MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

< Previous12...21222324252627282930313233Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008149	ATT	2	6	4519967	4519972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_008149	A	6	6	4519986	4519991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_008149	TTA	2	6	4521912	4521917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_008149	TGAT	2	8	4521941	4521948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_008149	ATT	2	6	4521987	4521992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_008149	AAG	2	6	4522048	4522053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_008149	TAA	2	6	4522079	4522084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_008149	TAC	2	6	4523515	4523520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_008149	A	6	6	4523588	4523593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_008149	A	6	6	4523599	4523604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_008149	T	6	6	4523624	4523629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_008149	T	7	7	4523634	4523640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_008149	TAA	2	6	4523667	4523672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_008149	GAAA	2	8	4523707	4523714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_008149	CAT	2	6	4523762	4523767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_008149	AT	3	6	4523766	4523771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_008149	AAC	2	6	4523801	4523806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_008149	GGT	2	6	4523908	4523913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_008149	A	6	6	4523923	4523928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_008149	CAGT	2	8	4523932	4523939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16021	NC_008149	TAA	2	6	4523968	4523973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_008149	TATC	2	8	4524021	4524028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16023	NC_008149	AGAT	2	8	4524050	4524057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_008149	CGA	2	6	4525978	4525983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_008149	TAA	2	6	4526049	4526054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_008149	CTCC	2	8	4529081	4529088	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16027	NC_008149	AGT	2	6	4529892	4529897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_008149	TTG	2	6	4530749	4530754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_008149	TC	3	6	4531167	4531172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16030	NC_008149	TGAG	2	8	4531193	4531200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_008149	AGC	2	6	4531231	4531236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_008149	ATT	2	6	4531303	4531308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_008149	AAT	2	6	4531385	4531390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_008149	ATAA	2	8	4531417	4531424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_008149	AAC	2	6	4531527	4531532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_008149	ATA	2	6	4531570	4531575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_008149	CCAA	2	8	4531613	4531620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_008149	ATT	2	6	4531638	4531643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_008149	ACT	2	6	4531646	4531651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_008149	T	7	7	4531681	4531687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_008149	A	8	8	4531690	4531697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_008149	AAT	2	6	4531705	4531710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_008149	ACA	2	6	4531719	4531724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_008149	ACT	2	6	4531783	4531788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_008149	AAT	2	6	4531789	4531794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_008149	TTG	2	6	4531795	4531800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_008149	T	7	7	4531803	4531809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_008149	TGGGG	2	10	4534521	4534530	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_008149	TTAA	2	8	4534578	4534585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...21222324252627282930313233Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.