MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 21932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010159	AGC	2	6	2386232	2386237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_010159	TGCCC	2	10	2386298	2386307	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11503	NC_010159	TGA	2	6	2386337	2386342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_010159	CAT	2	6	2386476	2386481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_010159	CAA	2	6	2386509	2386514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_010159	GA	3	6	2386519	2386524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_010159	CCT	2	6	2386553	2386558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11508	NC_010159	AGC	2	6	2386570	2386575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_010159	ATT	2	6	2386577	2386582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_010159	TATT	2	8	2386597	2386604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_010159	GCA	2	6	2386607	2386612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_010159	AGG	2	6	2386635	2386640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_010159	A	6	6	2386865	2386870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_010159	TTG	2	6	2386881	2386886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_010159	ATTG	2	8	2386928	2386935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_010159	GCC	2	6	2386973	2386978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11517	NC_010159	TCTG	2	8	2387019	2387026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11518	NC_010159	A	6	6	2387057	2387062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_010159	GTT	2	6	2387083	2387088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_010159	A	7	7	2387192	2387198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_010159	CGT	2	6	2387239	2387244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_010159	CGT	2	6	2387290	2387295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_010159	CAC	2	6	2387349	2387354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_010159	TGG	2	6	2387382	2387387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_010159	CGC	2	6	2387467	2387472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_010159	TCG	2	6	2387487	2387492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_010159	TCT	2	6	2387546	2387551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_010159	CCA	2	6	2387657	2387662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11529	NC_010159	CCCG	2	8	2387701	2387708	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11530	NC_010159	CTCA	2	8	2387881	2387888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_010159	ACC	2	6	2387896	2387901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11532	NC_010159	CAAGG	2	10	2387924	2387933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11533	NC_010159	CCG	2	6	2387985	2387990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_010159	TGA	2	6	2387994	2387999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_010159	CAC	2	6	2388091	2388096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_010159	ATG	2	6	2388123	2388128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_010159	ATGACG	2	12	2388146	2388157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11538	NC_010159	ATA	2	6	2388169	2388174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_010159	TAAA	2	8	2394406	2394413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_010159	T	6	6	2394460	2394465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_010159	CAG	2	6	2394469	2394474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_010159	AGTA	2	8	2394490	2394497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_010159	ATT	2	6	2394500	2394505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_010159	T	6	6	2394504	2394509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_010159	ATA	2	6	2395388	2395393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_010159	CTA	2	6	2395408	2395413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_010159	TAAAC	2	10	2395423	2395432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11548	NC_010159	CAA	2	6	2395435	2395440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_010159	CTA	2	6	2395487	2395492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_010159	A	6	6	2395506	2395511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_010159	TTA	2	6	2395686	2395691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_010159	TGA	2	6	2395697	2395702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_010159	CTA	2	6	2395739	2395744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_010159	GTC	3	9	2395766	2395774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_010159	GTG	2	6	2395781	2395786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_010159	GC	3	6	2395797	2395802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_010159	CCG	2	6	2395839	2395844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11558	NC_010159	GGA	2	6	2396567	2396572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_010159	TATT	2	8	2396573	2396580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_010159	TGA	2	6	2396611	2396616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_010159	AAC	2	6	2396668	2396673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_010159	CGG	2	6	2396702	2396707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_010159	ATG	2	6	2396725	2396730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_010159	TAT	2	6	2396747	2396752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_010159	GTTT	2	8	2396832	2396839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_010159	TCT	2	6	2396937	2396942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_010159	AAG	2	6	2396965	2396970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_010159	GGC	2	6	2397079	2397084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_010159	CGG	2	6	2397119	2397124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_010159	CCA	2	6	2397145	2397150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11571	NC_010159	CT	3	6	2397184	2397189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11572	NC_010159	GAT	2	6	2397210	2397215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_010159	AGCA	2	8	2397278	2397285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11574	NC_010159	CGA	2	6	2397314	2397319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_010159	ACC	2	6	2397356	2397361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_010159	ATGC	2	8	2397385	2397392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11577	NC_010159	GCTC	2	8	2397394	2397401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11578	NC_010159	CAA	2	6	2397418	2397423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_010159	ATTG	2	8	2397432	2397439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_010159	TGA	2	6	2397456	2397461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_010159	ATT	2	6	2397505	2397510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_010159	ATATTG	2	12	2397512	2397523	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_010159	AATG	2	8	2397564	2397571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_010159	CAAC	2	8	2397675	2397682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_010159	TGC	3	9	2397723	2397731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_010159	ATT	2	6	2397754	2397759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_010159	ACC	2	6	2397760	2397765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11588	NC_010159	GCA	2	6	2397774	2397779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_010159	CGG	2	6	2397837	2397842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_010159	CGC	2	6	2397870	2397875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11591	NC_010159	AAAGT	2	10	2397902	2397911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_010159	ATG	2	6	2397940	2397945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_010159	ATT	2	6	2397994	2397999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_010159	TGA	2	6	2398001	2398006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_010159	CAA	2	6	2398033	2398038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_010159	TTC	2	6	2398048	2398053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_010159	TGC	2	6	2398068	2398073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_010159	TTCA	2	8	2398096	2398103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11599	NC_010159	ACTGC	2	10	2398162	2398171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11600	NC_010159	CCGGT	2	10	2398190	2398199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11601	NC_010159	TTA	2	6	2399400	2399405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_010159	ATT	2	6	2399423	2399428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_010159	TTA	2	6	2399459	2399464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_010159	TATT	2	8	2399486	2399493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_010159	TAA	2	6	2401969	2401974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_010159	T	6	6	2401995	2402000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_010159	CAG	2	6	2402020	2402025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_010159	ATA	2	6	2402068	2402073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_010159	AAT	2	6	2402101	2402106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_010159	AT	3	6	2402123	2402128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_010159	ACGCC	2	10	2402141	2402150	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11612	NC_010159	GCG	2	6	2402155	2402160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_010159	ATG	2	6	2402230	2402235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_010159	TTG	2	6	2403911	2403916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_010159	ATTG	2	8	2403938	2403945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_010159	CATAC	2	10	2404037	2404046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11617	NC_010159	AAT	3	9	2404088	2404096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_010159	A	6	6	2404102	2404107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_010159	TTG	2	6	2404661	2404666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_010159	CT	3	6	2405537	2405542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11621	NC_010159	TAAC	2	8	2405577	2405584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11622	NC_010159	GAT	2	6	2405662	2405667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_010159	CG	3	6	2405683	2405688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11624	NC_010159	TGG	2	6	2405709	2405714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_010159	CTAT	2	8	2405735	2405742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11626	NC_010159	ATATG	2	10	2405751	2405760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11628	NC_010159	CAGC	2	8	2405811	2405818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11755	NC_010159	ATG	2	6	2429726	2429731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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