MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 16384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008150	CAA	2	6	2762640	2762645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_008150	A	6	6	2762753	2762758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_008150	AGCAC	2	10	2762793	2762802	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10004	NC_008150	CGT	2	6	2762833	2762838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_008150	CCA	2	6	2762841	2762846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_008150	CGG	2	6	2762946	2762951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_008150	GTT	2	6	2762971	2762976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_008150	GAA	2	6	2763004	2763009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_008150	TTG	2	6	2763046	2763051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_008150	CGG	2	6	2763080	2763085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_008150	ATG	2	6	2763098	2763103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_008150	A	7	7	2763287	2763293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_008150	CTT	2	6	2764513	2764518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_008150	T	6	6	2764556	2764561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_008150	GGT	2	6	2764593	2764598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_008150	ACG	2	6	2764632	2764637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_008150	CT	3	6	2764650	2764655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_008150	CAT	2	6	2766183	2766188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_008150	CCCG	2	8	2766211	2766218	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10020	NC_008150	TTTTA	2	10	2766249	2766258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_008150	GCC	2	6	2766295	2766300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_008150	TAA	2	6	2766341	2766346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_008150	AAT	2	6	2766379	2766384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_008150	AAT	2	6	2766421	2766426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_008150	GCT	2	6	2768091	2768096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_008150	ATC	2	6	2768103	2768108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_008150	TGA	2	6	2770591	2770596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_008150	ATT	2	6	2770685	2770690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_008150	CAA	2	6	2770768	2770773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_008150	ATT	2	6	2770905	2770910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_008150	GT	3	6	2770974	2770979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_008150	GCT	2	6	2771049	2771054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_008150	A	6	6	2771087	2771092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_008150	ATT	2	6	2771099	2771104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_008150	CAT	2	6	2771105	2771110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_008150	T	6	6	2771129	2771134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10038	NC_008150	CGG	2	6	2771186	2771191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_008150	CAA	2	6	2771210	2771215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_008150	TCACA	2	10	2771290	2771299	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10041	NC_008150	ACA	2	6	2771315	2771320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_008150	AAT	3	9	2772256	2772264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_008150	TGA	2	6	2772293	2772298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_008150	GGT	2	6	2772324	2772329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_008150	T	7	7	2772346	2772352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_008150	ATC	2	6	2772381	2772386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_008150	TCA	2	6	2772389	2772394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10049	NC_008150	TCC	2	6	2774575	2774580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_008150	T	6	6	2774609	2774614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_008150	CTT	2	6	2774619	2774624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_008150	T	6	6	2774636	2774641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_008150	ATG	2	6	2775206	2775211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_008150	ATT	2	6	2775223	2775228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_008150	GTC	2	6	2775253	2775258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_008150	GTT	2	6	2775335	2775340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_008150	GCTAT	2	10	2775358	2775367	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10058	NC_008150	TC	3	6	2775373	2775378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_008150	TATGA	2	10	2775381	2775390	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_008150	GAT	2	6	2775395	2775400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_008150	GCC	2	6	2775438	2775443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_008150	AGG	2	6	2778031	2778036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_008150	CAC	2	6	2780358	2780363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_008150	CCG	2	6	2780384	2780389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_008150	CGG	2	6	2780437	2780442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_008150	CAT	2	6	2780471	2780476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_008150	TGGCTC	2	12	2781389	2781400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_008150	GTTGA	2	10	2783405	2783414	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_008150	AAAT	2	8	2783490	2783497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_008150	AACG	2	8	2785747	2785754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10071	NC_008150	TGG	2	6	2787656	2787661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_008150	CGT	2	6	2787687	2787692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_008150	TAA	2	6	2787722	2787727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_008150	TAACCG	2	12	2787731	2787742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_008150	AT	3	6	2787811	2787816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10078	NC_008150	GCC	2	6	2787950	2787955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_008150	TGT	3	9	2788074	2788082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10081	NC_008150	CGG	2	6	2789411	2789416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_008150	TA	3	6	2789761	2789766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_008150	GCCC	2	8	2789820	2789827	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10084	NC_008150	T	6	6	2789852	2789857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_008150	CCA	2	6	2790704	2790709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10088	NC_008150	AACG	2	8	2790785	2790792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10089	NC_008150	GA	3	6	2790829	2790834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_008150	TTA	2	6	2791863	2791868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10093	