MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 16384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008150	TC	3	6	3984001	3984006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_008150	TGG	2	6	3984020	3984025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_008150	T	8	8	3984083	3984090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_008150	CAA	2	6	3984208	3984213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_008150	GGA	2	6	3984787	3984792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_008150	TATT	2	8	3984793	3984800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_008150	A	7	7	3984822	3984828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_008150	AAC	2	6	3984831	3984836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_008150	ACC	2	6	3988936	3988941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_008150	CAG	2	6	3989559	3989564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_008150	AT	3	6	3989591	3989596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_008150	TAG	2	6	3989606	3989611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_008150	GTAA	2	8	3989639	3989646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_008150	TTG	2	6	3989655	3989660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_008150	CAA	2	6	3989680	3989685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_008150	CGC	2	6	3989723	3989728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_008150	TGG	2	6	3991950	3991955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_008150	TAT	2	6	3992951	3992956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_008150	CATAAT	2	12	3992960	3992971	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14020	NC_008150	AAG	2	6	3993004	3993009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_008150	AAC	2	6	3993066	3993071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_008150	CAGT	2	8	3993106	3993113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14023	NC_008150	GTGC	2	8	3993125	3993132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14024	NC_008150	AAC	2	6	3993137	3993142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_008150	CAGC	2	8	3993198	3993205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14026	NC_008150	TGA	2	6	3993267	3993272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_008150	GC	3	6	3993337	3993342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14028	NC_008150	AAC	2	6	3993347	3993352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_008150	GAAAAA	2	12	3993376	3993387	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_008150	CAG	2	6	3993391	3993396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_008150	CTGG	2	8	3993406	3993413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14032	NC_008150	T	7	7	3993436	3993442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_008150	GAAA	2	8	3993548	3993555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_008150	TGA	2	6	3993559	3993564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_008150	GCG	2	6	3995252	3995257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_008150	TAT	2	6	3995286	3995291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_008150	AAT	2	6	3995317	3995322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_008150	T	6	6	3995354	3995359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_008150	T	6	6	3995369	3995374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_008150	GAT	2	6	3995381	3995386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_008150	TA	3	6	3995423	3995428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_008150	AAAT	2	8	3995482	3995489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_008150	AAAT	2	8	3995544	3995551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_008150	AGA	2	6	3995565	3995570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_008150	TAC	2	6	3995576	3995581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_008150	ATA	2	6	3995582	3995587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_008150	A	7	7	3995590	3995596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_008150	TAC	2	6	3995603	3995608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_008150	AT	3	6	3995619	3995624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_008150	TCAAT	2	10	3995689	3995698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14051	NC_008150	TGC	2	6	3995733	3995738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_008150	GA	3	6	3995748	3995753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_008150	TA	3	6	3995775	3995780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_008150	CGT	2	6	3995849	3995854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_008150	AGCG	2	8	3995916	3995923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14056	NC_008150	TACA	2	8	3995960	3995967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14057	NC_008150	ATCA	2	8	3995978	3995985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14058	NC_008150	ACC	2	6	3996024	3996029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14059	NC_008150	CCG	2	6	3996033	3996038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14060	NC_008150	T	7	7	3996042	3996048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_008150	CGG	2	6	3996088	3996093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_008150	ATC	2	6	3996120	3996125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_008150	CGG	2	6	3999470	3999475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_008150	CGG	2	6	3999482	3999487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_008150	GTTA	2	8	4000309	4000316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_008150	ATTC	2	8	4000463	4000470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14068	NC_008150	ATA	2	6	4002866	4002871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_008150	GTT	2	6	4002874	4002879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14071	NC_008150	ATCA	2	8	4002936	4002943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_008150	GTT	2	6	4002965	4002970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_008150	CAGA	2	8	4003010	4003017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14074	NC_008150	TA	3	6	4003076	4003081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_008150	CAAG	2	8	4003087	4003094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14076	NC_008150	A	6	6	4003105	4003110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_008150	GCCA	2	8	4003116	4003123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14078	NC_008150	CT	3	6	4003135	4003140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14079	NC_008150	GTT	2	6	4003172	4003177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14082	NC_008150	A	7	7	4003286	4003292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_008150	GA	3	6	4006285	4006290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_008150	CCCT	2	8	4006343	4006350	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14085	NC_008150	CTC	2	6	4006366	4006371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14088	NC_008150	GAC	2	6	4006458	4006463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14092	NC_008150	CAA	2	6	4020672	4020677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_008150	CCT	2	6	4027298	4027303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_008150	TAA	2	6	4027330	4027335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_008150	AAC	2	6	4030444	4030449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_008150	ATTT	2	8	4030450	4030457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_008150	AAAATA	2	12	4030485	4030496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_008150	ATT	2	6	4030547	4030552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_008150	GT	3	6	4030563	4030568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_008150	GAA	2	6	4030570	4030575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_008150	T	6	6	4030609	4030614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_008150	AAT	2	6	4030645	4030650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_008150	CGC	2	6	4030665	4030670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14104	NC_008150	CGA	2	6	4030726	4030731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_008150	ATA	2	6	4030737	4030742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_008150	GAT	2	6	4030750	4030755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_008150	CGC	2	6	4031573	4031578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14108	NC_008150	CAG	2	6	4031579	4031584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14110	NC_008150	TGA	2	6	4032002	4032007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_008150	CAT	2	6	4032085	4032090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_008150	ACCT	2	8	4032110	4032117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14113	NC_008150	ATC	2	6	4032134	4032139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_008150	CA	3	6	4032233	4032238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14115	NC_008150	ACC	2	6	4032443	4032448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14116	NC_008150	GCC	2	6	4032457	4032462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14117	NC_008150	ACG	2	6	4032530	4032535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14119	NC_008150	AC	3	6	4032630	4032635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14120	NC_008150	AGC	2	6	4032829	4032834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14122	NC_008150	TGA	2	6	4032963	4032968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14124	NC_008150	ACC	2	6	4033078	4033083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14125	NC_008150	AGCT	2	8	4033136	4033143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14126	NC_008150	CTC	2	6	4033197	4033202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14128	NC_008150	CCA	2	6	4033241	4033246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14130	NC_008150	CAT	2	6	4033496	4033501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14131	NC_008150	GCC	2	6	4033571	4033576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14132	NC_008150	TTA	2	6	4033697	4033702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_008150	CAGC	2	8	4033711	4033718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14139	NC_008150	C	6	6	4034057	4034062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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14144	NC_008150	CTGT	2	8	4034432	4034439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14145	NC_008150	GTT	2	6	4034498	4034503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14149	NC_008150	TCGGT	2	10	4034745	4034754	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14150	NC_008150	CAC	2	6	4034931	4034936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14152	NC_008150	GTCA	2	8	4035039	4035046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14153	NC_008150	GGA	2	6	4035062	4035067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14163	NC_008150	TGG	2	6	4035701	4035706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14174	NC_008150	GT	3	6	4036150	4036155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14247	NC_008150	TAT	2	6	4062802	4062807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14250	NC_008150	GAA	2	6	4063496	4063501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_008150	A	6	6	4063500	4063505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_008150	AAT	2	6	4064036	4064041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_008150	AAAG	2	8	4064153	4064160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_008150	AC	3	6	4064215	4064220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14255	NC_008150	TTG	2	6	4064272	4064277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_008150	GTA	2	6	4065530	4065535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14257	NC_008150	AAGAC	2	10	4065661	4065670	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14258	NC_008150	CTG	2	6	4065685	4065690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14260	NC_008150	AACA	2	8	4066656	4066663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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