MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 21932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010159	TCT	2	6	1316716	1316721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_010159	GTT	2	6	1316746	1316751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_010159	GGA	2	6	1316755	1316760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_010159	TCAG	2	8	1316815	1316822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_010159	TAA	2	6	1318071	1318076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_010159	ATAC	2	8	1318107	1318114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_010159	TAC	2	6	1318135	1318140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_010159	GACA	2	8	1318296	1318303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_010159	AAC	2	6	1318333	1318338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_010159	ATC	2	6	1318440	1318445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_010159	TGC	2	6	1318486	1318491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_010159	GTG	2	6	1318502	1318507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010159	AGG	2	6	1318537	1318542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_010159	ATT	2	6	1318569	1318574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_010159	ATG	2	6	1318645	1318650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010159	TGC	2	6	1318693	1318698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_010159	CAA	2	6	1318701	1318706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_010159	TTTG	2	8	1318787	1318794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_010159	GTC	2	6	1318869	1318874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_010159	CAT	2	6	1318949	1318954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_010159	TGC	2	6	1318958	1318963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_010159	CA	3	6	1318964	1318969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_010159	GAT	2	6	1318983	1318988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_010159	GGCT	2	8	1319042	1319049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_010159	GGGC	2	8	1319066	1319073	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_010159	CGGG	2	8	1319204	1319211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_010159	A	6	6	1319280	1319285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_010159	TAT	2	6	1319481	1319486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_010159	GGT	2	6	1319662	1319667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_010159	AGC	2	6	1319676	1319681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_010159	TAA	2	6	1319779	1319784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_010159	TTA	2	6	1319980	1319985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_010159	TTAT	2	8	1319995	1320002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_010159	GA	3	6	1320434	1320439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_010159	CTC	2	6	1320515	1320520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_010159	CAG	2	6	1320562	1320567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_010159	TGA	2	6	1320570	1320575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_010159	ATG	2	6	1320638	1320643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_010159	TGA	2	6	1320647	1320652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_010159	GGTT	2	8	1321168	1321175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_010159	CAT	2	6	1321184	1321189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_010159	CAA	2	6	1321216	1321221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_010159	TAA	2	6	1321236	1321241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_010159	CTAAT	2	10	1321271	1321280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6045	NC_010159	TGGT	2	8	1321285	1321292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_010159	TAA	2	6	1321337	1321342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_010159	AAT	2	6	1321347	1321352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_010159	TTA	2	6	1322223	1322228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_010159	CTT	2	6	1322250	1322255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_010159	GTT	2	6	1322271	1322276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_010159	CACT	2	8	1322282	1322289	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_010159	ATTC	2	8	1322324	1322331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_010159	TGC	2	6	1322335	1322340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_010159	CTT	2	6	1322374	1322379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_010159	GTT	2	6	1322395	1322400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_010159	CACT	2	8	1322406	1322413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_010159	ATTC	2	8	1322448	1322455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_010159	TGC	2	6	1322459	1322464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_010159	CTT	2	6	1322498	1322503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_010159	GTT	2	6	1322519	1322524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010159	CACT	2	8	1322530	1322537	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_010159	ATTC	2	8	1322572	1322579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_010159	TGC	2	6	1322583	1322588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_010159	CTT	2	6	1322622	1322627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_010159	GTT	2	6	1322643	1322648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_010159	TTG	2	6	1325691	1325696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_010159	ATA	2	6	1325701	1325706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_010159	G	6	6	1325709	1325714	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_010159	ATAA	2	8	1326234	1326241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_010159	TGTT	2	8	1326275	1326282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_010159	G	6	6	1327745	1327750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010159	AGC	2	6	1327806	1327811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_010159	ATG	2	6	1327847	1327852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_010159	ATT	2	6	1328763	1328768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_010159	TC	3	6	1328769	1328774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_010159	AATG	2	8	1329624	1329631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_010159	AATA	2	8	1329678	1329685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_010159	TGT	2	6	1329766	1329771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_010159	ATAA	2	8	1329782	1329789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_010159	ATT	2	6	1329832	1329837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_010159	AGT	2	6	1329856	1329861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_010159	TAA	2	6	1329871	1329876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_010159	ATTG	2	8	1329889	1329896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_010159	T	6	6	1329936	1329941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_010159	GCA	3	9	1333735	1333743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_010159	GCC	2	6	1333747	1333752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_010159	CTT	2	6	1333755	1333760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_010159	GACT	2	8	1335389	1335396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_010159	TGGC	2	8	1335405	1335412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_010159	GGC	2	6	1335464	1335469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_010159	T	6	6	1335489	1335494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010159	CTG	2	6	1335496	1335501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_010159	TGA	2	6	1335528	1335533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_010159	CTG	2	6	1336950	1336955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_010159	TGA	2	6	1337006	1337011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010159	GTT	2	6	1338448	1338453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_010159	TATT	2	8	1338527	1338534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_010159	A	7	7	1338585	1338591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_010159	T	7	7	1338623	1338629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_010159	GGA	2	6	1339326	1339331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_010159	TATT	2	8	1339332	1339339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_010159	A	8	8	1340494	1340501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010159	ATTA	2	8	1340557	1340564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_010159	TGA	2	6	1340582	1340587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_010159	CTT	2	6	1340833	1340838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_010159	AAG	2	6	1340859	1340864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_010159	TTG	2	6	1340946	1340951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_010159	AGC	2	6	1340969	1340974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_010159	AT	3	6	1340993	1340998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_010159	CTTG	2	8	1341020	1341027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_010159	TCA	2	6	1341201	1341206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_010159	AATA	2	8	1341253	1341260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_010159	CAT	2	6	1341266	1341271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_010159	TAA	2	6	1341324	1341329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_010159	TCC	2	6	1341349	1341354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_010159	ACT	2	6	1341476	1341481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_010159	TCCT	2	8	1341488	1341495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_010159	TGTC	2	8	1341547	1341554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_010159	TTTA	2	8	1341555	1341562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_010159	TTC	2	6	1342449	1342454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_010159	TG	3	6	1342542	1342547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_010159	CCA	2	6	1342614	1342619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_010159	TG	3	6	1342695	1342700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_010159	CT	3	6	1342736	1342741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_010159	ATT	2	6	1342970	1342975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_010159	CAT	2	6	1343082	1343087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_010159	CAA	2	6	1343132	1343137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_010159	CCT	2	6	1343171	1343176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_010159	TAA	2	6	1343250	1343255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6131	NC_010159	ATA	2	6	1343523	1343528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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