MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome

Total Repeats: 16841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010465	TTG	2	6	2257254	2257259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_010465	CAG	2	6	2257262	2257267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_010465	T	7	7	2257312	2257318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_010465	TA	3	6	2257328	2257333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_010465	GAGC	2	8	2257368	2257375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_010465	CACT	2	8	2257408	2257415	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_010465	AATAAG	2	12	2258137	2258148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_010465	AAT	2	6	2258158	2258163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_010465	TACC	2	8	2258166	2258173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_010465	TA	3	6	2258250	2258255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_010465	C	6	6	2258269	2258274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8012	NC_010465	T	6	6	2260963	2260968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_010465	TC	3	6	2261004	2261009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_010465	GACT	2	8	2261098	2261105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8015	NC_010465	GCC	2	6	2261111	2261116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_010465	ATT	2	6	2261131	2261136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_010465	TAA	2	6	2261202	2261207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_010465	TAAT	2	8	2262182	2262189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_010465	ATA	2	6	2262213	2262218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_010465	A	6	6	2262224	2262229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_010465	TAA	2	6	2262233	2262238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_010465	TAAA	2	8	2262264	2262271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_010465	CAT	2	6	2262304	2262309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_010465	AGAT	2	8	2262311	2262318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_010465	GA	3	6	2262337	2262342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_010465	CTC	3	9	2262381	2262389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_010465	TTAT	2	8	2262425	2262432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_010465	AAT	2	6	2262483	2262488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_010465	CTA	2	6	2262495	2262500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_010465	TTA	2	6	2263557	2263562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_010465	ATG	2	6	2263582	2263587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_010465	TAA	2	6	2263611	2263616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_010465	A	8	8	2263628	2263635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_010465	TA	3	6	2263641	2263646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_010465	TCA	2	6	2263661	2263666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8037	NC_010465	A	6	6	2263792	2263797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_010465	GGCT	2	8	2263809	2263816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8039	NC_010465	TTACCT	2	12	2266493	2266504	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_010465	ATT	2	6	2266507	2266512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_010465	AAG	2	6	2267263	2267268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_010465	CTA	2	6	2267269	2267274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_010465	TTC	2	6	2268337	2268342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_010465	AG	3	6	2268353	2268358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_010465	AAT	2	6	2268490	2268495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_010465	ATA	2	6	2269885	2269890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_010465	A	6	6	2269903	2269908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_010465	ATT	2	6	2269923	2269928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_010465	ACG	2	6	2269965	2269970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_010465	CGT	2	6	2271052	2271057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_010465	TA	3	6	2271060	2271065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_010465	TAAAAT	2	12	2271087	2271098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_010465	CA	4	8	2271163	2271170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_010465	TAA	2	6	2271218	2271223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_010465	TGT	2	6	2271231	2271236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_010465	AATC	2	8	2272974	2272981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8058	NC_010465	A	6	6	2273023	2273028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_010465	CAAT	2	8	2273029	2273036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8060	NC_010465	AG	3	6	2273144	2273149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_010465	TGG	2	6	2273192	2273197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_010465	CT	3	6	2273207	2273212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_010465	TCA	2	6	2273238	2273243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_010465	T	7	7	2273279	2273285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_010465	TAA	2	6	2273303	2273308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_010465	T	6	6	2273323	2273328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_010465	AAT	2	6	2277961	2277966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_010465	ACTT	2	8	2278016	2278023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_010465	TTA	2	6	2280059	2280064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_010465	GAGT	2	8	2280086	2280093	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_010465	AATT	2	8	2280104	2280111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_010465	CTG	2	6	2280127	2280132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_010465	TGTT	2	8	2280154	2280161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_010465	AAT	2	6	2280250	2280255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_010465	T	6	6	2280274	2280279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_010465	AT	3	6	2280330	2280335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8079	NC_010465	AGTG	2	8	2280818	2280825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_010465	TCCAT	2	10	2281500	2281509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8081	NC_010465	TAAA	2	8	2281591	2281598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_010465	TATG	2	8	2281607	2281614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_010465	ATTTA	2	10	2281618	2281627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_010465	TAA	2	6	2281629	2281634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_010465	TGC	2	6	2281686	2281691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8089	NC_010465	TCA	2	6	2284668	2284673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8092	NC_010465	TAC	2	6	2284777	2284782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8094	NC_010465	ATG	2	6	2284829	2284834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_010465	GATT	2	8	2284835	2284842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_010465	GCC	2	6	2285424	2285429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_010465	CAGA	2	8	2285457	2285464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8098	NC_010465	AAG	2	6	2285940	2285945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_010465	ATG	2	6	2286917	2286922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_010465	AAC	2	6	2286937	2286942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_010465	ATT	2	6	2287030	2287035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_010465	CT	3	6	2287415	2287420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_010465	CT	3	6	2287430	2287435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8104	NC_010465	ATC	2	6	2287439	2287444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8107	NC_010465	TAT	3	9	2287895	2287903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_010465	T	8	8	2287907	2287914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_010465	TTAA	2	8	2287916	2287923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_010465	CAT	2	6	2288244	2288249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8112	NC_010465	TTA	2	6	2288984	2288989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8114	NC_010465	ATT	2	6	2289056	2289061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_010465	TTA	2	6	2289079	2289084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_010465	A	7	7	2289084	2289090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_010465	CAA	2	6	2289108	2289113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_010465	AG	3	6	2289114	2289119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_010465	AAT	2	6	2289127	2289132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_010465	T	6	6	2289141	2289146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_010465	TAA	2	6	2289183	2289188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_010465	TAAA	2	8	2289206	2289213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_010465	TGAC	2	8	2289232	2289239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8124	NC_010465	AAAAT	2	10	2289245	2289254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_010465	TC	3	6	2289296	2289301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_010465	CAAAA	2	10	2289351	2289360	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8127	NC_010465	TTA	2	6	2289381	2289386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_010465	ATA	2	6	2289389	2289394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_010465	AAC	2	6	2289425	2289430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_010465	GATGCT	2	12	2289438	2289449	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8131	NC_010465	GCA	2	6	2289534	2289539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8133	NC_010465	CCAT	2	8	2289603	2289610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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