MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 plasmid pYVe8081

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008791	ATAA	2	8	25	32	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008791	CAA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008791	A	8	8	106	113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008791	GGCT	2	8	176	183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008791	AGAGA	2	10	200	209	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008791	ATTA	2	8	361	368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008791	TCG	2	6	371	376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008791	GCAGG	2	10	398	407	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008791	TAT	2	6	473	478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008791	GTTG	2	8	547	554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008791	AAT	2	6	555	560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008791	GAT	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008791	TAC	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008791	TAA	2	6	2879	2884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008791	TCC	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008791	AT	3	6	3041	3046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008791	ATT	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008791	GAAT	2	8	3055	3062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008791	TAT	2	6	3081	3086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008791	AACAT	2	10	3117	3126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008791	TAA	2	6	3153	3158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008791	A	6	6	3179	3184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008791	ACA	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008791	AAT	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008791	TA	3	6	4754	4759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008791	ATT	2	6	4803	4808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008791	AAT	2	6	4851	4856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008791	ATT	2	6	4858	4863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008791	TTA	2	6	4865	4870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008791	TAA	2	6	4922	4927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008791	CCA	2	6	4929	4934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008791	TC	3	6	5178	5183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008791	TTC	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008791	CGA	2	6	5417	5422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008791	GGT	2	6	5521	5526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008791	ATT	2	6	5536	5541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008791	ATT	2	6	5574	5579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008791	CAA	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008791	AT	3	6	5592	5597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008791	CAT	2	6	5619	5624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008791	TGT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008791	AT	3	6	5691	5696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008791	AAT	2	6	5750	5755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008791	TTA	2	6	5826	5831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008791	T	7	7	5888	5894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008791	TGG	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008791	TTTA	2	8	5922	5929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008791	T	6	6	5959	5964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008791	T	6	6	6026	6031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008791	T	8	8	6033	6040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008791	G	6	6	6264	6269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008791	TTTA	2	8	6285	6292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008791	ATA	3	9	6369	6377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008791	TAA	2	6	6396	6401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008791	GCA	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008791	TTG	2	6	6428	6433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008791	AAT	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008791	TAA	2	6	6473	6478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008791	ACC	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008791	GTC	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008791	T	6	6	6671	6676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008791	ATT	2	6	6704	6709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008791	GCT	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008791	GCA	2	6	6735	6740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008791	CTTT	2	8	6755	6762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008791	AATG	2	8	6859	6866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008791	AAG	2	6	6952	6957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008791	AATT	2	8	6960	6967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008791	CAT	2	6	6987	6992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008791	ATT	2	6	7004	7009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008791	A	6	6	7084	7089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008791	GC	3	6	7124	7129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008791	ACTG	2	8	7212	7219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008791	CAA	2	6	7370	7375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008791	A	6	6	7403	7408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008791	TAA	2	6	7572	7577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008791	ATTT	2	8	7640	7647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008791	TAT	2	6	8854	8859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008791	T	6	6	8864	8869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008791	A	7	7	8871	8877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008791	TA	3	6	8893	8898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008791	ATAA	2	8	8931	8938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008791	AGA	2	6	8941	8946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008791	AGT	2	6	9219	9224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008791	TTC	2	6	9252	9257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008791	ATT	2	6	9335	9340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008791	TAT	2	6	9367	9372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008791	CTG	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008791	CAA	2	6	9424	9429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008791	TTTTA	2	10	9476	9485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008791	TTA	2	6	9505	9510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008791	TAA	3	9	9520	9528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008791	TA	3	6	9580	9585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008791	TAAA	2	8	9610	9617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008791	TTAA	2	8	9626	9633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008791	TCC	2	6	10581	10586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008791	ATCT	2	8	13550	13557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008791	CTATT	2	10	13559	13568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008791	TTATTT	2	12	13572	13583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008791	ACT	2	6	18334	18339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008791	TGC	2	6	18429	18434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008791	T	6	6	18473	18478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008791	TTG	2	6	25401	25406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008791	T	7	7	25440	25446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008791	CAA	2	6	25511	25516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008791	AT	3	6	25537	25542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008791	AT	3	6	25558	25563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008791	T	7	7	25641	25647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008791	ATA	2	6	25659	25664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008791	TGTT	2	8	25689	25696	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008791	CTTT	2	8	25724	25731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008791	GAAA	2	8	25735	25742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008791	AC	3	6	25759	25764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008791	TAAAT	2	10	25786	25795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008791	GTT	2	6	25833	25838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008791	AAT	2	6	25846	25851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008791	CAC	2	6	25858	25863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008791	ATC	2	6	25887	25892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008791	TCT	2	6	25899	25904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008791	TG	3	6	25906	25911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008791	TAT	2	6	26333	26338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008791	TTGGTT	2	12	26340	26351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008791	CGCA	2	8	26374	26381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008791	TAA	2	6	26382	26387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008791	AT	3	6	26410	26415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008791	T	10	10	27275	27284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008791	A	7	7	27285	27291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008791	ATC	2	6	27509	27514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008791	TA	3	6	27521	27526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008791	GGT	2	6	27527	27532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008791	T	7	7	27551	27557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008791	TTAT	2	8	27616	27623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008791	AT	3	6	34808	34813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008791	TAT	2	6	34827	34832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008791	AAT	2	6	34895	34900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008791	T	6	6	34900	34905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008791	A	7	7	34934	34940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008791	ATAA	2	8	34971	34978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008791	ATA	2	6	35370	35375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008791	TA	3	6	35374	35379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008791	ATA	2	6	35399	35404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008791	AAT	3	9	35475	35483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008791	CTC	2	6	35534	35539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_008791	ATT	2	6	35803	35808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008791	T	6	6	35836	35841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008791	A	6	6	35842	35847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008791	TA	3	6	35865	35870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008791	A	6	6	35887	35892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008791	TAA	2	6	35906	35911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008791	TAT	2	6	35946	35951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008791	ATA	2	6	35956	35961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008791	A	6	6	35978	35983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.