MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 17625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009381	TGC	2	6	2510088	2510093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_009381	TC	3	6	2510098	2510103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_009381	ACA	2	6	2511772	2511777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_009381	TC	4	8	2513626	2513633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_009381	GCC	2	6	2514961	2514966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_009381	CTGT	2	8	2515074	2515081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10007	NC_009381	ACA	2	6	2515095	2515100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_009381	ACA	2	6	2516278	2516283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_009381	CAT	2	6	2516300	2516305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_009381	TA	3	6	2518101	2518106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_009381	TCA	2	6	2518144	2518149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_009381	CAA	2	6	2518183	2518188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_009381	AATC	2	8	2518222	2518229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_009381	GTT	2	6	2519450	2519455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_009381	GCGCT	2	10	2519466	2519475	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10016	NC_009381	ATAA	2	8	2519505	2519512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_009381	ATA	2	6	2519525	2519530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009381	CAG	2	6	2519539	2519544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_009381	C	6	6	2519644	2519649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10020	NC_009381	TGGC	2	8	2520189	2520196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10021	NC_009381	ATG	2	6	2520218	2520223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_009381	AAT	2	6	2520241	2520246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_009381	A	9	9	2520309	2520317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_009381	ATA	2	6	2520399	2520404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_009381	T	7	7	2520419	2520425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_009381	TA	4	8	2522873	2522880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_009381	TAT	2	6	2522891	2522896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009381	TAA	2	6	2522897	2522902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_009381	ATT	2	6	2522906	2522911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_009381	AATA	2	8	2522959	2522966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_009381	T	7	7	2522980	2522986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_009381	AAAT	2	8	2522992	2522999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_009381	TTA	2	6	2523000	2523005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_009381	T	6	6	2523052	2523057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_009381	AAT	2	6	2523066	2523071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_009381	GGC	2	6	2523086	2523091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_009381	GA	3	6	2523096	2523101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_009381	GAA	2	6	2523181	2523186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_009381	ATT	2	6	2523201	2523206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_009381	CA	3	6	2523230	2523235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_009381	A	6	6	2523235	2523240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_009381	A	6	6	2523251	2523256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_009381	A	8	8	2523259	2523266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_009381	ATC	2	6	2523273	2523278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_009381	A	7	7	2523307	2523313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_009381	A	7	7	2523318	2523324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_009381	TAA	2	6	2523341	2523346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_009381	T	6	6	2523347	2523352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_009381	AAT	2	6	2523366	2523371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_009381	ATA	2	6	2523377	2523382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_009381	AATAA	2	10	2523393	2523402	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_009381	AAC	2	6	2523403	2523408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_009381	AAAT	2	8	2523422	2523429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_009381	TAA	2	6	2523440	2523445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_009381	T	6	6	2523458	2523463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_009381	TAA	2	6	2523470	2523475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_009381	GTTTT	2	10	2523480	2523489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_009381	T	7	7	2523486	2523492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_009381	ATT	2	6	2523530	2523535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009381	CCT	2	6	2523545	2523550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_009381	GTT	2	6	2528069	2528074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009381	GAT	2	6	2528094	2528099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009381	TTA	2	6	2528117	2528122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_009381	A	6	6	2528227	2528232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_009381	CT	3	6	2528254	2528259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10066	NC_009381	A	7	7	2528269	2528275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_009381	A	8	8	2528278	2528285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_009381	TTA	2	6	2528331	2528336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_009381	GTTG	2	8	2528359	2528366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_009381	CACTT	2	10	2528373	2528382	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10071	NC_009381	TAAA	2	8	2528386	2528393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_009381	AAAT	2	8	2528455	2528462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_009381	ATA	2	6	2528479	2528484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009381	T	6	6	2528525	2528530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_009381	ATC	2	6	2528596	2528601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10077	NC_009381	T	6	6	2532148	2532153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_009381	GA	3	6	2532229	2532234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_009381	CTC	2	6	2532310	2532315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10082	NC_009381	ATT	3	9	2534748	2534756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_009381	GCG	2	6	2534798	2534803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_009381	AAT	2	6	2534809	2534814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10086	NC_009381	CAGT	2	8	2534864	2534871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_009381	ATCA	2	8	2537352	2537359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10091	NC_009381	ATA	2	6	2537525	2537530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_009381	T	6	6	2537554	2537559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_009381	GTT	2	6	2538122	2538127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10095	NC_009381	CAA	2	6	2538186	2538191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_009381	AGC	2	6	2538210	2538215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10098	NC_009381	GTTG	2	8	2538600	2538607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_009381	GCC	2	6	2538662	2538667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_009381	ATT	2	6	2538716	