MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 17625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009381	TGA	2	6	3275275	3275280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_009381	TCAG	2	8	3275288	3275295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13003	NC_009381	TGG	2	6	3278955	3278960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_009381	A	6	6	3279905	3279910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_009381	TA	3	6	3279922	3279927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_009381	CAA	2	6	3282801	3282806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_009381	A	6	6	3282824	3282829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_009381	AAT	2	6	3282901	3282906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_009381	ACT	2	6	3282996	3283001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_009381	TAA	2	6	3283009	3283014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_009381	AC	3	6	3284018	3284023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_009381	ATA	2	6	3284036	3284041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_009381	TTC	2	6	3284047	3284052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_009381	GGT	4	12	3286364	3286375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_009381	GTG	3	9	3286387	3286395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_009381	GTA	2	6	3286415	3286420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_009381	ATG	2	6	3286421	3286426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_009381	GTA	2	6	3286430	3286435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_009381	ATG	2	6	3286436	3286441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_009381	G	6	6	3286453	3286458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_009381	CTCG	2	8	3286495	3286502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_009381	CCA	2	6	3286514	3286519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_009381	CT	3	6	3286554	3286559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13024	NC_009381	TCC	2	6	3286560	3286565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_009381	TGA	3	9	3287792	3287800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_009381	CTAA	2	8	3287829	3287836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_009381	CT	3	6	3287884	3287889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_009381	TGA	2	6	3287906	3287911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_009381	ATCT	2	8	3287929	3287936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13030	NC_009381	ATT	2	6	3289179	3289184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_009381	TAA	2	6	3289836	3289841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_009381	CAA	2	6	3289884	3289889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_009381	A	7	7	3289891	3289897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_009381	CAA	2	6	3289905	3289910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_009381	ATG	2	6	3289962	3289967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_009381	CAATA	2	10	3289971	3289980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13037	NC_009381	AAT	2	6	3289993	3289998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_009381	CAA	2	6	3292911	3292916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_009381	A	6	6	3292915	3292920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_009381	TCA	2	6	3292934	3292939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_009381	TC	3	6	3292972	3292977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_009381	TCT	2	6	3294166	3294171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_009381	CCA	2	6	3294172	3294177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_009381	AAGC	2	8	3294223	3294230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13045	NC_009381	TCAT	2	8	3294284	3294291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13046	NC_009381	ATA	2	6	3294296	3294301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_009381	CAG	2	6	3294307	3294312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_009381	AAT	2	6	3294864	3294869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_009381	AG	3	6	3294875	3294880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_009381	CAA	2	6	3295795	3295800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_009381	GGCA	2	8	3298513	3298520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_009381	TAT	2	6	3298551	3298556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_009381	T	7	7	3298578	3298584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_009381	AGA	2	6	3298615	3298620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_009381	AAT	2	6	3300456	3300461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_009381	TCAA	2	8	3300471	3300478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13057	NC_009381	TCA	2	6	3300563	3300568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_009381	TCA	2	6	3300695	3300700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_009381	ACC	2	6	3300871	3300876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_009381	GCC	2	6	3300885	3300890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_009381	TC	4	8	3300971	3300978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13062	NC_009381	AC	3	6	3301058	3301063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_009381	AGC	2	6	3301257	3301262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_009381	ACG	2	6	3301311	3301316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_009381	TGA	2	6	3301391	3301396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_009381	CCG	2	6	3301419	3301424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_009381	ACC	2	6	3301506	3301511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13068	NC_009381	AGCT	2	8	3301564	3301571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13069	NC_009381	CTC	2	6	3301625	3301630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_009381	GAG	2	6	3301644	3301649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_009381	CCA	2	6	3301669	3301674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_009381	GGT	2	6	3301729	3301734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_009381	CAT	2	6	3301924	3301929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_009381	GCC	2	6	3301999	3302004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_009381	TTA	2	6	3302125	3302130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_009381	CAGC	2	8	3302139	3302146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13077	NC_009381	TC	3	6	3302254	3302259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_009381	ACC	2	6	3302284	3302289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13079	NC_009381	GTG	2	6	3302372	3302377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_009381	TCA	2	6	3302383	3302388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_009381	AGCCT	2	10	3302468	3302477	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13082	NC_009381	C	6	6	3302485	3302490	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13083	NC_009381	CAA	2	6	3302726	3302731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_009381	CTTT	2	8	3302820	3302827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_009381	ATG	2	6	3302830	3302835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13087	NC_009381	CTGT	2	8	3302860	3302867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13088	NC_009381	GTT	2	6	3302926	3302931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_009381	ACG	2	6	3302941	3302946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_009381	GT	3	6	3302963	3302968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_009381	TTC	2	6	3302983	3302988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_009381	TCGGT	2	10	3303172	3303181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13093	NC_009381	CAC	2	6	3303358	3303363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_009381	GTAC	2	8	3303383	3303390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13095	NC_009381	GTCA	2	8	3303466	3303473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13096	NC_009381	GGA	2	6	3303489	3303494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_009381	C	6	6	3303499	3303504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13098	NC_009381	AC	3	6	3303618	3303623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_009381	CTC	2	6	3303644	3303649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_009381	TCGC	2	8	3303655	3303662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13101	NC_009381	TCG	2	6	3303799	3303804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_009381	ATT	2	6	3303960	3303965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_009381	GA	3	6	3303967	3303972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_009381	CGG	2	6	3304009	3304014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_009381	TCA	2	6	3304329	3304334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_009381	TG	3	6	3304342	3304347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_009381	AGG	2	6	3304376	3304381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_009381	CTAC	2	8	3304474	3304481	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13109	NC_009381	GT	3	6	3304517	3304522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_009381	GT	3	6	3304686	3304691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_009381	ATG	2	6	3304711	3304716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_009381	TCC	2	6	3304737	3304742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_009381	CCA	2	6	3304773	3304778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13114	NC_009381	CAA	2	6	3304790	3304795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_009381	GAC	2	6	3304851	3304856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_009381	GCA	2	6	3304863	3304868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_009381	TTC	2	6	3304939	3304944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_009381	GCC	2	6	3305182	3305187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_009381	TCC	2	6	3305202	3305207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13120	NC_009381	C	6	6	3305246	3305251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13121	NC_009381	TGCG	2	8	3305334	3305341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_009381	GCT	2	6	3305392	3305397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13124	NC_009381	TCC	2	6	3305466	3305471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13125	NC_009381	CTT	2	6	3305501	3305506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_009381	CA	3	6	3305507	3305512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_009381	CTG	2	6	3305560	3305565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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