MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_153kb

Total Repeats: 745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009705	TAT	2	6	85	90	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009705	GCCT	2	8	116	123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009705	CCTA	2	8	140	147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009705	ATT	2	6	171	176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009705	T	6	6	193	198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009705	CCA	2	6	207	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009705	CAAC	2	8	215	222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009705	ACAA	2	8	228	235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009705	AAAGA	2	10	270	279	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009705	AGA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009705	T	6	6	333	338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009705	ATT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009705	TA	4	8	419	426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009705	AAC	2	6	440	445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009705	AAC	2	6	459	464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009705	AT	3	6	478	483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009705	TATT	2	8	488	495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009705	TGA	2	6	503	508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009705	TTA	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009705	AC	3	6	574	579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009705	TGGGG	2	10	1894	1903	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009705	GGTT	2	8	1952	1959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009705	GAT	2	6	8471	8476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009705	AAG	2	6	8538	8543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009705	TCA	2	6	8646	8651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009705	TTTA	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009705	CA	3	6	8727	8732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009705	ACA	3	9	8735	8743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009705	CAT	2	6	8826	8831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009705	ATG	3	9	8841	8849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009705	ACAAA	2	10	8850	8859	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009705	ATA	2	6	8945	8950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009705	TAA	2	6	9771	9776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009705	AAT	2	6	9780	9785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009705	CCG	3	9	12921	12929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009705	A	6	6	15725	15730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009705	T	7	7	15750	15756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009705	ATTA	2	8	15778	15785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009705	ATTA	2	8	17057	17064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009705	AAT	2	6	17133	17138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009705	TAAA	2	8	17688	17695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009705	A	6	6	17693	17698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009705	CTG	2	6	20650	20655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009705	TAT	2	6	22779	22784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009705	ATTAA	2	10	24308	24317	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009705	A	7	7	25436	25442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009705	T	6	6	25981	25986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009705	GGT	2	6	26982	26987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009705	ACG	2	6	28284	28289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009705	AGG	2	6	28316	28321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009705	ATG	2	6	28348	28353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009705	TGA	2	6	28361	28366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009705	CAC	2	6	28378	28383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009705	AAGTA	2	10	28433	28442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009705	CCAG	2	8	28508	28515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009705	CCCAT	2	10	28521	28530	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_009705	TA	3	6	28811	28816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009705	A	6	6	28878	28883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009705	TAGC	2	8	28900	28907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009705	CA	3	6	28915	28920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009705	TCCC	2	8	28965	28972	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009705	TCAAT	2	10	30125	30134	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009705	TAAGC	2	10	30142	30151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_009705	ACA	2	6	30223	30228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009705	GAT	2	6	30939	30944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009705	AATA	2	8	30960	30967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009705	GGAT	2	8	30990	30997	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009705	TCT	2	6	31003	31008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009705	AGT	2	6	31195	31200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009705	TAAT	2	8	32832	32839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009705	GTA	2	6	32869	32874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009705	ATA	2	6	32902	32907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009705	TAT	2	6	35035	35040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009705	TAC	2	6	35057	35062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009705	TA	3	6	40502	40507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009705	TGAC	2	8	40568	40575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009705	GAT	2	6	40630	40635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009705	ATT	2	6	40681	40686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009705	A	6	6	40702	40707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009705	GAA	2	6	42787	42792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009705	CTG	2	6	42832	42837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009705	A	6	6	43356	43361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009705	GTAAA	2	10	43414	43423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009705	A	6	6	43421	43426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009705	TAAT	2	8	43430	43437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009705	AT	3	6	43436	43441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009705	TA	3	6	43460	43465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009705	T	6	6	44116	44121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009705	CATG	2	8	44125	44132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009705	TTC	2	6	44185	44190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009705	GAA	2	6	44218	44223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009705	ATCAT	2	10	44255	44264	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009705	AC	3	6	44319	44324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009705	AC	3	6	46819	46824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009705	TTG	2	6	46858	46863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009705	CGTG	2	8	46901	46908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009705	TGA	2	6	46943	46948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009705	TGA	2	6	46967	46972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009705	TCA	2	6	47041	47046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009705	GCTG	2	8	47578	47585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009705	GAA	2	6	47706	47711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009705	TTC	2	6	47721	47726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009705	ATA	2	6	47779	47784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009705	CAGT	2	8	