2538721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_009381	TA	4	8	2538729	2538736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_009381	GTC	2	6	2538740	2538745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_009381	TAT	2	6	2541095	2541100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_009381	AATT	2	8	2541132	2541139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_009381	T	7	7	2542911	2542917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10109	NC_009381	GAT	2	6	2544761	2544766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10111	NC_009381	TCC	2	6	2547303	2547308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_009381	CCT	2	6	2547336	2547341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_009381	T	6	6	2547373	2547378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009381	A	6	6	2547396	2547401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_009381	AGC	2	6	2547418	2547423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_009381	TGT	3	9	2547455	2547463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_009381	T	6	6	2547565	2547570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_009381	ACC	2	6	2547632	2547637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_009381	TGG	2	6	2547642	2547647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10122	NC_009381	AGG	2	6	2548638	2548643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_009381	GCC	2	6	2548658	2548663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_009381	CTAA	2	8	2549936	2549943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_009381	GCA	2	6	2550066	2550071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_009381	ATGG	2	8	2550087	2550094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_009381	CA	3	6	2550171	2550176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_009381	CCT	2	6	2550193	2550198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_009381	TTCA	2	8	2550273	2550280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10130	NC_009381	AGAGA	2	10	2550381	2550390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_009381	TAT	2	6	2550431	2550436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_009381	TTACAT	2	12	2551740	2551751	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10133	NC_009381	TA	3	6	2551832	2551837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_009381	AACG	2	8	2551852	2551859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10135	NC_009381	TGG	2	6	2553761	2553766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_009381	CGT	2	6	2553792	2553797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_009381	TAT	3	9	2553831	2553839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_009381	GGC	2	6	2553870	2553875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10139	NC_009381	TGC	2	6	2553919	2553924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10140	NC_009381	GAC	2	6	2554026	2554031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10141	NC_009381	TAA	2	6	2554977	2554982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_009381	TA	3	6	2555019	2555024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10143	NC_009381	TA	3	6	2555035	2555040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_009381	ATTAT	2	10	2555045	2555054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_009381	A	7	7	2555069	2555075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_009381	AACG	2	8	2555092	2555099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10147	NC_009381	ATA	2	6	2557150	2557155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10148	NC_009381	TGGC	2	8	2557186	2557193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10149	NC_009381	GCC	2	6	2557219	2557224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10150	NC_009381	TGATG	2	10	2561115	2561124	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_009381	TGC	2	6	2561168	2561173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10154	NC_009381	TTG	2	6	2561797	2561802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_009381	A	7	7	2561920	2561926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_009381	TGC	2	6	2561932	2561937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10157	NC_009381	T	7	7	2561949	2561955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10158	NC_009381	GTT	2	6	2561960	2561965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10161	NC_009381	CTTG	2	8	2562016	2562023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10162	NC_009381	GT	3	6	2562071	2562076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_009381	TGA	2	6	2562171	2562176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_009381	ATC	2	6	2562187	2562192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10165	NC_009381	AT	3	6	2562217	2562222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10166	NC_009381	TGA	2	6	2562232	2562237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10170	NC_009381	GTC	2	6	2562281	2562286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10172	NC_009381	CAT	2	6	2562351	2562356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10173	NC_009381	CAT	2	6	2562375	2562380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10175	NC_009381	TAT	2	6	2562463	2562468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10176	NC_009381	AT	3	6	2562471	2562476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10177	NC_009381	TTA	2	6	2562490	2562495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10179	NC_009381	T	6	6	2562513	2562518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10182	NC_009381	TAT	2	6	2562538	2562543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10244	NC_009381	A	6	6	2573237	2573242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_009381	CAA	2	6	2574188	2574193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10247	NC_009381	ATA	2	6	2574243	2574248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_009381	CCT	2	6	2574617	2574622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10249	NC_009381	CAA	2	6	2574632	2574637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_009381	AATA	2	8	2574650	2574657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_009381	TCC	2	6	2574658	2574663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10253	NC_009381	AG	3	6	2575404	2575409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_009381	TGG	2	6	2575607	2575612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_009381	A	6	6	2575664	2575669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_009381	GAT	2	6	2575803	2575808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_009381	TTG	2	6	2583544	2583549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_009381	CAG	2	6	2583567	2583572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10260	NC_009381	AC	3	6	2584744	2584749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10262	NC_009381	CAG	2	6	2585468	2585473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10263	NC_009381	ATAA	2	8	2585483	2585490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10264	NC_009381	AGCA	2	8	2586534	2586541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10265	NC_009381	TGT	2	6	2586582	2586587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10270	NC_009381	CAGG	2	8	2586833	2586840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10385	NC_009381	AT	3	6	2612550	2612555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10386	NC_009381	ATA	2	6	2612564	2612569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10388	NC_009381	ACTG	2	8	2612681	2612688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10389	NC_009381	ATG	2	6	2612746	2612751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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