MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome

Total Repeats: 16841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010465	ATA	2	6	3876296	3876301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_010465	TGA	2	6	3877989	3877994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_010465	GAT	2	6	3878061	3878066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_010465	A	6	6	3878077	3878082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_010465	TGA	2	6	3878135	3878140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_010465	TGAG	2	8	3878162	3878169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_010465	TA	3	6	3878326	3878331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_010465	A	6	6	3878346	3878351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_010465	A	8	8	3878356	3878363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_010465	CTT	2	6	3880738	3880743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_010465	TAACG	2	10	3880761	3880770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14012	NC_010465	TTA	2	6	3880774	3880779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_010465	GGCA	2	8	3880799	3880806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14014	NC_010465	AAT	2	6	3880872	3880877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_010465	ATG	2	6	3880977	3880982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_010465	TAGG	2	8	3880998	3881005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_010465	CAG	2	6	3881019	3881024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_010465	CAG	2	6	3881039	3881044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_010465	GGAA	2	8	3881078	3881085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_010465	CGCT	2	8	3882913	3882920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_010465	GT	3	6	3882939	3882944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_010465	ACA	2	6	3882960	3882965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_010465	T	8	8	3882986	3882993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_010465	ACTC	2	8	3883004	3883011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14025	NC_010465	ATA	2	6	3883027	3883032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_010465	TGA	2	6	3883055	3883060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_010465	ATTGA	4	20	3883119	3883138	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_010465	ACTGA	3	15	3883139	3883153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14029	NC_010465	ACAA	2	8	3883219	3883226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14030	NC_010465	AAT	2	6	3883307	3883312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_010465	AAT	2	6	3883324	3883329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_010465	GCGAT	2	10	3883361	3883370	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14033	NC_010465	T	6	6	3883370	3883375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_010465	CAG	3	9	3883437	3883445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_010465	TAA	2	6	3884470	3884475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_010465	TGATAT	2	12	3884487	3884498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_010465	TTC	2	6	3884506	3884511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_010465	ATT	2	6	3884563	3884568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_010465	TAA	2	6	3884631	3884636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_010465	TGT	2	6	3884726	3884731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_010465	A	6	6	3884746	3884751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_010465	A	6	6	3884761	3884766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_010465	TA	3	6	3884783	3884788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_010465	CCA	2	6	3884790	3884795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14045	NC_010465	CAA	2	6	3884796	3884801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_010465	AAT	2	6	3884841	3884846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_010465	GAT	2	6	3884858	3884863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_010465	GAT	2	6	3884879	3884884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_010465	TAA	2	6	3884900	3884905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_010465	ATA	2	6	3884906	3884911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_010465	TCA	2	6	3884915	3884920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_010465	AAT	2	6	3884963	3884968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_010465	TAATTA	2	12	3884989	3885000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_010465	TAA	2	6	3885067	3885072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_010465	CAT	2	6	3885074	3885079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_010465	A	8	8	3885080	3885087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_010465	ATT	2	6	3885331	3885336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_010465	AAG	2	6	3885358	3885363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_010465	TTG	2	6	3885405	3885410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_010465	TGA	2	6	3885460	3885465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_010465	CTA	2	6	3885497	3885502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_010465	CTA	2	6	3885506	3885511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_010465	TC	3	6	3885521	3885526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14064	NC_010465	TGG	2	6	3885540	3885545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_010465	T	9	9	3885603	3885611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_010465	A	7	7	3885631	3885637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_010465	AAC	2	6	3885640	3885645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_010465	ACC	2	6	3889745	3889750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14069	NC_010465	CAG	2	6	3890368	3890373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14071	NC_010465	TAG	2	6	3890415	3890420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14073	NC_010465	CAA	2	6	3890489	3890494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_010465	CGC	2	6	3890532	3890537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14075	NC_010465	TAT	2	6	3891801	3891806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14077	NC_010465	AAG	2	6	3891854	3891859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14079	NC_010465	CAGT	2	8	3891956	3891963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14080	NC_010465	GTGC	2	8	3891975	3891982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14081	NC_010465	AAC	2	6	3891987	3891992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_010465	CAGC	2	8	3892048	3892055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14083	NC_010465	TGA	2	6	3892117	3892122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_010465	GC	3	6	3892187	3892192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14085	NC_010465	AAC	2	6	3892197	3892202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_010465	GAAAAA	2	12	3892226	3892237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_010465	CAG	2	6	3892241	3892246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14089	NC_010465	T	7	7	3892286	3892292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_010465	GAAA	2	8	3892398	3892405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_010465	TGA	2	6	3892409	3892414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14093	NC_010465	TAT	2	6	3894136	3894141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_010465	AAT	2	6	3894167	3894172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_010465	TCAAT	2	10	3894538	3894547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14096	NC_010465	TGC	2	6	3894582	3894587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_010465	GA	3	6	3894597	3894602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_010465	TA	3	6	3894624	3894629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_010465	CGT	2	6	3894698	3894703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14101	NC_010465	TACA	2	8	3894809	3894816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14102	NC_010465	ATCA	2	8	3894827	3894834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14103	NC_010465	ACC	2	6	3894873	3894878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14107	NC_010465	CGG	2	6	3898319	3898324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_010465	CGG	2	6	3898331	3898336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_010465	GTTA	2	8	3899158	3899165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_010465	ATTC	2	8	3899312	3899319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14111	NC_010465	AGC	2	6	3899337	3899342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_010465	ATA	2	6	3901715	3901720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_010465	GTT	2	6	3901723	3901728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_010465	CCTT	2	8	3901750	3901757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14115	NC_010465	ATCA	2	8	3901785	3901792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14116	NC_010465	GTT	2	6	3901814	3901819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_010465	CAGA	2	8	3901859	3901866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14118	NC_010465	TA	3	6	3901925	3901930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_010465	CAAG	2	8	3901936	3901943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14120	NC_010465	GCCA	2	8	3901965	3901972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14121	NC_010465	CT	3	6	3901984	3901989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14122	NC_010465	TA	3	6	3902026	3902031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_010465	A	7	7	3902060	3902066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_010465	A	6	6	3902107	3902112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_010465	CAA	2	6	3902147	3902152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_010465	A	7	7	3902151	3902157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_010465	CCCT	2	8	3905208	3905215	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14128	NC_010465	CTC	2	6	3905230	3905235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14130	NC_010465	T	7	7	3905311	3905317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_010465	GAC	2	6	3905322	3905327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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