MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 16049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008149	CCA	2	6	1395886	1395891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_008149	CGT	2	6	1398326	1398331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_008149	GCA	2	6	1398434	1398439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_008149	GCC	2	6	1398483	1398488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_008149	ATA	3	9	1398519	1398527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008149	TA	3	6	1398561	1398566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008149	AAATGT	2	12	1398645	1398656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008149	TAA	2	6	1399960	1399965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_008149	TA	3	6	1399966	1399971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008149	TCTCT	2	10	1400008	1400017	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5011	NC_008149	TGAA	2	8	1400118	1400125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008149	AGG	2	6	1400200	1400205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008149	TG	3	6	1400222	1400227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008149	CCAT	2	8	1400304	1400311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_008149	TGC	2	6	1400327	1400332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_008149	GGTATA	2	12	1400442	1400453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008149	TTAG	2	8	1400455	1400462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008149	GGC	2	6	1401735	1401740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_008149	CCT	2	6	1401755	1401760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_008149	AAT	2	6	1401817	1401822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008149	C	6	6	1401853	1401858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5022	NC_008149	ATT	2	6	1401880	1401885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008149	GTC	2	6	1401974	1401979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_008149	TTC	2	6	1402022	1402027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_008149	TG	3	6	1402060	1402065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008149	TGGC	2	8	1402123	1402130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_008149	TCC	2	6	1402729	1402734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_008149	CCA	2	6	1402748	1402753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_008149	TGG	2	6	1402757	1402762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008149	A	6	6	1402825	1402830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008149	AAC	3	9	1402913	1402921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_008149	ATT	2	6	1402922	1402927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_008149	GCT	2	6	1402954	1402959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_008149	T	6	6	1402976	1402981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_008149	A	6	6	1402999	1403004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_008149	GGA	2	6	1403034	1403039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008149	GGA	2	6	1403069	1403074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008149	TGA	2	6	1405620	1405625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008149	ATC	2	6	1405626	1405631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_008149	TTAT	2	8	1405633	1405640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008149	ATTC	2	8	1405664	1405671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_008149	AGT	2	6	1405685	1405690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008149	T	6	6	1405690	1405695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008149	A	7	7	1407475	1407481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008149	TAAT	2	8	1409252	1409259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_008149	ATA	2	6	1409292	1409297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008149	GAC	2	6	1411647	1411652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_008149	TA	4	8	1411656	1411663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008149	TTA	2	6	1411666	1411671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008149	GGC	2	6	1411725	1411730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008149	CAAC	2	8	1411785	1411792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_008149	GTT	2	6	1411843	1411848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008149	GCT	2	6	1412177	1412182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008149	TGTT	2	8	1412198	1412205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008149	CT	3	6	1412217	1412222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_008149	ACA	2	6	1412263	1412268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_008149	TAA	2	6	1412829	1412834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008149	A	6	6	1412833	1412838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_008149	ATTA	2	8	1412856	1412863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008149	AGCA	2	8	1412899	1412906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_008149	GCA	2	6	1412945	1412950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_008149	CCT	2	6	1412997	1413002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_008149	TGAT	2	8	1413033	1413040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_008149	ACTG	2	8	1415575	1415582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_008149	T	6	6	1415599	1415604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_008149	ATT	2	6	1415632	1415637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008149	CGC	2	6	1415643	1415648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_008149	ATA	2	6	1415691	1415696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_008149	ATTGA	2	10	1417015	1417024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_008149	TCT	2	6	1417063	1417068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_008149	CTG	2	6	1418084	1418089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_008149	TC	3	6	1418212	1418217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_008149	A	6	6	1418293	1418298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_008149	T	6	6	1418361	1418366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_008149	GAT	2	6	1421683	1421688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_008149	A	6	6	1421754	1421759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_008149	ATT	2	6	1421801	1421806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_008149	ATTT	2	8	1421822	1421829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_008149	TTTA	2	8	1421891	1421898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_008149	AAGTG	2	10	1421902	1421911	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_008149	CAAC	2	8	1421918	1421925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_008149	TAA	2	6	1421948	1421953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008149	T	8	8	1421999	1422006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_008149	T	7	7	1422009	1422015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008149	AG	3	6	1422025	1422030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_008149	T	6	6	1422052	1422057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008149	TAA	2	6	1422162	1422167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_008149	ATC	2	6	1422185	1422190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_008149	CAA	2	6	1422209	1422214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_008149	AGG	2	6	1426632	1426637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008149	AAT	2	6	1426647	1426652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008149	A	7	7	1426690	1426696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008149	ATT	2	6	1426706	1426711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008149	A	6	6	1426719	1426724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_008149	AT	3	6	1426732	1426737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008149	ATTT	2	8	1426753	1426760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008149	TGT	2	6	1426773	1426778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_008149	TTG	2	6	1426785	1426790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008149	ATT	2	6	1426801	1426806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_008149	ATT	2	6	1426811	1426816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008149	A	6	6	1426830	1426835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_008149	TTA	2	6	1426836	1426841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008149	ATA	2	6	1426847	1426852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_008149	T	7	7	1426858	1426864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_008149	T	7	7	1426869	1426875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008149	ATA	2	6	1427176	1427181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_008149	ATTT	2	8	1427183	1427190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_008149	TAA	2	6	1427192	1427197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_008149	A	7	7	1427196	1427202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008149	ATT	2	6	1427214	1427219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008149	ATT	2	6	1427279	1427284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_008149	AAT	2	6	1427285	1427290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_008149	TA	4	8	1427302	1427309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008149	A	7	7	1429757	1429763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008149	ATT	2	6	1429776	1429781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008149	T	9	9	1429865	1429873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008149	ATT	2	6	1429936	1429941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_008149	CAT	2	6	1429959	1429964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_008149	GCCA	2	8	1429986	1429993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_008149	G	6	6	1430533	1430538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_008149	CTG	2	6	1430638	1430643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_008149	TAT	2	6	1430652	1430657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_008149	TAT	2	6	1430668	1430673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008149	AGCGC	2	10	1430707	1430716	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5125	NC_008149	AAC	2	6	1430727	1430732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_008149	GATT	2	8	1431953	1431960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_008149	TTG	2	6	1431994	1431999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_008149	TGA	2	6	1432033	1432038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008149	AT	3	6	1432075	1432080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_008149	ATG	2	6	1433877	1433882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_008149	TGT	2	6	1433899	1433904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_008149	ACAG	2	8	1435101	1435108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5393	NC_008149	GGC	2	6	1528394	1528399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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