MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008149	GAT	2	6	3899754	3899759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_008149	CGC	2	6	3900584	3900589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_008149	CAG	2	6	3900590	3900595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_008149	AAG	2	6	3900921	3900926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_008149	TGA	2	6	3901013	3901018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_008149	CAT	2	6	3901096	3901101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_008149	ACCT	2	8	3901121	3901128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14008	NC_008149	ATC	2	6	3901145	3901150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_008149	CA	3	6	3901244	3901249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14010	NC_008149	CA	3	6	3901310	3901315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14011	NC_008149	A	6	6	3901318	3901323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_008149	ACC	2	6	3901454	3901459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_008149	GCC	2	6	3901468	3901473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14014	NC_008149	ACG	2	6	3901541	3901546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_008149	TC	4	8	3901554	3901561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14016	NC_008149	AC	3	6	3901641	3901646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14017	NC_008149	AGC	2	6	3901840	3901845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_008149	ACG	2	6	3901894	3901899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_008149	TGA	2	6	3901974	3901979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_008149	CCG	2	6	3902002	3902007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_008149	ACC	2	6	3902089	3902094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14022	NC_008149	AGCT	2	8	3902147	3902154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14023	NC_008149	CTC	2	6	3902208	3902213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_008149	GAG	2	6	3902227	3902232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_008149	CCA	2	6	3902252	3902257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14026	NC_008149	GGT	2	6	3902312	3902317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_008149	CAT	2	6	3902507	3902512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_008149	GCC	2	6	3902582	3902587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14029	NC_008149	TTA	2	6	3902708	3902713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_008149	CAGC	2	8	3902722	3902729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14031	NC_008149	TC	3	6	3902837	3902842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14032	NC_008149	ACC	2	6	3902867	3902872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14033	NC_008149	GTG	2	6	3902955	3902960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_008149	TCA	2	6	3902966	3902971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_008149	AGCCT	2	10	3903051	3903060	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14036	NC_008149	C	6	6	3903068	3903073	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14037	NC_008149	CAA	2	6	3903309	3903314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_008149	CTTT	2	8	3903403	3903410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14039	NC_008149	ATG	2	6	3903413	3903418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_008149	GCT	2	6	3903419	3903424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_008149	CTGT	2	8	3903443	3903450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14042	NC_008149	GTT	2	6	3903509	3903514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_008149	ACG	2	6	3903524	3903529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_008149	GT	3	6	3903546	3903551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_008149	TTC	2	6	3903566	3903571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_008149	TCGGT	2	10	3903755	3903764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14047	NC_008149	CAC	2	6	3903941	3903946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_008149	GTAC	2	8	3903966	3903973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14049	NC_008149	GTCA	2	8	3904049	3904056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14050	NC_008149	GGA	2	6	3904072	3904077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_008149	C	6	6	3904082	3904087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14052	NC_008149	AC	3	6	3904201	3904206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14053	NC_008149	CTC	2	6	3904227	3904232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14054	NC_008149	TCGC	2	8	3904238	3904245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14055	NC_008149	TCG	2	6	3904382	3904387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_008149	ATT	2	6	3904543	3904548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_008149	GA	3	6	3904550	3904555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_008149	CGG	2	6	3904592	3904597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_008149	TCA	2	6	3904912	3904917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_008149	TG	3	6	3904925	3904930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_008149	AGG	2	6	3904959	3904964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_008149	CTAC	2	8	3905057	3905064	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14063	NC_008149	GT	3	6	3905100	3905105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_008149	GT	3	6	3905269	3905274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_008149	ATG	2	6	3905294	3905299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_008149	TCC	2	6	3905320	3905325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14067	NC_008149	CCA	2	6	3905356	3905361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14068	NC_008149	CAA	2	6	3905373	3905378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_008149	GAC	2	6	3905434	3905439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_008149	GCA	2	6	3905446	3905451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_008149	TTC	2	6	3905522	3905527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_008149	GCC	2	6	3905765	3905770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_008149	TCC	2	6	3905785	3905790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14074	NC_008149	C	6	6	3905829	3905834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14075	NC_008149	TGCG	2	8	3905917	3905924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14076	NC_008149	GCT	2	6	3905975	3905980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_008149	CTT	2	6	3906000	3906005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_008149	TCC	2	6	3906049	3906054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14079	NC_008149	CTT	2	6	3906084	3906089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_008149	CA	3	6	3906090	3906095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_008149	CTG	2	6	3906143	3906148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_008149	TCG	2	6	3906218	3906223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_008149	CTA	2	6	3906246	3906251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_008149	AGT	2	6	3906343	3906348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_008149	CCG	2	6	3906392	3906397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14086	NC_008149	AGT	2	6	3906409	3906414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_008149	ACT	2	6	3906417	3906422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_008149	GCC	2	6	3906457	3906462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_008149	TTTG	2	8	3906504	3906511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_008149	AGC	2	6	3906537	3906542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_008149	ATT	2	6	3906627	3906632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_008149	CTGC	2	8	3906634	3906641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_008149	CA	3	6	3906675	3906680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14094	NC_008149	TTGG	2	8	3906723	3906730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_008149	ACT	2	6	3906773	3906778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_008149	TG	3	6	3906833	3906838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_008149	GATG	2	8	3906846	3906853	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_008149	T	7	7	3906872	3906878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_008149	T	6	6	3906888	3906893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_008149	CTG	2	6	3906903	3906908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_008149	CCAAGG	2	12	3909964	3909975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_008149	GTT	2	6	3909991	3909996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_008149	AAT	2	6	3911031	3911036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_008149	TCCT	2	8	3911145	3911152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_008149	ATC	2	6	3911184	3911189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_008149	TC	3	6	3911899	3911904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14107	NC_008149	TCGC	2	8	3911928	3911935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14108	NC_008149	CTTT	2	8	3912007	3912014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14109	NC_008149	GCAAA	2	10	3912059	3912068	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14110	NC_008149	CCG	2	6	3912072	3912077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_008149	CTTT	2	8	3912120	3912127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14112	NC_008149	TCC	2	6	3912168	3912173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14113	NC_008149	CCG	2	6	3912185	3912190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14114	NC_008149	CTTT	2	8	3912233	3912240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14115	NC_008149	TCC	2	6	3912281	3912286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14116	NC_008149	CCG	2	6	3912298	3912303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14117	NC_008149	AGC	2	6	3912398	3912403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_008149	CG	3	6	3912493	3912498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14119	NC_008149	CGG	2	6	3912553	3912558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_008149	CT	3	6	3912563	3912568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14121	NC_008149	TCC	2	6	3912637	3912642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14122	NC_008149	GCG	2	6	3912679	3912684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_008149	CGG	2	6	3912703	3912708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_008149	TTC	2	6	3915667	3915672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_008149	TGT	2	6	3915678	3915683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_008149	ATG	2	6	3915689	3915694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_008149	AAT	2	6	3916128	3916133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14129	NC_008149	GA	3	6	3916158	3916163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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