MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008149	TTTAA	2	10	895925	895934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_008149	GTTAG	2	10	895946	895955	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008149	ATA	2	6	896001	896006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008149	A	6	6	896050	896055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008149	AAT	2	6	896103	896108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008149	CGC	2	6	896109	896114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_008149	T	6	6	896161	896166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008149	CAT	2	6	896191	896196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_008149	ATG	2	6	896208	896213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008149	GTT	2	6	896998	897003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008149	AAAT	2	8	897048	897055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008149	TGC	2	6	897079	897084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_008149	GTT	2	6	897139	897144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008149	TTCA	2	8	897152	897159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_008149	C	6	6	897217	897222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3016	NC_008149	CGT	2	6	897243	897248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008149	TAT	2	6	897265	897270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008149	CTG	2	6	897330	897335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_008149	T	8	8	897345	897352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008149	ATT	2	6	897355	897360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008149	CGG	2	6	901370	901375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_008149	AAC	2	6	901459	901464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_008149	TTAT	2	8	902226	902233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008149	TTAT	2	8	902246	902253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008149	T	6	6	902270	902275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008149	T	6	6	902322	902327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008149	GCTG	2	8	902384	902391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_008149	CT	3	6	902463	902468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_008149	TA	3	6	903083	903088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008149	ATT	2	6	903089	903094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008149	TA	3	6	903096	903101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008149	AT	3	6	903117	903122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008149	CTC	2	6	903129	903134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_008149	TAA	2	6	903142	903147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008149	TTA	3	9	903548	903556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008149	TCT	2	6	903563	903568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_008149	G	6	6	903581	903586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008149	TCC	2	6	903595	903600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_008149	T	6	6	905857	905862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008149	TCTA	2	8	905915	905922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_008149	AT	3	6	905936	905941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008149	AAT	2	6	905971	905976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008149	ATG	2	6	906020	906025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008149	AGA	3	9	906045	906053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008149	CTTT	2	8	906166	906173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_008149	GTTT	2	8	906208	906215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008149	TAT	2	6	906303	906308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008149	AT	4	8	906335	906342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008149	CCT	2	6	907376	907381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_008149	AGG	2	6	907385	907390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008149	TGAAC	3	15	910746	910760	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3052	NC_008149	GTG	2	6	910795	910800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008149	G	6	6	910832	910837	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008149	TGA	2	6	910853	910858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008149	T	7	7	910865	910871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008149	AATA	2	8	910884	910891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008149	AG	3	6	910914	910919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008149	AATA	2	8	916845	916852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008149	ATT	2	6	916890	916895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008149	TGA	2	6	916911	916916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_008149	GCA	2	6	916919	916924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_008149	AAT	2	6	916938	916943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008149	CAT	2	6	916977	916982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_008149	ATT	2	6	916983	916988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008149	GT	3	6	917005	917010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008149	CAT	2	6	917026	917031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_008149	CAT	2	6	917037	917042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_008149	A	6	6	918461	918466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008149	T	6	6	918478	918483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008149	TGC	2	6	918602	918607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_008149	CTA	2	6	918658	918663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_008149	GCA	2	6	918667	918672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_008149	ATTT	2	8	918677	918684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008149	G	6	6	918690	918695	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008149	AG	3	6	919289	919294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_008149	AAAC	2	8	920399	920406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_008149	TGTT	2	8	920428	920435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008149	GA	3	6	920467	920472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008149	GTAA	2	8	920496	920503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008149	CTTC	2	8	921093	921100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_008149	GAA	2	6	921102	921107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008149	T	6	6	923892	923897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008149	GTT	2	6	923938	923943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008149	TTAG	2	8	923963	923970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008149	ATG	2	6	924030	924035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008149	AG	3	6	924053	924058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008149	AGC	2	6	924284	924289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_008149	CT	3	6	924332	924337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_008149	CTTT	2	8	924359	924366	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_008149	TC	3	6	924375	924380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_008149	AAT	2	6	924446	924451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_008149	TGT	2	6	924501	924506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008149	GT	3	6	924505	924510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008149	CTT	2	6	924598	924603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3096	NC_008149	TCCC	2	8	924716	924723	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3097	NC_008149	ATT	2	6	924869	924874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008149	ACAA	2	8	925009	925016	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_008149	AAAC	2	8	925019	925026	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_008149	CGAGC	2	10	925196	925205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3101	NC_008149	TAA	2	6	925323	925328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008149	T	6	6	925367	925372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008149	TTAA	2	8	925413	925420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008149	TA	3	6	925438	925443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_008149	TAGT	2	8	925476	925483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_008149	GAT	3	9	928214	928222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_008149	TCA	2	6	928273	928278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_008149	A	6	6	928285	928290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008149	T	6	6	928308	928313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008149	GAG	2	6	928316	928321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_008149	TCAGTA	2	12	928849	928860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3112	NC_008149	T	6	6	928897	928902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008149	GGA	2	6	931562	931567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008149	TATT	2	8	931568	931575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008149	GAT	2	6	932832	932837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008149	TGA	2	6	932903	932908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008149	GGT	2	6	932940	932945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008149	GTT	2	6	935476	935481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_008149	TTA	2	6	935482	935487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008149	GGT	3	9	935760	935768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008149	CG	3	6	937130	937135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_008149	AT	3	6	937148	937153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008149	T	6	6	937591	937596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_008149	CAA	2	6	937714	937719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_008149	GGA	2	6	938293	938298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_008149	TATT	2	8	938299	938306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_008149	T	7	7	938316	938322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008149	A	6	6	938378	938383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008149	AAAT	2	8	938398	938405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_008149	AG	3	6	938449	938454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008149	CAC	2	6	938474	938479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_008149	TA	3	6	938482	938487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_008149	TGG	2	6	938494	938499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_008149	A	6	6	939284	939289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_008149	ACTT	2	8	939332	939339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_008149	TAAT	2	8	939360	939367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_008149	AAT	2	6	939420	939425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_008149	AATG	2	8	939491	939498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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