MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 16344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008800	GC	3	6	4501209	4501214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16002	NC_008800	ATAC	2	8	4501238	4501245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16003	NC_008800	CAA	2	6	4501372	4501377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_008800	GCCC	2	8	4501386	4501393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16005	NC_008800	ATG	2	6	4501495	4501500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_008800	TC	3	6	4501527	4501532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16007	NC_008800	AATT	2	8	4501544	4501551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_008800	AATA	2	8	4501587	4501594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_008800	AGA	2	6	4501595	4501600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_008800	AAAT	2	8	4501674	4501681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_008800	AGC	2	6	4501723	4501728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_008800	CGC	2	6	4501841	4501846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16013	NC_008800	GTT	2	6	4501860	4501865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_008800	TTC	2	6	4501938	4501943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_008800	GGC	2	6	4501978	4501983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_008800	AGCC	2	8	4502011	4502018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16017	NC_008800	TAA	2	6	4502034	4502039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_008800	TTA	2	6	4502062	4502067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_008800	CAA	2	6	4502089	4502094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_008800	TAAT	2	8	4502137	4502144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_008800	GAATA	2	10	4502171	4502180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_008800	TTC	2	6	4502289	4502294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_008800	GTT	2	6	4502324	4502329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_008800	ATC	2	6	4502403	4502408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_008800	CTC	2	6	4502409	4502414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16026	NC_008800	ATCC	2	8	4502458	4502465	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16027	NC_008800	TCCA	2	8	4502478	4502485	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16028	NC_008800	TCA	2	6	4502539	4502544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_008800	G	8	8	4502550	4502557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_008800	CGG	2	6	4502590	4502595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_008800	CTGGC	2	10	4502601	4502610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16032	NC_008800	TCAA	2	8	4502684	4502691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16033	NC_008800	CTGATA	2	12	4502696	4502707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16034	NC_008800	CTG	2	6	4502713	4502718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_008800	GCC	2	6	4502779	4502784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16036	NC_008800	CAGA	2	8	4504101	4504108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16037	NC_008800	GAGAA	2	10	4504152	4504161	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_008800	GGC	2	6	4504218	4504223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_008800	GCC	2	6	4504245	4504250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16040	NC_008800	GAT	2	6	4504262	4504267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_008800	AGA	2	6	4504275	4504280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_008800	TAT	2	6	4504312	4504317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_008800	ATTC	2	8	4504326	4504333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16044	NC_008800	ATG	2	6	4504341	4504346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_008800	AT	3	6	4508393	4508398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_008800	AT	3	6	4508451	4508456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_008800	A	6	6	4508466	4508471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_008800	TTG	2	6	4509537	4509542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_008800	T	6	6	4509591	4509596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_008800	TTTC	2	8	4509630	4509637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16051	NC_008800	TAAT	2	8	4509700	4509707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_008800	TAA	2	6	4509736	4509741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_008800	GA	3	6	4509774	4509779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_008800	AACA	2	8	4509782	4509789	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16055	NC_008800	ATA	2	6	4509818	4509823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_008800	CT	3	6	4511288	4511293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16057	NC_008800	ATTCC	2	10	4513601	4513610	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16058	NC_008800	ATTG	2	8	4513612	4513619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_008800	GGT	2	6	4513720	4513725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_008800	A	6	6	4513726	4513731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_008800	ATG	2	6	4513752	4513757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_008800	CT	3	6	4516779	4516784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16063	NC_008800	GTCTT	2	10	4516791	4516800	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16064	NC_008800	AAT	2	6	4516837	4516842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_008800	TTG	2	6	4516913	4516918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_008800	CCTG	2	8	4516974	4516981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16067	NC_008800	T	6	6	4516993	4516998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_008800	TAA	2	6	4517010	4517015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_008800	ATG	2	6	4519878	4519883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_008800	ATA	2	6	4519901	4519906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_008800	CAT	2	6	4519960	4519965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_008800	TAA	2	6	4523315	4523320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_008800	TC	3	6	4525880	4525885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_008800	TC	3	6	4528939	4528944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16075	NC_008800	TTCA	2	8	4528946	4528953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16076	NC_008800	CAA	2	6	4528996	4529001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_008800	TA	3	6	4529061	4529066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_008800	CA	3	6	4529980	4529985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16079	NC_008800	TTAA	2	8	4530021	4530028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_008800	T	7	7	4530062	4530068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_008800	GCC	2	6	4530071	4530076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16082	NC_008800	GAT	2	6	4530093	4530098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16084	NC_008800	AT	3	6	4530761	4530766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_008800	T	6	6	4530791	4530796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_008800	AAG	2	6	4530836	4530841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_008800	AAT	2	6	4530886	4530891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_008800	CGG	2	6	4530905	4530910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_008800	TAA	2	6	4531008	4531013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_008800	TGAT	2	8	4531040	4531047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_008800	GCA	2	6	4531050	4531055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16093	NC_008800	CAGG	2	8	4533060	4533067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16094	NC_008800	ATTA	2	8	4533784	4533791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_008800	AATT	2	8	4533855	4533862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_008800	AT	3	6	4533891	4533896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_008800	A	6	6	4534653	4534658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16099	NC_008800	CA	3	6	4534680	4534685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16100	NC_008800	CTG	2	6	4534716	4534721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_008800	AGA	2	6	4534762	4534767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_008800	GATAG	2	10	4535288	4535297	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_008800	CTTCTG	2	12	4536881	4536892	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_008800	GGT	2	6	4538130	4538135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_008800	TG	3	6	4539411	4539416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_008800	GCT	2	6	4539483	4539488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_008800	CT	3	6	4539487	4539492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16108	NC_008800	GCC	2	6	4539541	4539546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16109	NC_008800	ATT	2	6	4539561	4539566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_008800	TTGTT	2	10	4541595	4541604	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_008800	CCG	2	6	4541623	4541628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_008800	AAAC	2	8	4541659	4541666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16113	NC_008800	CA	3	6	4541720	4541725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16114	NC_008800	TAA	2	6	4541779	4541784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_008800	ACC	2	6	4541945	4541950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16116	NC_008800	TAA	2	6	4541965	4541970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_008800	AAC	2	6	4541971	4541976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_008800	AGG	3	9	4541977	4541985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_008800	GCC	2	6	4542045	4542050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16120	NC_008800	AGG	2	6	4542061	4542066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_008800	CCT	2	6	4542077	4542082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16122	NC_008800	GC	3	6	4542172	4542177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16123	NC_008800	GCC	2	6	4542308	4542313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16125	NC_008800	ATG	2	6	4542404	4542409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_008800	AACCG	2	10	4542537	4542546	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16127	NC_008800	ACT	2	6	4543294	4543299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16128	NC_008800	CTT	2	6	4543384	4543389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_008800	CGC	2	6	4543411	4543416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16131	NC_008800	CAAG	2	8	4543521	4543528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.