	CCT	2	6	4213591	4213596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15051	NC_010465	TCA	2	6	4214197	4214202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_010465	C	6	6	4214297	4214302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15053	NC_010465	CTA	2	6	4214320	4214325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_010465	TGG	2	6	4214329	4214334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_010465	TTA	2	6	4214369	4214374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_010465	ATC	2	6	4214413	4214418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_010465	AGC	2	6	4214470	4214475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_010465	ATC	2	6	4214478	4214483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_010465	GGT	2	6	4214501	4214506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_010465	CAT	2	6	4214537	4214542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_010465	CAG	2	6	4214551	4214556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_010465	ATACA	2	10	4214574	4214583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15063	NC_010465	CTC	2	6	4216081	4216086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15064	NC_010465	T	6	6	4216123	4216128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_010465	TCTG	2	8	4217468	4217475	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15066	NC_010465	CAT	2	6	4217484	4217489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_010465	TC	3	6	4217512	4217517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15068	NC_010465	ATC	2	6	4217530	4217535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_010465	TTA	2	6	4217579	4217584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_010465	CGC	2	6	4217605	4217610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15071	NC_010465	CAT	2	6	4217620	4217625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_010465	TC	3	6	4222567	4222572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15073	NC_010465	TTC	2	6	4224607	4224612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_010465	TTA	2	6	4224643	4224648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_010465	CAA	2	6	4224653	4224658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_010465	GTT	2	6	4224711	4224716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_010465	AATT	2	8	4224724	4224731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_010465	GCC	2	6	4224769	4224774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15079	NC_010465	GA	3	6	4224831	4224836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_010465	TGA	2	6	4224864	4224869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_010465	A	6	6	4224948	4224953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_010465	AGC	2	6	4224972	4224977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15083	NC_010465	GGA	2	6	4225008	4225013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_010465	AG	3	6	4225657	4225662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_010465	CAG	2	6	4225710	4225715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15086	NC_010465	CAC	2	6	4225812	4225817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15087	NC_010465	CCG	2	6	4225889	4225894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15088	NC_010465	GGA	2	6	4225949	4225954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_010465	ACA	2	6	4226130	4226135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_010465	GTA	2	6	4229007	4229012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_010465	ATA	2	6	4229189	4229194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_010465	T	6	6	4229203	4229208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_010465	AGC	2	6	4230015	4230020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_010465	TAAAT	2	10	4230078	4230087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_010465	TCA	2	6	4230446	4230451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_010465	ATA	2	6	4230505	4230510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_010465	CTAT	2	8	4231567	4231574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15098	NC_010465	CTAT	2	8	4231587	4231594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15099	NC_010465	GAT	3	9	4231602	4231610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_010465	GTG	2	6	4231658	4231663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_010465	AAT	2	6	4231667	4231672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_010465	TTAA	2	8	4232592	4232599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_010465	AGC	2	6	4233582	4233587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_010465	TGA	2	6	4233590	4233595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_010465	GAG	2	6	4237521	4237526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_010465	AAC	2	6	4239070	4239075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_010465	GA	3	6	4239100	4239105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_010465	TGA	2	6	4239835	4239840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_010465	ACA	2	6	4239891	4239896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_010465	GAT	2	6	4239899	4239904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_010465	AT	3	6	4239917	4239922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_010465	T	7	7	4239981	4239987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_010465	T	7	7	4240023	4240029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_010465	TATT	2	8	4240048	4240055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_010465	CAGC	2	8	4240124	4240131	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15116	NC_010465	GTGA	2	8	4240188	4240195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_010465	AAC	2	6	4240204	4240209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_010465	A	7	7	4240234	4240240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_010465	CAAT	2	8	4243140	4243147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15120	NC_010465	ATC	2	6	4243183	4243188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_010465	TAA	2	6	4243591	4243596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_010465	AT	3	6	4243675	4243680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_010465	GCC	2	6	4243769	4243774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15124	NC_010465	ATT	2	6	4243789	4243794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_010465	AT	3	6	4243839	4243844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_010465	A	6	6	4243940	4243945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_010465	CGG	2	6	4243987	4243992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15129	NC_010465	TTATT	2	10	4244057	4244066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15252	NC_010465	AT	5	10	4268428	4268437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15253	NC_010465	AACG	2	8	4268453	4268460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15254	NC_010465	GCG	2	6	4268490	4268495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15396	NC_010465	GAA	2	6	4326646	4326651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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