MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 17625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_009381	A	6	6	2156501	2156506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_009381	AATT	2	8	2156554	2156561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_009381	AAC	2	6	2156562	2156567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_009381	TCT	2	6	2156575	2156580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_009381	GT	3	6	2156602	2156607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_009381	AAT	2	6	2156636	2156641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_009381	GC	3	6	2156678	2156683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8508	NC_009381	ATT	2	6	2156701	2156706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_009381	AGGAA	2	10	2156768	2156777	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_009381	AAT	2	6	2156778	2156783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_009381	GA	3	6	2156811	2156816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_009381	ACAG	2	8	2156817	2156824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8513	NC_009381	CTC	2	6	2156892	2156897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_009381	CAG	2	6	2156939	2156944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_009381	ATA	2	6	2156949	2156954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_009381	GGA	2	6	2156980	2156985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_009381	TCC	2	6	2158108	2158113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8518	NC_009381	TACA	2	8	2158133	2158140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8519	NC_009381	CCGC	2	8	2159120	2159127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8520	NC_009381	TAAA	2	8	2159159	2159166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_009381	AG	3	6	2159184	2159189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_009381	ATT	2	6	2159267	2159272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_009381	CCG	2	6	2160403	2160408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8524	NC_009381	GGC	2	6	2160413	2160418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_009381	CGC	2	6	2160427	2160432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8526	NC_009381	TCA	2	6	2160489	2160494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_009381	ATG	2	6	2161516	2161521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_009381	TTA	2	6	2161522	2161527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_009381	TCA	2	6	2161537	2161542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_009381	CAA	2	6	2161556	2161561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_009381	CAC	2	6	2161568	2161573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_009381	AAT	2	6	2161602	2161607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_009381	ATG	2	6	2161630	2161635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_009381	GTT	2	6	2161658	2161663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_009381	GTT	2	6	2161743	2161748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_009381	TTG	2	6	2161773	2161778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_009381	CG	3	6	2161836	2161841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8538	NC_009381	GC	3	6	2162067	2162072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8539	NC_009381	TG	3	6	2162178	2162183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_009381	GCA	2	6	2162337	2162342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_009381	GAT	2	6	2162379	2162384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_009381	ATG	2	6	2162429	2162434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_009381	GC	3	6	2162497	2162502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8544	NC_009381	CTG	2	6	2162536	2162541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_009381	GTT	2	6	2162556	2162561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_009381	TAA	2	6	2162641	2162646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_009381	AAT	2	6	2162728	2162733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_009381	C	6	6	2162800	2162805	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8549	NC_009381	CA	3	6	2162826	2162831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8550	NC_009381	TGCC	2	8	2162853	2162860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8551	NC_009381	TCCA	2	8	2162914	2162921	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8552	NC_009381	T	7	7	2162944	2162950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_009381	TAA	2	6	2162965	2162970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_009381	AAC	2	6	2163978	2163983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_009381	TCA	2	6	2164004	2164009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_009381	ATAA	2	8	2164062	2164069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_009381	CAG	2	6	2164088	2164093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_009381	TTG	2	6	2165361	2165366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_009381	CAA	2	6	2165427	2165432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8560	NC_009381	CTG	2	6	2165439	2165444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_009381	TAAT	2	8	2165456	2165463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_009381	AAT	2	6	2165486	2165491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_009381	ATT	2	6	2165497	2165502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_009381	T	6	6	2165501	2165506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_009381	AAT	2	6	2165536	2165541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_009381	CAAA	2	8	2165542	2165549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8567	NC_009381	ATC	2	6	2165571	2165576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8569	NC_009381	CAG	2	6	2165628	2165633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_009381	CGG	2	6	2165650	2165655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_009381	CGGTGA	2	12	2165705	2165716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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8573	NC_009381	TTA	2	6	2165751	2165756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_009381	TAA	2	6	2165807	2165812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_009381	AAT	2	6	2165853	2165858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_009381	GAAA	2	8	2166703	2166710	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_009381	TGG	2	6	2167341	2167346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8579	NC_009381	ATT	2	6	2167463	2167468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_009381	T	7	7	2168515	2168521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_009381	TGA	2	6	2168537	2168542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8583	NC_009381	TAA	2	6	2168584	2168589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_009381	GGTA	2	8	2168644	2168651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_009381	T	6	6	2168659	2168664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_009381	A	8	8	2168734	2168741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8589	NC_009381	TA	3	6	2169422	2169427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8595	NC_009381	T	6	6	2169637	2169642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_009381	T	6	6	2169644	2169649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_009381	T	6	6	2169653	2169658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_009381	TGA	2	6	2169665	2169670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8602	NC_009381	C	6	6	2171984	2171989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8603	NC_009381	ACTA	2	8	2172017	2172024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8604	NC_009381	TAT	2	6	2172025	2172030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_009381	GCA	2	6	2172116	2172121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8607	NC_009381	TACT	2	8	2172152	2172159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8612	NC_009381	ATT	2	6	2172859	2172864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_009381	AG	3	6	2172867	2172872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_009381	ATT	2	6	2172895	2172900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_009381	AAAT	2	8	2172916	2172923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_009381	A	7	7	2172929	2172935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_009381	AATA	2	8	2173018	2173025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_009381	TC	3	6	2174221	2174226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8619	NC_009381	T	8	8	2174230	2174237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_009381	TGT	2	6	2174348	2174353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_009381	TAA	2	6	2174366	2174371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_009381	TAG	2	6	2174373	2174378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_009381	GCTA	2	8	2174447	2174454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8624	NC_009381	T	6	6	2174492	2174497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_009381	AAT	2	6	2174570	2174575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_009381	AT	3	6	2174624	2174629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_009381	TGC	3	9	2174650	2174658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_009381	TCG	2	6	2174659	2174664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8630	NC_009381	TTCA	2	8	2176891	2176898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8631	NC_009381	T	6	6	2176968	2176973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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