MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 17625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009381	GAT	2	6	2023112	2023117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_009381	ATA	2	6	2023121	2023126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_009381	ATT	2	6	2023152	2023157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_009381	ATT	2	6	2023167	2023172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_009381	TC	3	6	2023173	2023178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_009381	GCA	2	6	2023263	2023268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_009381	TGA	2	6	2023316	2023321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_009381	CTG	2	6	2023344	2023349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_009381	CTA	2	6	2023394	2023399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_009381	TTA	2	6	2023451	2023456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_009381	ATT	2	6	2023515	2023520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_009381	AAT	2	6	2023582	2023587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_009381	CCCT	2	8	2023614	2023621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8014	NC_009381	TTG	2	6	2025395	2025400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_009381	GGA	2	6	2025488	2025493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_009381	TCC	2	6	2025508	2025513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_009381	T	6	6	2025516	2025521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_009381	GTA	2	6	2025791	2025796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_009381	TTA	2	6	2025877	2025882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_009381	TTA	2	6	2025895	2025900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_009381	ACAG	2	8	2025917	2025924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_009381	A	6	6	2025926	2025931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_009381	T	7	7	2025946	2025952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_009381	A	6	6	2026201	2026206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_009381	GCC	2	6	2026211	2026216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_009381	TAAAA	2	10	2026440	2026449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_009381	T	6	6	2026536	2026541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_009381	AG	3	6	2026595	2026600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_009381	ATG	2	6	2026630	2026635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_009381	G	7	7	2029917	2029923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_009381	C	7	7	2029955	2029961	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8032	NC_009381	TGT	2	6	2030040	2030045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_009381	T	7	7	2030112	2030118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_009381	CT	3	6	2030151	2030156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_009381	T	6	6	2030190	2030195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_009381	ATC	2	6	2030229	2030234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_009381	ATC	2	6	2030255	2030260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_009381	CAT	2	6	2030273	2030278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_009381	CGCCA	2	10	2030290	2030299	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8040	NC_009381	TAT	2	6	2031337	2031342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_009381	CAG	2	6	2031343	2031348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_009381	GATAC	2	10	2031349	2031358	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8043	NC_009381	AAT	2	6	2031363	2031368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_009381	TA	3	6	2031484	2031489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_009381	AT	3	6	2031548	2031553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_009381	ATT	2	6	2032146	2032151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_009381	CTT	2	6	2032407	2032412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_009381	TTG	2	6	2032491	2032496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_009381	A	6	6	2032564	2032569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_009381	TAA	2	6	2032587	2032592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_009381	ACCT	2	8	2032599	2032606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_009381	TAA	2	6	2033133	2033138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_009381	TTA	2	6	2033143	2033148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_009381	GCCT	2	8	2034152	2034159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8055	NC_009381	A	7	7	2034183	2034189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_009381	A	7	7	2034215	2034221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_009381	TAT	2	6	2034254	2034259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_009381	TCA	2	6	2034284	2034289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_009381	TTA	2	6	2034355	2034360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_009381	TCA	2	6	2034609	2034614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_009381	ATT	2	6	2034619	2034624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_009381	TCA	2	6	2034631	2034636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_009381	TATT	2	8	2034708	2034715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009381	T	7	7	2034753	2034759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_009381	T	6	6	2034768	2034773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_009381	AAT	3	9	2034791	2034799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_009381	TAA	3	9	2034832	2034840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_009381	CAT	2	6	2034846	2034851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_009381	ATA	2	6	2034883	2034888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_009381	TTA	2	6	2036232	2036237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_009381	AAT	2	6	2036388	2036393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_009381	TA	3	6	2036395	2036400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_009381	AAAT	2	8	2036409	2036416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8078	NC_009381	TCT	2	6	2037247	2037252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_009381	CTT	2	6	2037269	2037274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_009381	AAGCC	2	10	2038262	2038271	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8081	NC_009381	A	6	6	2038364	2038369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_009381	AT	4	8	2038394	2038401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_009381	AAT	2	6	2038419	2038424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_009381	TAA	2	6	2038443	2038448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_009381	CATGT	2	10	2038479	2038488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8086	NC_009381	CAG	2	6	2038515	2038520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8088	NC_009381	A	7	7	2038548	2038554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_009381	ATA	2	6	2038686	2038691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_009381	A	6	6	2038699	2038704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_009381	ATAA	2	8	2038758	2038765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_009381	ATT	3	9	2038819	2038827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_009381	TA	3	6	2038828	2038833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_009381	AAT	2	6	2038839	2038844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_009381	GGC	2	6	2038859	2038864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_009381	GA	3	6	2038869	2038874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_009381	CTTA	2	8	2038946	2038953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8103	NC_009381	AGTA	2	8	2038970	2038977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_009381	ATT	2	6	2038984	2038989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_009381	TCC	2	6	2039049	2039054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8107	NC_009381	GGT	2	6	2040739	2040744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_009381	ATT	2	6	2040751	2040756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_009381	CATT	2	8	2041048	2041055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_009381	CATT	2	8	2041064	2041071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8111	NC_009381	CTG	2	6	2041110	2041115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_009381	GTT	2	6	2041135	2041140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_009381	ACACA	2	10	2041144	2041153	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8114	NC_009381	GATA	2	8	2041209	2041216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_009381	AGG	2	6	2041295	2041300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_009381	ATGC	2	8	2042364	2042371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8120	NC_009381	GTGA	2	8	2045117	2045124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_009381	AAT	2	6	2046248	2046253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8123	NC_009381	TAT	2	6	2048415	2048420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_009381	C	7	7	2048426	2048432	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8125	NC_009381	ACA	2	6	2049215	2049220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_009381	TTG	2	6	2049227	2049232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_009381	GC	3	6	2049269	2049274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_009381	ATA	2	6	2049340	2049345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_009381	TATT	2	8	2052774	2052781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_009381	GCT	2	6	2052782	2052787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8132	NC_009381	TGC	2	6	2052871	2052876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_009381	CTG	2	6	2052941	2052946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8135	NC_009381	TC	3	6	2053124	2053129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8261	NC_009381	ATAAA	2	10	2097454	2097463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8262	NC_009381	T	7	7	2097475	2097481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8263	NC_009381	ACT	2	6	2097575	2097580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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