47829	47836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009705	T	6	6	47844	47849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009705	AAAT	2	8	47856	47863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009705	AAAAT	2	10	47920	47929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009705	CAC	2	6	47993	47998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009705	GCC	2	6	48055	48060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009705	ATC	2	6	48253	48258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009705	GA	3	6	48285	48290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009705	AAT	2	6	48317	48322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009705	TGGC	2	8	48391	48398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009705	GGC	2	6	48439	48444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009705	TGG	2	6	48515	48520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009705	GA	3	6	48524	48529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009705	TTAC	2	8	48562	48569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009705	ATT	2	6	48628	48633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009705	A	6	6	48644	48649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009705	AAT	2	6	48749	48754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009705	TTC	2	6	48844	48849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009705	T	7	7	48865	48871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009705	CTC	2	6	48919	48924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009705	TCC	2	6	48934	48939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009705	TA	3	6	49609	49614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009705	AT	3	6	49624	49629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009705	A	7	7	49640	49646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009705	TAAT	2	8	49673	49680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009705	GATT	2	8	49981	49988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009705	AT	3	6	50011	50016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009705	GAA	2	6	50026	50031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009705	AT	3	6	50033	50038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009705	CT	3	6	50050	50055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009705	GATG	2	8	50084	50091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009705	ATG	2	6	50160	50165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009705	ATC	2	6	50170	50175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009705	TTG	2	6	50206	50211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009705	TTG	2	6	50326	50331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009705	TTA	2	6	50393	50398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009705	TCTT	2	8	50407	50414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009705	AG	3	6	50434	50439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009705	GGC	2	6	50453	50458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009705	CTA	2	6	50524	50529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009705	ATC	2	6	50570	50575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009705	CAG	2	6	50596	50601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009705	ATC	2	6	50639	50644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009705	AT	4	8	50704	50711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009705	TGC	2	6	50810	50815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_009705	A	8	8	50828	50835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009705	GGGCA	2	10	50837	50846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NC_009705	ATC	2	6	50861	50866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009705	AAG	2	6	50879	50884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_009705	TTA	2	6	50962	50967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_009705	ACC	2	6	52040	52045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_009705	AAT	2	6	52046	52051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_009705	CA	3	6	52429	52434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_009705	TAT	2	6	52435	52440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009705	ATT	2	6	53257	53262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009705	TG	4	8	53286	53293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_009705	CTGAT	2	10	53691	53700	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_009705	GACT	2	8	56044	56051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_009705	GAC	2	6	56158	56163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_009705	AAC	2	6	56200	56205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_009705	TGAA	2	8	56228	56235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009705	AAAT	2	8	56261	56268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_009705	ATT	2	6	56387	56392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009705	TA	3	6	56417	56422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_009705	T	8	8	59333	59340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009705	ATTA	2	8	59370	59377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009705	TTC	2	6	59409	59414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_009705	CAT	2	6	59429	59434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_009705	GGT	2	6	59469	59474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_009705	CT	3	6	59550	59555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_009705	ACT	2	6	59565	59570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_009705	TGC	2	6	59594	59599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_009705	T	7	7	59657	59663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_009705	TGTAA	2	10	59667	59676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_009705	TTTA	2	8	59691	59698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009705	ATA	2	6	59760	59765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_009705	ACT	2	6	80291	80296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_009705	A	7	7	80368	80374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009705	A	7	7	80385	80391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_009705	AAT	2	6	99813	99818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_009705	AAT	2	6	99845	99850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_009705	AT	3	6	99894	99899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_009705	CTGA	2	8	99958	99965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
442	NC_009705	TA	3	6	100073	100078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_009705	AGAC	2	8	100086	100093	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_009705	TGT	2	6	100102	100107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
445	NC_009705	ATC	2	6	100164	100169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_009705	GAAA	2	8	101103	101110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
448	NC_009705	TGC	2	6	101169	101174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_009705	AT	3	6	101209	101214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_009705	T	6	6	101235	101240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_009705	CA	3	6	101243	101248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
453	NC_009705	ACA	2	6	101262	101267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_009705	CAA	2	6	102404	102409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_009705	AAC	2	6	102423	102428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_009705	ATA	2	6	103855	103860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_009705	TAT	2	6	103897	103902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_009705	CTTT	2	8	104147	104154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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473	NC_009705	CTG	2	6	104213	104218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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485	NC_009705	AAT	2	6	105910	105915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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