MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008149	CT	3	6	2207954	2207959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_008149	TTA	2	6	2211655	2211660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_008149	A	6	6	2211664	2211669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_008149	CGG	2	6	2211766	2211771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_008149	TCA	2	6	2211852	2211857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_008149	CA	3	6	2211897	2211902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8007	NC_008149	TTA	2	6	2211903	2211908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_008149	CAT	2	6	2211923	2211928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_008149	T	7	7	2211993	2211999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_008149	TCT	2	6	2212057	2212062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_008149	GAC	2	6	2212078	2212083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_008149	TTA	2	6	2215996	2216001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_008149	TC	3	6	2216032	2216037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_008149	CTGT	2	8	2216094	2216101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8015	NC_008149	CGA	2	6	2216102	2216107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_008149	AT	3	6	2216126	2216131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_008149	AAGG	2	8	2216154	2216161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_008149	ATA	2	6	2216164	2216169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_008149	T	7	7	2216181	2216187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_008149	ATTA	2	8	2216208	2216215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_008149	AAAT	2	8	2216216	2216223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_008149	CAA	2	6	2216241	2216246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_008149	AAT	2	6	2216272	2216277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_008149	TTAA	2	8	2216280	2216287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_008149	AATGTT	2	12	2216313	2216324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_008149	GT	3	6	2217133	2217138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_008149	AT	3	6	2217201	2217206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_008149	CTTT	2	8	2217250	2217257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_008149	CAT	2	6	2219926	2219931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_008149	TCA	2	6	2220013	2220018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_008149	GACGCT	2	12	2220027	2220038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_008149	AGG	2	6	2220077	2220082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_008149	T	6	6	2220698	2220703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_008149	TCAA	2	8	2220709	2220716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_008149	GGT	2	6	2220791	2220796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_008149	TGC	2	6	2220801	2220806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_008149	ATT	2	6	2220813	2220818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_008149	GT	3	6	2225226	2225231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_008149	GCT	2	6	2225309	2225314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_008149	AAT	2	6	2225374	2225379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_008149	T	7	7	2226006	2226012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_008149	TTG	2	6	2226082	2226087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_008149	ACC	2	6	2226484	2226489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_008149	A	7	7	2226622	2226628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_008149	AGC	2	6	2226646	2226651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_008149	GCT	2	6	2226666	2226671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_008149	T	6	6	2226698	2226703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_008149	TATT	2	8	2226793	2226800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_008149	AATGT	2	10	2226804	2226813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_008149	AAAAT	2	10	2226827	2226836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_008149	T	7	7	2226846	2226852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_008149	T	6	6	2226856	2226861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_008149	TCAC	2	8	2226873	2226880	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_008149	A	6	6	2226908	2226913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_008149	A	6	6	2226920	2226925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_008149	AT	3	6	2227004	2227009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_008149	TCT	2	6	2227063	2227068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_008149	ATT	2	6	2227089	2227094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_008149	T	6	6	2227093	2227098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_008149	ACC	2	6	2227285	2227290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_008149	TAAAT	2	10	2227300	2227309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_008149	TAA	2	6	2227323	2227328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_008149	ACT	2	6	2227375	2227380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_008149	AAAT	2	8	2227405	2227412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_008149	AC	4	8	2227462	2227469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8066	NC_008149	TTC	2	6	2230293	2230298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_008149	TAGC	2	8	2230314	2230321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8068	NC_008149	ATT	2	6	2230343	2230348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_008149	GCC	2	6	2230374	2230379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_008149	GA	3	6	2230412	2230417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_008149	AAC	2	6	2230505	2230510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_008149	ATA	2	6	2230558	2230563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_008149	ATT	2	6	2230569	2230574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_008149	TATT	2	8	2230612	2230619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_008149	TTAA	2	8	2230622	2230629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_008149	TC	3	6	2231339	2231344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_008149	AAT	2	6	2231350	2231355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_008149	AAT	2	6	2231365	2231370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_008149	AAT	2	6	2231391	2231396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_008149	TA	3	6	2231435	2231440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_008149	CA	3	6	2231507	2231512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_008149	GATA	2	8	2231525	2231532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_008149	GGC	2	6	2231550	2231555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_008149	CAA	2	6	2231572	2231577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_008149	GGA	2	6	2231625	2231630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_008149	ATA	2	6	2231655	2231660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_008149	TGC	2	6	2231745	2231750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_008149	GCAA	2	8	2231763	2231770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8089	NC_008149	AG	3	6	2231780	2231785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_008149	CTTGC	2	10	2231795	2231804	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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8092	NC_008149	ATA	2	6	2231933	2231938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_008149	ATT	2	6	2231964	2231969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_008149	ATT	2	6	2231979	2231984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_008149	TC	3	6	2231985	2231990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8096	NC_008149	GCA	2	6	2232075	2232080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_008149	TGA	2	6	2232128	2232133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_008149	CTG	2	6	2232156	2232161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_008149	CTA	2	6	2232206	2232211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_008149	TTA	2	6	2232263	2232268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_008149	ATT	2	6	2232327	2232332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_008149	AAT	2	6	2232394	2232399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_008149	CCCT	2	8	2232426	2232433	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8104	NC_008149	TTG	2	6	2234207	2234212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_008149	GGA	2	6	2234300	2234305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_008149	TCC	2	6	2234320	2234325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_008149	T	6	6	2234328	2234333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_008149	GTA	2	6	2234603	2234608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_008149	TTA	2	6	2234689	2234694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_008149	TTA	2	6	2234707	2234712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_008149	ACAG	2	8	2234729	2234736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8112	NC_008149	A	6	6	2234738	2234743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_008149	T	7	7	2234758	2234764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_008149	A	6	6	2235013	2235018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_008149	GCC	2	6	2235023	2235028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_008149	TAAAA	2	10	2235252	2235261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_008149	T	6	6	2235348	2235353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_008149	AG	3	6	2235407	2235412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_008149	ATG	2	6	2235442	2235447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_008149	G	7	7	2238729	2238735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_008149	C	7	7	2238767	2238773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8122	NC_008149	TGT	2	6	2238852	2238857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_008149	T	7	7	2238924	2238930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_008149	CT	3	6	2238963	2238968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_008149	T	6	6	2239002	2239007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_008149	ATC	2	6	2239041	2239046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_008149	ATC	2	6	2239067	2239072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_008149	CAT	2	6	2239085	2239090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_008149	CGCCA	2	10	2239102	2239111	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8130	NC_008149	TAT	2	6	2240149	2240154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_008149	CAG	2	6	2240155	2240160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8133	NC_008149	AAT	2	6	2240175	2240180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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