MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 16344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008800	GAT	2	6	1118479	1118484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008800	GCA	2	6	1118495	1118500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008800	GGAAA	2	10	1118536	1118545	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008800	A	6	6	1118543	1118548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008800	TA	3	6	1120279	1120284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008800	ATA	2	6	1121267	1121272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008800	T	6	6	1121928	1121933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008800	GGA	2	6	1122635	1122640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008800	TATT	2	8	1122641	1122648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008800	GTG	2	6	1123451	1123456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_008800	T	7	7	1123460	1123466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008800	A	6	6	1123480	1123485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008800	AAT	2	6	1123503	1123508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_008800	TGC	2	6	1123566	1123571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_008800	GATT	2	8	1123583	1123590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008800	ACA	2	6	1123637	1123642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_008800	ATA	2	6	1124103	1124108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008800	T	6	6	1124148	1124153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008800	TA	3	6	1124206	1124211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008800	CCATTT	2	12	1124223	1124234	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008800	GATA	2	8	1124255	1124262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008800	TATC	2	8	1124293	1124300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_008800	GGCA	2	8	1125370	1125377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_008800	A	6	6	1126126	1126131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008800	CTG	2	6	1126157	1126162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_008800	AGA	2	6	1126203	1126208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008800	AGG	2	6	1126226	1126231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008800	AG	3	6	1126249	1126254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008800	T	6	6	1126339	1126344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_008800	TTC	2	6	1127730	1127735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_008800	ATG	2	6	1127752	1127757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008800	TTA	2	6	1128568	1128573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008800	AAT	2	6	1130389	1130394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008800	TGCT	2	8	1130438	1130445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_008800	TGGC	2	8	1130462	1130469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_008800	TAC	2	6	1130472	1130477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_008800	ACAA	2	8	1131097	1131104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_008800	T	6	6	1133195	1133200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008800	GCC	2	6	1134054	1134059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_008800	TTA	2	6	1134079	1134084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_008800	TTAT	2	8	1134108	1134115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008800	TAA	2	6	1134150	1134155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008800	GAA	2	6	1134167	1134172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008800	CCA	2	6	1134363	1134368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_008800	TAAT	2	8	1134370	1134377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008800	GCA	2	6	1137297	1137302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_008800	TAT	2	6	1137394	1137399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008800	CTG	2	6	1137422	1137427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_008800	TCA	3	9	1139814	1139822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_008800	CTG	2	6	1139831	1139836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008800	GCC	2	6	1139851	1139856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_008800	CTG	2	6	1141078	1141083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_008800	TTG	2	6	1141292	1141297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008800	GC	3	6	1141359	1141364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_008800	TGG	2	6	1141464	1141469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008800	A	6	6	1141568	1141573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008800	AAC	2	6	1141599	1141604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008800	AAC	2	6	1141631	1141636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_008800	ATTAT	2	10	1143011	1143020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008800	GGTT	2	8	1144261	1144268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008800	ATAA	2	8	1144279	1144286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008800	T	8	8	1144321	1144328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008800	TGGA	2	8	1144342	1144349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008800	CCT	2	6	1145111	1145116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_008800	TAA	2	6	1145117	1145122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008800	TTA	2	6	1145132	1145137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008800	TG	3	6	1145146	1145151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008800	ATA	2	6	1145207	1145212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008800	TAT	2	6	1145232	1145237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_008800	TAA	2	6	1145349	1145354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008800	GATG	2	8	1145355	1145362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008800	T	6	6	1145378	1145383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008800	ATGAT	2	10	1145691	1145700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008800	TAA	2	6	1145724	1145729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008800	TAA	2	6	1146658	1146663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008800	ATTGT	2	10	1146670	1146679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_008800	ACT	2	6	1146772	1146777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_008800	CCA	2	6	1146784	1146789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_008800	TCT	2	6	1146812	1146817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_008800	TTAT	2	8	1148529	1148536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008800	ATT	2	6	1148577	1148582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_008800	AGC	2	6	1148617	1148622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008800	CGC	2	6	1148646	1148651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_008800	AG	3	6	1148661	1148666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008800	ATA	2	6	1148683	1148688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008800	TCT	2	6	1148694	1148699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_008800	TGA	2	6	1148726	1148731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008800	TAAG	2	8	1149232	1149239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_008800	ATTA	2	8	1149240	1149247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008800	TCG	2	6	1149297	1149302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_008800	ATT	2	6	1149332	1149337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_008800	