NC_008150	A	6	6	2791890	2791895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_008150	T	8	8	2791917	2791924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_008150	CTT	2	6	2792270	2792275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_008150	TTC	2	6	2792282	2792287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10100	NC_008150	GAT	2	6	2792546	2792551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_008150	TAT	2	6	2792552	2792557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_008150	AAT	2	6	2792589	2792594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_008150	ATG	2	6	2792712	2792717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10105	NC_008150	ATA	2	6	2793294	2793299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_008150	ATGT	2	8	2793391	2793398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_008150	AAC	2	6	2793430	2793435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_008150	T	6	6	2793438	2793443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_008150	TTA	2	6	2793450	2793455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_008150	ATCT	2	8	2793473	2793480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_008150	TC	3	6	2793498	2793503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_008150	ATC	2	6	2793536	2793541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_008150	ACGCTA	2	12	2793574	2793585	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_008150	A	6	6	2793591	2793596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_008150	TACAG	2	10	2793891	2793900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10116	NC_008150	T	6	6	2793912	2793917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_008150	A	6	6	2793936	2793941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_008150	GA	3	6	2793942	2793947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_008150	T	6	6	2793964	2793969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_008150	ACC	2	6	2793993	2793998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_008150	TAT	2	6	2794082	2794087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_008150	TGA	2	6	2794720	2794725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10124	NC_008150	AC	3	6	2795604	2795609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_008150	CGG	2	6	2795631	2795636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_008150	AGT	2	6	2795781	2795786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_008150	AT	3	6	2795826	2795831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_008150	AGC	2	6	2795832	2795837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_008150	CATG	2	8	2795867	2795874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10130	NC_008150	AGC	2	6	2795886	2795891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_008150	ATT	2	6	2795934	2795939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_008150	GCT	2	6	2795979	2795984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_008150	GTT	2	6	2796978	2796983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_008150	TCAA	2	8	2797275	2797282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10135	NC_008150	CACT	2	8	2797494	2797501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10136	NC_008150	ACA	2	6	2797509	2797514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_008150	TTA	3	9	2797596	2797604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_008150	ATA	2	6	2797664	2797669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_008150	CTA	2	6	2797672	2797677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10140	NC_008150	AAT	2	6	2797699	2797704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_008150	CAC	2	6	2797712	2797717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10142	NC_008150	GCG	2	6	2797719	2797724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10143	NC_008150	ACC	2	6	2797735	2797740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10144	NC_008150	T	7	7	2797775	2797781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_008150	TCT	2	6	2797797	2797802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10146	NC_008150	GAT	2	6	2797856	2797861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_008150	CCG	2	6	2798214	2798219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10148	NC_008150	CAA	2	6	2800048	2800053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10150	NC_008150	T	7	7	2800542	2800548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_008150	ACT	2	6	2800553	2800558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10154	NC_008150	ATA	2	6	2800577	2800582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_008150	AAT	2	6	2800583	2800588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10157	NC_008150	TCC	2	6	2808105	2808110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10160	NC_008150	TGT	2	6	2809143	2809148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10161	NC_008150	GGTC	2	8	2809187	2809194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10165	NC_008150	CATT	2	8	2810316	2810323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10166	NC_008150	T	6	6	2810351	2810356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10167	NC_008150	T	7	7	2810372	2810378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10168	NC_008150	AGTT	2	8	2810388	2810395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10172	NC_008150	TGAC	2	8	2813989	2813996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10175	NC_008150	AAAT	2	8	2814039	2814046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10187	NC_008150	TTA	2	6	2816363	2816368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10188	NC_008150	A	7	7	2816377	2816383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10244	NC_008150	CCT	2	6	2831217	2831222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10245	NC_008150	GT	3	6	2831271	2831276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_008150	CAT	2	6	2831301	2831306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10249	NC_008150	TC	3	6	2833412	2833417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10250	NC_008150	CGT	2	6	2833418	2833423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_008150	T	6	6	2833466	2833471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_008150	ATTAA	2	10	2833489	2833498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_008150	A	9	9	2833497	2833505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_008150	TCAG	2	8	2833509	2833516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10255	NC_008150	AAT	2	6	2833532	2833537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_008150	ATTT	2	8	2833613	2833620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_008150	TA	3	6	2833693	2833698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_008150	TCA	2	6	2833720	2833725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10260	NC_008150	TTA	2	6	2833777	2833782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_008150	TA	3	6	2834371	2834376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_008150	GTT	2	6	2835994	2835999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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