MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_008149	ATTA	2	8	2619317	2619324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_008149	AATAAA	2	12	2619347	2619358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_008149	G	6	6	2621139	2621144	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_008149	CTA	2	6	2621154	2621159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9505	NC_008149	GCA	2	6	2621179	2621184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_008149	ACTC	2	8	2621296	2621303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9507	NC_008149	TTA	2	6	2621312	2621317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_008149	GGGA	2	8	2621453	2621460	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_008149	CAA	3	9	2621465	2621473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_008149	AAT	2	6	2621487	2621492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9511	NC_008149	AAT	2	6	2622066	2622071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_008149	TAT	2	6	2622082	2622087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_008149	ATT	3	9	2622124	2622132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_008149	A	6	6	2622136	2622141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_008149	TAAA	2	8	2622174	2622181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_008149	AAAT	2	8	2622198	2622205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_008149	CAT	2	6	2622213	2622218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9518	NC_008149	ATT	2	6	2622232	2622237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_008149	TAA	2	6	2622284	2622289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_008149	AAG	2	6	2622419	2622424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_008149	AGTC	2	8	2622699	2622706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9522	NC_008149	TTA	2	6	2623691	2623696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_008149	CCGC	2	8	2623721	2623728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9524	NC_008149	TCAA	2	8	2623775	2623782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9525	NC_008149	GAT	2	6	2623785	2623790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_008149	CTCAC	2	10	2623812	2623821	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9527	NC_008149	TAA	2	6	2623873	2623878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9528	NC_008149	TTA	2	6	2623884	2623889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_008149	TGGG	2	8	2623952	2623959	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9530	NC_008149	AG	3	6	2623983	2623988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_008149	GAA	2	6	2624028	2624033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_008149	A	6	6	2624032	2624037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_008149	A	6	6	2624059	2624064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9534	NC_008149	ATC	3	9	2624085	2624093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9535	NC_008149	TTTCG	2	10	2624117	2624126	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9536	NC_008149	CGG	2	6	2624146	2624151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9537	NC_008149	T	6	6	2624153	2624158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_008149	AT	3	6	2624195	2624200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_008149	ATA	2	6	2624205	2624210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_008149	TA	3	6	2624209	2624214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_008149	AT	3	6	2624231	2624236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9542	NC_008149	TG	3	6	2624259	2624264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_008149	CGT	2	6	2624273	2624278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_008149	TCAC	2	8	2624288	2624295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9545	NC_008149	AAAT	2	8	2624311	2624318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_008149	CGC	2	6	2624361	2624366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9547	NC_008149	ATT	2	6	2624367	2624372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_008149	CAT	2	6	2624386	2624391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_008149	ATT	2	6	2626552	2626557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_008149	GTA	2	6	2626576	2626581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_008149	AG	3	6	2626597	2626602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_008149	ATTGA	2	10	2626649	2626658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_008149	AAC	2	6	2626710	2626715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9554	NC_008149	CAGC	2	8	2626738	2626745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9555	NC_008149	TGA	2	6	2627208	2627213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_008149	TA	3	6	2627975	2627980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_008149	GAT	2	6	2628006	2628011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_008149	TGGA	2	8	2629437	2629444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_008149	ATA	2	6	2629487	2629492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9560	NC_008149	A	6	6	2629526	2629531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_008149	CTT	3	9	2629560	2629568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9562	NC_008149	GCG	2	6	2629579	2629584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9563	NC_008149	ATGAG	2	10	2629587	2629596	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_008149	GAA	2	6	2629610	2629615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_008149	CTG	2	6	2629621	2629626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9566	NC_008149	TCG	2	6	2629658	2629663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9567	NC_008149	GC	3	6	2629682	2629687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9568	NC_008149	AAAT	2	8	2630941	2630948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9569	NC_008149	CAGC	2	8	2630961	2630968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9570	NC_008149	TATC	2	8	2630980	2630987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9571	NC_008149	AAC	2	6	2631024	2631029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_008149	CCTG	2	8	2631340	2631347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9573	NC_008149	CCA	2	6	2631361	2631366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9574	NC_008149	GAAA	2	8	2631439	2631446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9575	NC_008149	GCC	2	6	2633441	2633446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9576	NC_008149	GGC	2	6	2633451	2633456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9580	NC_008149	CATT	2	8	2633564	2633571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9581	NC_008149	A	7	7	2633574	2633580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9582	NC_008149	CCG	2	6	2633627	2633632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9583	NC_008149	T	6	6	2633901	2633906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_008149	TCC	2	6	2633908	2633913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9585	NC_008149	GGA	2	6	2633916	2633921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9586	NC_008149	TAT	2	6	2634024	2634029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9587	NC_008149	ATCA	2	8	2634090	2634097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9588	NC_008149	TAA	2	6	2634109	2634114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9589	NC_008149	T	7	7	2635505	2635511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9590	NC_008149	AAC	2	6	2635530	2635535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9591	NC_008149	AGGG	2	8	2635663	2635670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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9593	NC_008149	CGC	2	6	2635720	2635725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9594	NC_008149	CAA	2	6	2635737	2635742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9595	NC_008149	CCT	2	6	2636287	2636292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9596	NC_008149	TCA	2	6	2637875	2637880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9598	NC_008149	CT	3	6	2642294	2642299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9599	NC_008149	ATTG	2	8	2642303	2642310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9601	NC_008149	AAT	2	6	2645206	2645211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_008149	AAT	2	6	2645227	2645232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9603	NC_008149	ATTT	2	8	2645272	2645279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_008149	AATA	2	8	2645282	2645289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9605	NC_008149	A	7	7	2645300	2645306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9606	NC_008149	TATT	2	8	2645317	2645324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_008149	TAAA	2	8	2645334	2645341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_008149	TAT	2	6	2645368	2645373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9610	NC_008149	GGT	2	6	2645400	2645405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9611	NC_008149	T	7	7	2645405	2645411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_008149	CAG	2	6	2645459	2645464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9613	NC_008149	CCTC	2	8	2645467	2645474	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9614	NC_008149	GTT	2	6	2645505	2645510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_008149	TCTG	2	8	2646005	2646012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9616	NC_008149	CT	3	6	2646076	2646081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9617	NC_008149	ACC	2	6	2647487	2647492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9620	NC_008149	CGC	2	6	2647603	2647608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9621	NC_008149	TTGG	2	8	2647697	2647704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9622	NC_008149	T	6	6	2647804	2647809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9623	NC_008149	TA	3	6	2647840	2647845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_008149	ACC	2	6	2647847	2647852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9626	NC_008149	CGGCA	2	10	2647911	2647920	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9627	NC_008149	TGTC	2	8	2647955	2647962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9628	NC_008149	ATG	2	6	2647969	2647974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9630	NC_008149	ATTT	2	8	2648038	2648045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9631	NC_008149	T	6	6	2648043	2648048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9632	NC_008149	AAAT	2	8	2648058	2648065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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