AAG	2	6	1149380	1149385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008800	TC	3	6	1150856	1150861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_008800	TG	3	6	1150878	1150883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_008800	AGTGG	2	10	1150917	1150926	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008800	CAA	2	6	1150936	1150941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_008800	TTAT	2	8	1150970	1150977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008800	ATT	2	6	1151019	1151024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_008800	AAT	2	6	1151025	1151030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008800	TCG	2	6	1151047	1151052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_008800	GC	3	6	1151075	1151080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_008800	TGC	2	6	1151107	1151112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008800	AG	4	8	1151144	1151151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008800	CAG	2	6	1155075	1155080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_008800	GAT	2	6	1155089	1155094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008800	CTTT	2	8	1155099	1155106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_008800	TGT	2	6	1155115	1155120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008800	TAT	2	6	1155605	1155610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008800	T	6	6	1155610	1155615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008800	TTATTT	2	12	1155629	1155640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008800	GTG	3	9	1155713	1155721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008800	AAT	2	6	1155777	1155782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008800	GTCT	2	8	1155857	1155864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_008800	TATTT	2	10	1155899	1155908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008800	AATTT	2	10	1155994	1156003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008800	T	8	8	1156001	1156008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_008800	TAT	2	6	1156013	1156018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008800	ATTG	2	8	1156021	1156028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008800	ATT	2	6	1156062	1156067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008800	CCG	2	6	1156103	1156108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_008800	ATG	2	6	1156141	1156146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_008800	TG	3	6	1156184	1156189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008800	GAC	2	6	1156211	1156216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008800	TGAG	2	8	1156221	1156228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008800	GCC	2	6	1156231	1156236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_008800	CTG	2	6	1156243	1156248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_008800	TGA	2	6	1156249	1156254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008800	TCA	2	6	1156260	1156265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_008800	TCC	2	6	1156298	1156303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_008800	GAT	2	6	1156305	1156310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_008800	TCA	2	6	1156321	1156326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_008800	ATT	2	6	1156450	1156455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_008800	CAT	2	6	1156461	1156466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_008800	TGA	3	9	1156525	1156533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_008800	AAT	2	6	1156541	1156546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_008800	TTAA	2	8	1156559	1156566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_008800	T	9	9	1156592	1156600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_008800	TCAA	2	8	1156604	1156611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4141	NC_008800	TTA	2	6	1158173	1158178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_008800	ACT	2	6	1158211	1158216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4144	NC_008800	TC	3	6	1160689	1160694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4145	NC_008800	TGC	2	6	1160698	1160703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_008800	ATT	2	6	1160719	1160724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_008800	TA	3	6	1160730	1160735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_008800	TTAT	2	8	1160736	1160743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_008800	TCA	2	6	1162783	1162788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4150	NC_008800	CGTTT	2	10	1162799	1162808	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4151	NC_008800	T	6	6	1162821	1162826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_008800	GCA	2	6	1162872	1162877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4154	NC_008800	GTGA	2	8	1162920	1162927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_008800	AAC	2	6	1162936	1162941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_008800	TGT	2	6	1166859	1166864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_008800	AT	3	6	1168366	1168371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_008800	T	7	7	1168419	1168425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_008800	GAAAT	2	10	1168465	1168474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4174	NC_008800	CCGT	2	8	1171449	1171456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4247	NC_008800	AGTA	2	8	1205600	1205607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_008800	AGG	2	6	1205625	1205630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_008800	TCT	2	6	1205670	1205675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4251	NC_008800	GA	3	6	1208314	1208319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_008800	TCT	2	6	1208563	1208568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_008800	AAT	2	6	1208581	1208586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_008800	CTG	2	6	1211638	1211643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_008800	TGCTG	2	10	1211679	1211688	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4256	NC_008800	CTT	2	6	1211703	1211708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_008800	AAT	3	9	1211735	1211743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_008800	CT	3	6	1211749	1211754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_008800	ATTA	2	8	1211761	1211768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_008800	TAA	2	6	1213371	1213376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_008800	TCTAA	2	10	1213386	1213395	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4262	NC_008800	T	7	7	1213420	1213426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_008800	TAAATA	2	12	1213467	1213478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_008800	A	6	6	1213478	1213483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_008800	AATT	2	8	1213486	1213493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_008800	GTT	2	6	1213502	1213507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_008800	A	6	6	1213538	1213543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_008800	ATT	2	6	1213548	1213553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_008800	A	6	6	1213570	1213575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_008800	CTTA	2	8	1213589	1213596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4275	NC_008800	CT	3	6	1219231	1219236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4398	NC_008800	CTCA	2	8	1257480	1257487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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