MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_008149	TCA	2	6	2341741	2341746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_008149	CGTT	2	8	2341773	2341780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8503	NC_008149	G	6	6	2341853	2341858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_008149	GTTT	2	8	2341872	2341879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_008149	TTC	3	9	2341882	2341890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_008149	TAA	2	6	2344382	2344387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_008149	ATT	2	6	2344404	2344409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_008149	AGC	2	6	2344426	2344431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_008149	TTG	2	6	2344435	2344440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_008149	GT	3	6	2345541	2345546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_008149	CAT	2	6	2345594	2345599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_008149	ATG	2	6	2346367	2346372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_008149	CAA	2	6	2346373	2346378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_008149	CAT	2	6	2346422	2346427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_008149	ATT	2	6	2347129	2347134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_008149	TTA	2	6	2347567	2347572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_008149	T	6	6	2347686	2347691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_008149	TCT	2	6	2347872	2347877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_008149	AT	3	6	2347882	2347887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_008149	A	6	6	2347903	2347908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_008149	A	6	6	2347913	2347918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_008149	TAA	2	6	2347979	2347984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_008149	AGA	2	6	2347995	2348000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_008149	AAGC	2	8	2348018	2348025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8525	NC_008149	GCTT	2	8	2348044	2348051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8526	NC_008149	CGC	2	6	2350323	2350328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8527	NC_008149	TGC	2	6	2350417	2350422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_008149	AAT	2	6	2350445	2350450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_008149	TCC	2	6	2350453	2350458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8530	NC_008149	ATT	2	6	2350476	2350481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_008149	ATCT	2	8	2350526	2350533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8532	NC_008149	CTC	2	6	2350555	2350560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8533	NC_008149	A	6	6	2350638	2350643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_008149	TTA	3	9	2350657	2350665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_008149	A	7	7	2350675	2350681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_008149	T	7	7	2350741	2350747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_008149	TAG	2	6	2350774	2350779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_008149	TTG	2	6	2350786	2350791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_008149	GTA	2	6	2350834	2350839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_008149	CCA	2	6	2350889	2350894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8541	NC_008149	GCT	2	6	2350955	2350960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_008149	CGTC	2	8	2351233	2351240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8543	NC_008149	TTC	2	6	2351273	2351278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_008149	CTGC	2	8	2351328	2351335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8545	NC_008149	CAA	3	9	2351407	2351415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_008149	ATA	2	6	2359546	2359551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_008149	GGTC	2	8	2359572	2359579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8548	NC_008149	GCAC	2	8	2359625	2359632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8549	NC_008149	ACTT	2	8	2359644	2359651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8550	NC_008149	GCTG	2	8	2359676	2359683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8551	NC_008149	GCCTC	2	10	2361423	2361432	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8552	NC_008149	TA	4	8	2361448	2361455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_008149	AAT	2	6	2361458	2361463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_008149	TGC	2	6	2361475	2361480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_008149	T	7	7	2361489	2361495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_008149	AAT	2	6	2361518	2361523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_008149	AAG	2	6	2361526	2361531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_008149	AG	3	6	2361565	2361570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_008149	TGA	2	6	2361573	2361578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_008149	ATA	2	6	2361641	2361646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_008149	A	6	6	2361678	2361683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8563	NC_008149	A	6	6	2361746	2361751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_008149	AAAT	2	8	2361760	2361767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_008149	A	7	7	2361768	2361774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_008149	AAT	2	6	2361786	2361791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_008149	A	6	6	2361797	2361802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_008149	ATTT	2	8	2361827	2361834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_008149	T	6	6	2361832	2361837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_008149	A	6	6	2361882	2361887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_008149	GAA	2	6	2361944	2361949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8575	NC_008149	ATA	3	9	2363118	2363126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_008149	TCG	2	6	2365793	2365798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8580	NC_008149	GTT	2	6	2365935	2365940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8582	NC_008149	A	6	6	2366078	2366083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_008149	AATT	2	8	2366131	2366138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8588	NC_008149	GC	3	6	2366255	2366260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8589	NC_008149	ATT	2	6	2366278	2366283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8592	NC_008149	GA	3	6	2366388	2366393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_008149	ACAG	2	8	2366394	2366401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8594	NC_008149	CTC	2	6	2366469	2366474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8597	NC_008149	GGA	2	6	2366557	2366562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8599	NC_008149	TACA	2	8	2367710	2367717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8600	NC_008149	CCGC	2	8	2368697	2368704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8601	NC_008149	TAAA	2	8	2368736	2368743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_008149	AG	3	6	2368761	2368766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_008149	ATT	2	6	2368844	2368849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_008149	CCG	2	6	2369980	2369985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8609	NC_008149	TCA	2	6	2373580	2373585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_008149	ATAA	2	8	2373638	2373645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_008149	CAG	2	6	2373664	2373669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_008149	TTG	2	6	2374937	2374942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_008149	CAA	2	6	2375003	2375008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_008149	CTG	2	6	2375015	2375020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_008149	TAAT	2	8	2375032	2375039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8617	NC_008149	ATT	2	6	2375073	2375078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_008149	T	6	6	2375077	2375082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_008149	AAT	2	6	2375112	2375117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_008149	CAAA	2	8	2375118	2375125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8621	NC_008149	ATC	2	6	2375147	2375152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8622	NC_008149	ATT	2	6	2375196	2375201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_008149	CAG	2	6	2375204	2375209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8624	NC_008149	CGG	2	6	2375226	2375231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8625	NC_008149	CGGTGA	2	12	2375281	2375292	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8626	NC_008149	A	6	6	2375298	2375303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_008149	TTA	2	6	2375327	2375332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_008149	TAA	2	6	2375383	2375388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_008149	AAT	2	6	2375429	2375434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_008149	GAAA	2	8	2376279	2376286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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